**近，空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究炙手可熱,。細(xì)胞及其在組織樣本中的相對(duì)位置之間的關(guān)系對(duì)于理解疾病病理可能至關(guān)重要?？臻g轉(zhuǎn)錄組學(xué)是一項(xiàng)開(kāi)創(chuàng)性的技術(shù)，它使科學(xué)家能夠測(cè)量組織樣本中的所有基因活性,，并繪制出發(fā)生該活性的位置的圖,。該技術(shù)已經(jīng)導(dǎo)致了新發(fā)現(xiàn)，這些新發(fā)現(xiàn)將有助于幫助科學(xué)家更好地了解生物過(guò)程和疾病,。10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)可以應(yīng)用于**,、免疫、發(fā)育,、神經(jīng)和病理等研究方向,。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn)，致力通過(guò)質(zhì)量的服務(wù),，助力各位科研工作者取得新的突破,。空間轉(zhuǎn)錄組避免了組織中細(xì)胞位置信息的丟失,。陜西歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組報(bào)價(jià)

空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)原理是什么,？當(dāng)組織冷凍切片附在空間轉(zhuǎn)錄組載片上時(shí)，條形碼引物結(jié)合并從組織中捕獲鄰近的mRNA,。被捕獲的mRNA開(kāi)始逆轉(zhuǎn)錄,，得到的cDNA中包含了空間條形碼。分析Illumina測(cè)序結(jié)果中空間條形碼的序列,，可以將每個(gè)mRNA轉(zhuǎn)錄的序列映射回組織切片中的起始位置,。空間轉(zhuǎn)錄組的條形碼逆轉(zhuǎn)錄oligo(dT)引物在顯微鏡載玻片表面的有序附著,，空間轉(zhuǎn)錄組使得在mRNA樣品處理和后續(xù)測(cè)序過(guò)程中位置信息的編碼和獲取成為可能,。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn)，致力通過(guò)質(zhì)量的服務(wù),，助力各位科研工作者取得新的突破,。上海實(shí)力空間轉(zhuǎn)錄組盡管當(dāng)前空間轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù)在快速地增長(zhǎng)，但尚未有對(duì)應(yīng)的數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)對(duì)這些數(shù)據(jù)進(jìn)行匯總集成,。

基于原位測(cè)序的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù),。基于原位測(cè)序（ISS）的方法通過(guò)測(cè)序產(chǎn)生空間轉(zhuǎn)錄組信息,，這種方法只依靠連接酶連接兩段DNA—一段已知序列的引物和一個(gè)探針與模板匹配,，不匹配的探針就會(huì)被洗掉。2013年開(kāi)發(fā)的ISS中,，每個(gè)探針使用一個(gè)查詢堿基來(lái)測(cè)序基因條形碼。FISSEQ和后來(lái)的EXeq使用了SOLiD，每個(gè)探針使用兩個(gè)查詢堿基來(lái)測(cè)序環(huán)化和RCA擴(kuò)增的cDNAs,。在STARmap中,，基因條形碼由SEDAL測(cè)序，其中還使用了兩個(gè)類似固體的查詢堿基來(lái)避免錯(cuò)誤,。BARseq還用基因條形碼放大了RCA探針,。基于ISS技術(shù)的優(yōu)勢(shì)包括：?jiǎn)渭?xì)胞分辨率,、亞細(xì)胞轉(zhuǎn)錄物定位和可應(yīng)用于更大的組織區(qū)域,。缺點(diǎn)是：檢測(cè)效率較低。

