空間轉(zhuǎn)錄組的一般流程,。將準(zhǔn)備好的新鮮冷凍組織切片放置于空間轉(zhuǎn)錄組芯片上,。每個(gè)細(xì)胞中的RNA分子都包含著基因表達(dá)的信息。組織切片成像,，以檢索組織學(xué)信息,。這樣就可以看到一個(gè)細(xì)胞或一組細(xì)胞在組織中的位置?？臻g轉(zhuǎn)錄組芯片上含有上千個(gè)捕獲的spot,，這些捕獲探針的 Poly-T 尾可以結(jié)合RNA分子的 Poly-A 尾。這些陣列的排列順序就像一個(gè)棋盤,，帶有相同身份條形碼（barcode）的探測位于同一個(gè)正方形中,。這樣就可以確定每個(gè)捕獲探針及其結(jié)合RNA的來源。組織切片固定,。該芯片包含一個(gè)與組織切片一起成像的視覺可檢測框架,。許多當(dāng)前時(shí)代空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的基礎(chǔ)都是在自七十年代以來的幾十年間建立的。河南空間轉(zhuǎn)錄組使用

空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)作為當(dāng)今前沿的科研技術(shù),，相信很多老師都希望將其運(yùn)用于自己的課題中,，快速發(fā)表高分文章。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn),，致力通過質(zhì)量的服務(wù),，助力各位科研工作者取得新的突破。由上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司（以下簡稱“歐易生物”）主辦的“空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)培訓(xùn)班”落下帷幕,。培訓(xùn)中,，歐易講師團(tuán)隊(duì)以其豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)及專業(yè)的生信能力，從空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的發(fā)展歷程,、測序原理,、實(shí)驗(yàn)實(shí)操及數(shù)據(jù)挖掘等多維度，向遠(yuǎn)道而來的學(xué)員們展開了系統(tǒng)性的培訓(xùn),。

青?？臻g轉(zhuǎn)錄組報(bào)價(jià)研究通過對 ALS 小鼠疾病進(jìn)程（癥狀前、發(fā)病,、癥狀期和終末期）的脊髓組織進(jìn)行空間轉(zhuǎn)錄組測序,。

1. 空間轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)步驟A,。切片制備和優(yōu)化：取新鮮組織、冷凍,、切片，并進(jìn)行HE染色成像,，優(yōu)化確定切片是否覆蓋靶向區(qū)域,。空間轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)步驟B,。切片固定和透化：將組織切片放置在含有與RNA結(jié)合捕獲探針的載玻片上,，并進(jìn)行固定和透化，使細(xì)胞中的 mRNA 得到釋放,，并結(jié)合到相應(yīng)的捕獲探針上,，從而獲取基因表達(dá)信息?？臻g轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)步驟c,。逆轉(zhuǎn)和文庫構(gòu)建：以捕獲的 RNA 為模板，進(jìn)行 cDNA 合成,，和測序文庫制備,。空間轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)步驟d,。高通量上機(jī)測序：對制備好的測序文庫,，進(jìn)行二代高通量短讀長測序?？臻g轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)步驟e,。數(shù)據(jù)可視化分析：結(jié)合HE結(jié)果，確定哪些基因有表達(dá),，表達(dá)量高低,，以及這些基因的空間位置信息。

歐易生物高級技術(shù)支持陳老師首先給大家介紹了空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的發(fā)展歷程,、測序流程及原理,。緊接著，歐易生物技術(shù)支持姚老師針對目前空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)發(fā)表的一系列高分文章進(jìn)行了方案設(shè)計(jì)的解析,。姜老師給大家詳細(xì)介紹了空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目樣本準(zhǔn)備,、切片、貼片等實(shí)驗(yàn)過程及注意事項(xiàng),，并帶領(lǐng)大家到實(shí)驗(yàn)室實(shí)地觀摩了整個(gè)實(shí)驗(yàn)過程,，并就其中細(xì)節(jié)進(jìn)行了講解。董老師針對空間轉(zhuǎn)錄組10x Space Ranger的分析原理及結(jié)果進(jìn)行了詳細(xì)解析,，并介紹了使用Seurat包進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘的標(biāo)準(zhǔn)分析流程,。10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)可以應(yīng)用于免疫,、發(fā)育、神經(jīng)和病理等研究方向,。

10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的準(zhǔn)確性高嗎,？下圖是一個(gè)將10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)應(yīng)用于小鼠海馬體研究的案例。A圖為腦組織切片的HE染色結(jié)果,，從10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果中,，可以清晰看到Tmsb4x（B圖）和Selenow（C圖）在海馬體區(qū)域高表達(dá)，和已知的研究結(jié)果一致性較高,。開展10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組需要做哪些準(zhǔn)備,？空間轉(zhuǎn)錄組是一項(xiàng)十分前沿的技術(shù)，涉及到很多細(xì)節(jié)方面的準(zhǔn)備工作,，例如組織類型的選擇,、前期預(yù)實(shí)驗(yàn)的設(shè)計(jì)、病理區(qū)域的確認(rèn)等一系列內(nèi)容,。而且實(shí)驗(yàn)中存在很多不確定性因素,，處理不慎容易導(dǎo)致整個(gè)項(xiàng)目失敗?？臻g轉(zhuǎn)錄組的條形碼逆轉(zhuǎn)錄oligo(dT)引物在顯微鏡載玻片表面的有序附著,。云南空間轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域

空間轉(zhuǎn)錄組細(xì)胞通訊分析方法簡介及實(shí)操。河南空間轉(zhuǎn)錄組使用

 空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)(ST)是一種方法,，允許在組織樣本中可視化和定量分析轉(zhuǎn)錄組與空間分辨率,。通過在載玻片上排列含有位置條形碼的寡核苷酸的組織切片，該方法聲稱可以生成具有精確位置信息的高質(zhì)量的RNA-seq cDNA文庫,。條形碼芯片有1007個(gè)帶有獨(dú)特條形碼序列的引物位點(diǎn),。每個(gè)位置都有一個(gè)直徑100μm(對應(yīng)于一個(gè)組織域)中心到中心的距離是200μm。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn),，在空間轉(zhuǎn)錄組樣本處理,、實(shí)驗(yàn)和數(shù)據(jù)挖掘上的成功經(jīng)驗(yàn)，致力通過質(zhì)量的服務(wù),，助力各位科研工作者取得新的突破,。河南空間轉(zhuǎn)錄組使用

上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司致力于醫(yī)藥健康，是一家服務(wù)型公司,。公司業(yè)務(wù)分為科研服務(wù),，科研檢測，學(xué)術(shù)研究,，技術(shù)咨詢等,，目前不斷進(jìn)行創(chuàng)新和服務(wù)改進(jìn)，為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務(wù),。公司從事醫(yī)藥健康多年,，有著創(chuàng)新的設(shè)計(jì),、強(qiáng)大的技術(shù)，還有一批**的專業(yè)化的隊(duì)伍,，確保為客戶提供良好的產(chǎn)品及服務(wù),。在社會各界的鼎力支持下，持續(xù)創(chuàng)新,，不斷鑄造***服務(wù)體驗(yàn),，為客戶成功提供堅(jiān)實(shí)有力的支持。