空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)原理是什么,？當組織冷凍切片附在空間轉(zhuǎn)錄組載片上時，條形碼引物結(jié)合并從組織中捕獲鄰近的mRNA,。被捕獲的mRNA開始逆轉(zhuǎn)錄,，得到的cDNA中包含了空間條形碼,。分析Illumina測序結(jié)果中空間條形碼的序列,，可以將每個mRNA轉(zhuǎn)錄的序列映射回組織切片中的起始位置?？臻g轉(zhuǎn)錄組的條形碼逆轉(zhuǎn)錄oligo(dT)引物在顯微鏡載玻片表面的有序附著,，空間轉(zhuǎn)錄組使得在mRNA樣品處理和后續(xù)測序過程中位置信息的編碼和獲取成為可能。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗,，致力通過質(zhì)量的服務,，助力各位科研工作者取得新的突破。通過空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)可獲取組織中具體的位置轉(zhuǎn)錄信息,，為研究和診斷提供有效數(shù)據(jù)支撐,。江西空間轉(zhuǎn)錄組價格

高通量空間轉(zhuǎn)錄組學數(shù)據(jù)的處理和分析需要新穎的方法和工具支撐，尤其是在預處理,、scRNA-seq 數(shù)據(jù)的空間重構(gòu),、基于微陣列數(shù)據(jù)的細胞類型去卷積、空間高變基因的識別,、細胞間相互作用的推導等,。scRNA-seq 技術(shù)的進步啟發(fā)了利用高分辨率轉(zhuǎn)錄組定量分析與空間轉(zhuǎn)錄組學數(shù)據(jù)的互補性質(zhì)的新方法。對于未進行轉(zhuǎn)錄組測序的 smFISH 和 ISS 數(shù)據(jù),，可通過 scRNA-seq 數(shù)據(jù)估算空間數(shù)據(jù)中未分析的基因的表達模式,。此外，“空間轉(zhuǎn)錄組學”這一術(shù)語的變體，也用于描述將轉(zhuǎn)錄本定位到細胞器的技術(shù)（例如 APEX-seq）,，盡管該技術(shù)沒有記錄任何空間坐標,。應用空間轉(zhuǎn)錄組質(zhì)量研究的***主要集中于人類和小鼠的大腦，而其他***（例如肝臟）的空間轉(zhuǎn)錄組學研究相對滯后,。

10x  Genomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫構(gòu)建的每張載玻片上有四個捕獲區(qū)域,，每個捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm，包含5000個被條形碼標記的點（barcoded spots）,，每個點的直徑為55 μm,，點和點之間中心的距離為100 μm，并且每個點都有一個barcode序列,。組織切片的細胞中會釋放出mRNA,，遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列，然后進行文庫構(gòu)建并進行測序,。根據(jù)數(shù)據(jù)的條形碼信息對數(shù)據(jù)進行分析,，以確定哪些數(shù)據(jù)來自哪個位置，從而實現(xiàn)空間基因表達的可視化,。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗,，致力通過高效的服務，助力各位科研工作者取得新的突破,。

空間轉(zhuǎn)錄組的一般流程,。將準備好的新鮮冷凍組織切片放置于空間轉(zhuǎn)錄組芯片上。每個細胞中的RNA分子都包含著基因表達的信息,。組織切片成像,，以檢索組織學信息。這樣就可以看到一個細胞或一組細胞在組織中的位置,?？臻g轉(zhuǎn)錄組芯片上含有上千個捕獲的spot，這些捕獲探針的 Poly-T 尾可以結(jié)合RNA分子的 Poly-A 尾,。這些陣列的排列順序就像一個棋盤,，帶有相同身份條形碼（barcode）的探測位于同一個正方形中。這樣就可以確定每個捕獲探針及其結(jié)合RNA的來源,。組織切片固定,。該芯片包含一個與組織切片一起成像的視覺可檢測框架。HE 染色適用于空間轉(zhuǎn)錄組的組織學呈現(xiàn)方法,。

Visium空間轉(zhuǎn)錄組能夠做何種組織類型以及推薦切片厚度是什么,？10X Genomics測試過很多組織類型，絕大多數(shù)都可以用于空間轉(zhuǎn)錄組的分析,。下圖是他們官網(wǎng)上測試過的組織類型的列表,，測試過的組織都可以運用在空間轉(zhuǎn)錄組的分析上面。但建議用戶用基因表達玻片做正式實驗前，務必用組織優(yōu)化的玻片測試一下,，看組織能否用于空間轉(zhuǎn)錄組的實驗,，同時也找到比較好的組織通透時間。切片厚度基本上以10μm為主,，但也有少量組織例外,。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗，致力通過質(zhì)量的服務,，助力各位科研工作者取得新的突破,。盡管前傳時代的空間技術(shù)被迅速棄用，但其思想和方法是當今時代空間轉(zhuǎn)錄組學發(fā)展的基礎(chǔ),。上海宣傳空間轉(zhuǎn)錄組

除了皮膚,、胰腺和骨頭組織外，其余樣本類型均可開展10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組研究,。江西空間轉(zhuǎn)錄組價格

第二,，數(shù)據(jù)庫的建立。盡管當前空間轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù)在快速地增長,，但尚未有對應的數(shù)據(jù)庫來對這些數(shù)據(jù)進行匯總集成,。第三，研究物種及組織的多樣化,。在當前時代,，除 LCM 之外，研究的***主要集中于人類和小鼠的大腦,，而其他***（例如肝臟）的空間轉(zhuǎn)錄組學研究相對滯后,。對除人類和小鼠以外的其他生物以及除大腦以外的其他***的技術(shù)現(xiàn)代化，將為開發(fā)有用的空間轉(zhuǎn)錄組學地圖集提供廣闊的前景,。第四，集成度高,、交互性強,、易擴展、文檔信息完善的開源工作流程的開發(fā),。該類工具的開發(fā)將簡化不同類型空間轉(zhuǎn)錄組學數(shù)據(jù)的整合和分析,。江西空間轉(zhuǎn)錄組價格

上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司致力于醫(yī)藥健康，以科技創(chuàng)新實現(xiàn)***管理的追求,。歐易生物作為檢驗檢測服務,。（依法須經(jīng)批準的項目，經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動,，具體經(jīng)營項目以相關(guān)部門批準文件或許可證件為準）一般項目：生物醫(yī)藥產(chǎn)品,、生化產(chǎn)品的研發(fā)，醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品（除危險品化學品,、監(jiān)控化學品,、易制毒化學品）的研發(fā)、銷售,，儀器儀表的銷售,，并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務,，會務服務,，企業(yè)管理咨詢。的企業(yè)之一,，為客戶提供良好的科研服務,，科研檢測，學術(shù)研究,，技術(shù)咨詢,。歐易生物始終以本分踏實的精神和必勝的信念，影響并帶動團隊取得成功,。歐易生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康行業(yè),。滿足市場需求，提高產(chǎn)品價值,，是我們前行的力量,。