10x  Genomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫(kù)構(gòu)建的每張載玻片上有四個(gè)捕獲區(qū)域,，每個(gè)捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm,，包含5000個(gè)被條形碼標(biāo)記的點(diǎn)（barcoded spots），每個(gè)點(diǎn)的直徑為55 μm,，點(diǎn)和點(diǎn)之間中心的距離為100 μm,，并且每個(gè)點(diǎn)都有一個(gè)barcode序列。組織切片的細(xì)胞中會(huì)釋放出mRNA,，遷移到每個(gè)spot的mRNA會(huì)被標(biāo)記上相應(yīng)的barcode序列,，然后進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建并進(jìn)行測(cè)序。根據(jù)數(shù)據(jù)的條形碼信息對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,，以確定哪些數(shù)據(jù)來(lái)自哪個(gè)位置,，從而實(shí)現(xiàn)空間基因表達(dá)的可視化。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn),，致力通過(guò)高效的服務(wù),，助力各位科研工作者取得新的突破。了解R語(yǔ)言基礎(chǔ)語(yǔ)法及數(shù)據(jù)類型,，了解空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析整體流程,。

人類細(xì)胞圖譜項(xiàng)目的主要目標(biāo)之一是描述所有細(xì)胞類型的空間關(guān)系,。同時(shí)基于表達(dá)特征對(duì)多種細(xì)胞類型進(jìn)行空間映射,，有助于研究不同細(xì)胞類型之間的相互作用。已經(jīng)發(fā)展了一些策略來(lái)檢測(cè)單細(xì)胞分辨率的空間基因表達(dá)譜,，如Slide-seq,、seqFISH或MERFISH。為了更有效地為研究群體探索空間基因表達(dá)數(shù)據(jù),，我們構(gòu)建了SpatialDB數(shù)據(jù)庫(kù)用于空間解析的轉(zhuǎn)錄組,。

人類細(xì)胞圖譜項(xiàng)目極大地推動(dòng)了單細(xì)胞水平的生命科學(xué)研究?？臻g轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)的發(fā)展和空間基因表達(dá)數(shù)據(jù)的快速積累是未來(lái)的發(fā)展趨勢(shì),。我們將繼續(xù)收集新的技術(shù)和數(shù)據(jù)集來(lái)更新SpatialDB。此外，我們將整合更多的工具和數(shù)據(jù)源來(lái)分析數(shù)據(jù). 有很多其他類型的分析可用于空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù),，包括基因模式的識(shí)別,，空間區(qū)域的轉(zhuǎn)錄組定義等。運(yùn)用空間轉(zhuǎn)錄組質(zhì)量

10X Visium空間轉(zhuǎn)錄組的實(shí)驗(yàn)主要分為兩部分：組織學(xué)板塊和組學(xué)板塊,。陜西歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組報(bào)價(jià)

一些實(shí)現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的重要技術(shù),，**早可以追溯到二十世紀(jì)七十年代，長(zhǎng)期以來(lái),，各種形式的原位雜交技術(shù)（ISH）已用于可視化空間中的基因表達(dá),。從技術(shù)原理中不難看出，空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)**為特殊的載玻片,。ISS 方法通常通過(guò)基于連接（SBL）或者基于合成（SBS） 的原位測(cè)序,， 確定靶向基因序列或非靶向的 cDNA 短片段，**終獲得空間轉(zhuǎn)錄組信息,。根據(jù)測(cè)序鏈接策略的不同（SOLiD,，cPAL和SEDAL），基于 SBL 的原位測(cè)序技術(shù)方法的代表性技術(shù)分別為 FISSEQ,，ISS,，STARmap。陜西歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組報(bào)價(jià)

上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司主營(yíng)品牌有歐易生物,，發(fā)展規(guī)模團(tuán)隊(duì)不斷壯大,，該公司服務(wù)型的公司。公司致力于為客戶提供安全,、質(zhì)量有保證的良好產(chǎn)品及服務(wù),，是一家私營(yíng)合伙企業(yè)企業(yè)。公司擁有專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì),，具有科研服務(wù),，科研檢測(cè)，學(xué)術(shù)研究,，技術(shù)咨詢等多項(xiàng)業(yè)務(wù),。歐易生物以創(chuàng)造***產(chǎn)品及服務(wù)的理念，打造高指標(biāo)的服務(wù),，引導(dǎo)行業(yè)的發(fā)展,。