轉(zhuǎn)錄組學(xué)：轉(zhuǎn)錄組學(xué)是研究特定的細(xì)胞,、組織或個(gè)體在特定時(shí)間和狀態(tài)下所轉(zhuǎn)錄出所有RNA的學(xué)科,，轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是指利用高通量測(cè)序方法，研究特定的細(xì)胞,、組織或個(gè)體在特定時(shí)間和狀態(tài)下所轉(zhuǎn)錄出的所有mRNA,，用于揭示不同功能狀態(tài)下的基因表達(dá),、結(jié)構(gòu)的差異，闡明分子機(jī)制,。應(yīng)用領(lǐng)域：醫(yī)學(xué)研究：疾病標(biāo)志物篩查,、疾病的診斷和分型、疾病復(fù)發(fā)診斷,、病因與病理機(jī)制探究,、臨床療效評(píng)價(jià)、藥物毒理學(xué)評(píng)價(jià),。生命科學(xué)研究：非生物環(huán)境關(guān)系研究,、植物與微生物,、在表型鑒定中的應(yīng)用、代謝途徑及功能基因組研究,、藥用植物研究中的應(yīng)用,。轉(zhuǎn)錄組學(xué)可應(yīng)用于基因點(diǎn)突變及多態(tài)性檢測(cè)。深圳轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析

circRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)成環(huán)機(jī)制：circRNA環(huán)化方式分為內(nèi)含子環(huán)化和外顯子環(huán)化,。目前主流的成環(huán)機(jī)制可歸類(lèi)為：依賴(lài)于剪切體的索尾插接環(huán)化,。在mRNA前體上，通過(guò)連續(xù)的組裝小核核糖體蛋白從而催化外顯子下游的5′供體的位點(diǎn)連接到上游的3′受體的位點(diǎn),，索尾插接形成環(huán)化,，然后通過(guò)剪切形成circRNA。順式作用元件促進(jìn)circRNA形成,。部分circRNA外顯子兩側(cè)的內(nèi)含子中含有反向互補(bǔ)序列,，首先在剪切位點(diǎn)上并排形成RNA雙鏈體，再通過(guò)可變剪切形成帶內(nèi)含子和不帶內(nèi)含子兩種不同的circRNA,?；蛘咄怙@子內(nèi)部以及兩側(cè)的內(nèi)含子可以競(jìng)爭(zhēng)進(jìn)行RNA配對(duì)，然后通過(guò)可變剪切形成不同類(lèi)型的circRNA,。四川宏轉(zhuǎn)錄學(xué)組轉(zhuǎn)錄組學(xué)可以直接測(cè)定每個(gè)轉(zhuǎn)錄本單核苷酸分辨率的準(zhǔn)確度,。

全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?yàn)槭裁葱枰獦?gòu)建兩個(gè)文庫(kù)？全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序需要構(gòu)建2個(gè)測(cè)序文庫(kù),，一個(gè)小RNA文庫(kù)和一個(gè)去除核糖體RNA的鏈特異性文庫(kù),，然后分別上機(jī)測(cè)序。小RNA長(zhǎng)度較短,，一般小于50nt,，采用測(cè)序策略為50SE。其他三類(lèi)RNA序列一般大于200,，通常在1000以上,，可達(dá)幾萬(wàn)，通過(guò)片段化構(gòu)建150PE測(cè)序文庫(kù),。然后小RNA文庫(kù)可以獲得miRNA序列信息,，去核糖體的鏈特異性文庫(kù)可以獲得mRNA、lncRNA和circRNA的序列信息,。轉(zhuǎn)錄組學(xué)即特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄出來(lái)的所有RNA的總和,，包括mRNA和非編碼RNA。

宏轉(zhuǎn)錄學(xué)組概念：宏轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是對(duì)某一特定時(shí)期,、特定環(huán)境樣品中的全部微生物的RNA進(jìn)行高通量測(cè)序,，直接獲得該環(huán)境中所有微生物轉(zhuǎn)錄組信息的一種測(cè)序技術(shù)的新應(yīng)用。宏轉(zhuǎn)錄組中不只包含有微生物的物種信息,，還有微生物的基因表達(dá)信息,。如果說(shuō)宏基因組能告訴我們微生物群,，那么宏轉(zhuǎn)錄組則能告訴我們這些微生物，這有助于挖掘微生物功能基因和探索微生物與環(huán)境,、疾病,、動(dòng)植物等關(guān)系的機(jī)制。宏轉(zhuǎn)錄組分析：從以G為單位的高通量測(cè)序數(shù)據(jù)中獲取研究所需的微生物種類(lèi),、基因,、通路等信息是進(jìn)行宏轉(zhuǎn)錄組研究必須經(jīng)歷的一步。現(xiàn)在網(wǎng)絡(luò)上分析組學(xué)數(shù)據(jù)的工具五花八門(mén),。能否從眾多組學(xué)工具中選擇出適合分析宏轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的軟件,，能否搭建一套完整、快速,、高效,、靈敏、高精確的宏轉(zhuǎn)錄組分析pipline,，直接關(guān)乎到后期數(shù)據(jù)分析的進(jìn)行,。普通轉(zhuǎn)錄組測(cè)序主要適用于不同的環(huán)境、藥物,、病原菌等逆境脅迫處理,。

