10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組的實現(xiàn)原理是什么,？10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫構(gòu)建的每張載玻片上有四個捕獲區(qū)域，每個捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm,，包含5000個被條形碼標(biāo)記的點（barcoded spots）,，每個點的直徑為55 μm，點和點之間中心的距離為100 μm,，并且每個點都有一個barcode序列,。組織切片的細(xì)胞中會釋放出mRNA，遷移到每個spot的mRNA會被標(biāo)記上相應(yīng)的barcode序列,，然后進行文庫構(gòu)建并進行測序,。根據(jù)數(shù)據(jù)的條形碼信息對數(shù)據(jù)進行分析，以確定哪些數(shù)據(jù)來自哪個位置,，從而實現(xiàn)空間基因表達的可視化,。 10x Genomics公司宣布了新一代FFPE空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化解決方案。湖北應(yīng)用空間轉(zhuǎn)錄組

1. 空間轉(zhuǎn)錄組是一種用于從空間層面上解析RNA-seq數(shù)據(jù)的技術(shù),，從而解析單個組織切片中的所有mRNA,。空間轉(zhuǎn)錄組的條形碼逆轉(zhuǎn)錄oligo(dT)引物在顯微鏡載玻片表面的有序附著,，空間轉(zhuǎn)錄組使得在mRNA樣品處理和后續(xù)測序過程中位置信息的編碼和獲取成為可能,。單細(xì)胞RNA測序或組織樣本RNA測序，均無法為研究人員提供精確的空間信息,。通過空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)可獲取組織中具體的位置的轉(zhuǎn)錄信息,，為研究和診斷提供有效數(shù)據(jù)支撐。10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)可以應(yīng)用于免疫,、發(fā)育,、神經(jīng)和病理等研究方向。廣西運用空間轉(zhuǎn)錄組空間轉(zhuǎn)錄組細(xì)胞通訊分析方法簡介及實操。

Visium空間轉(zhuǎn)錄組能夠做何種組織類型以及推薦切片厚度是什么,？10X Genomics測試過很多組織類型,，絕大多數(shù)都可以用于空間轉(zhuǎn)錄組的分析。下圖是他們官網(wǎng)上測試過的組織類型的列表,，測試過的組織都可以運用在空間轉(zhuǎn)錄組的分析上面,。但建議用戶用基因表達玻片做正式實驗前，務(wù)必用組織優(yōu)化的玻片測試一下,，看組織能否用于空間轉(zhuǎn)錄組的實驗,，同時也找到比較好的組織通透時間。切片厚度基本上以10μm為主,，但也有少量組織例外,。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗，致力通過質(zhì)量的服務(wù),，助力各位科研工作者取得新的突破,。

基于原位測序的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)?；谠粶y序（ISS）的方法通過測序產(chǎn)生空間轉(zhuǎn)錄組信息,，這種方法只依靠連接酶連接兩段DNA—一段已知序列的引物和一個探針與模板匹配，不匹配的探針就會被洗掉,。2013年開發(fā)的ISS中,，每個探針使用一個查詢堿基來測序基因條形碼。FISSEQ和后來的EXeq使用了SOLiD,，每個探針使用兩個查詢堿基來測序環(huán)化和RCA擴增的cDNAs,。在STARmap中，基因條形碼由SEDAL測序,，其中還使用了兩個類似固體的查詢堿基來避免錯誤,。BARseq還用基因條形碼放大了RCA探針?；贗SS技術(shù)的優(yōu)勢包括：單細(xì)胞分辨率,、亞細(xì)胞轉(zhuǎn)錄物定位和可應(yīng)用于更大的組織區(qū)域。缺點是：檢測效率較低,?？臻g轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果為未來人類心臟發(fā)育的研究提供重要的借鑒意義。

高通量空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)的處理和分析需要新穎的方法和工具支撐,，尤其是在預(yù)處理,、scRNA-seq 數(shù)據(jù)的空間重構(gòu)、基于微陣列數(shù)據(jù)的細(xì)胞類型去卷積,、空間高變基因的識別,、細(xì)胞間相互作用的推導(dǎo)等,。scRNA-seq 技術(shù)的進步啟發(fā)了利用高分辨率轉(zhuǎn)錄組定量分析與空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)的互補性質(zhì)的新方法。對于未進行轉(zhuǎn)錄組測序的 smFISH 和 ISS 數(shù)據(jù),，可通過 scRNA-seq 數(shù)據(jù)估算空間數(shù)據(jù)中未分析的基因的表達模式,。此外，“空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)”這一術(shù)語的變體,，也用于描述將轉(zhuǎn)錄本定位到細(xì)胞器的技術(shù)（例如 APEX-seq）,，盡管該技術(shù)沒有記錄任何空間坐標(biāo)。10X Visium空間轉(zhuǎn)錄組的實驗主要分為兩部分：組織學(xué)板塊和組學(xué)板塊,。發(fā)展空間轉(zhuǎn)錄組報價

10X Genomics 繼單細(xì)胞測序后也推出了空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),。湖北應(yīng)用空間轉(zhuǎn)錄組

中國銷售產(chǎn)業(yè)憑借獨特資源和市場優(yōu)勢，一舉成為資本角逐的重點領(lǐng)域之一,。從世界范圍來看,，美、歐,、日等發(fā)達地區(qū)的銷售產(chǎn)業(yè)發(fā)展歷史悠久,，無論是銷售產(chǎn)品制造業(yè)還是銷售服務(wù)業(yè)，都處于全球優(yōu)先地位,。國外的谷歌,、蘋果等公司，國內(nèi)的阿里巴巴,、騰訊、萬科,、保利,、平安人壽、萬達等企業(yè)都根據(jù)自身優(yōu)勢扎根大健康領(lǐng)域,。拋開服務(wù)型的公共服務(wù)屬性,，在市場環(huán)境中，企業(yè)競爭的秘訣是要創(chuàng)造稀缺,，結(jié)合消費者高,、中、低不同等級的需求,，并成為難以替代的產(chǎn)品,。一體化的結(jié)構(gòu)體系難以形成，我國醫(yī)藥健康正處于初級發(fā)展階段,，與體系健全的發(fā)達地區(qū)相比,，冷鏈物流行業(yè)呈現(xiàn)規(guī)模小且分布雜亂的現(xiàn)象。醫(yī)藥行業(yè)上下游未整體規(guī)劃,，成為我國冷鏈物流發(fā)展的障礙,，從而使得醫(yī)藥冷鏈物流流通效率低下,。在未來兩三年內(nèi)，主要科研服務(wù),，科研檢測,，學(xué)術(shù)研究，技術(shù)咨詢公司和醫(yī)藥服務(wù)提供公司總收入中的2%至3％將來自“服務(wù)+”模式,。隨著業(yè)務(wù)模式向“平臺即服務(wù)”和“數(shù)據(jù)即服務(wù)”的轉(zhuǎn)變,， “讓數(shù)據(jù)說話”將成為創(chuàng)新的新源泉。湖北應(yīng)用空間轉(zhuǎn)錄組

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