轉(zhuǎn)錄組學(xué)：隨著越來(lái)越多的基因組序列相繼被測(cè)定,生命科學(xué)的研究進(jìn)入了后基因組時(shí)代,各類(lèi)組學(xué)技術(shù)得到迅速地發(fā)展與普遍地應(yīng)用包括以基因?yàn)檠芯繉?duì)象的基因組學(xué)(Genomics)、以轉(zhuǎn)錄過(guò)程為研究對(duì)象的轉(zhuǎn)錄組學(xué)(Transcriptomics),。意義：1．轉(zhuǎn)錄組譜可以提供特定條件下某些基因表達(dá)的信息,并據(jù)此推斷相應(yīng)未知基因的功能,揭示特定調(diào)節(jié)基因的作用機(jī)制.2．通過(guò)基于基因表達(dá)譜的分子標(biāo)簽,不只可以辨別細(xì)胞的表型歸屬,還可以用于疾病的診斷.3．轉(zhuǎn)錄組的研究應(yīng)用于臨床的另一個(gè)例子是可以將表面上看似相同的病癥分為多個(gè)亞型,尤其是對(duì)原發(fā)性惡性瘤,通過(guò)轉(zhuǎn)錄組差異表達(dá)譜的建立,可以詳細(xì)描繪出患者的生存期以及對(duì)藥物的反應(yīng)等,。普通轉(zhuǎn)錄組學(xué)測(cè)序適用于哪些情況？湖北高通量轉(zhuǎn)錄組學(xué)定量分析

轉(zhuǎn)錄組學(xué)測(cè)序包括mRNA和非編碼RNA,。深圳轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析

RNA-seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)：也被稱(chēng)為整個(gè)轉(zhuǎn)錄組鳥(niǎo)測(cè)序（wts）,。RNA-seq包含三個(gè)步驟：測(cè)序文庫(kù)的建立，在特定平臺(tái)中測(cè)序和生物信息學(xué)分析,。RNA-Seq是一種基于NGS技術(shù)的新的轉(zhuǎn)錄分析方法,。采用NGS技術(shù)對(duì)從感興趣的RNA樣本序列反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA進(jìn)行測(cè)序。簡(jiǎn)而言之,，就是對(duì)剪切變體、轉(zhuǎn)錄后RNA編輯,、內(nèi)含子表達(dá)水平和特定等位基因的表達(dá)情況進(jìn)行定性和定量分析,。RNA-Seq原理：在對(duì)基因組測(cè)序和分析研究的同時(shí)，復(fù)雜的轉(zhuǎn)錄組研究也普遍發(fā)展起來(lái),。利用高通量測(cè)序技術(shù)平臺(tái)分析轉(zhuǎn)錄組的結(jié)構(gòu)和表達(dá)水平情況,，更能挖掘未知轉(zhuǎn)錄本和稀有轉(zhuǎn)錄本信息，精確地識(shí)別RNA的選擇性剪切以及編碼序列的單核苷酸多態(tài)性（SPN）,，進(jìn)一步解析復(fù)雜的轉(zhuǎn)錄組信息,。深圳轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析

上海拜譜生物科技有限公司位于東川路555號(hào)丙樓1171室,。拜譜生物致力于為客戶(hù)提供良好的多組學(xué)服務(wù)，質(zhì)譜檢測(cè),，蛋白質(zhì)組學(xué),，代謝組學(xué)，一切以用戶(hù)需求為中心,，深受廣大客戶(hù)的歡迎,。公司從事商務(wù)服務(wù)多年，有著創(chuàng)新的設(shè)計(jì),、強(qiáng)大的技術(shù),，還有一批**的專(zhuān)業(yè)化的隊(duì)伍，確保為客戶(hù)提供良好的產(chǎn)品及服務(wù),。拜譜生物秉承“客戶(hù)為尊,、服務(wù)為榮、創(chuàng)意為先,、技術(shù)為實(shí)”的經(jīng)營(yíng)理念,，全力打造公司的重點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)力。