空間基因表達(dá)技術(shù)能夠在保留空間背景信息的同時(shí),，多方位測量轉(zhuǎn)錄組譜,。然而,，現(xiàn)有的分析方法并沒有解決技術(shù)分辨率有限或有效利用空間信息的問題。來自美國的科研團(tuán)隊(duì)開發(fā)了BayesSpace,，這是一種完全貝葉斯統(tǒng)計(jì)方法，它使用來自空間鄰域的信息來增強(qiáng)空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分辨率并進(jìn)行聚類分析,。BayeSpace通過使用的Bioconductor SingleCellExperiment數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)將預(yù)處理數(shù)據(jù)作為輸入,，無縫集成到空間轉(zhuǎn)錄組分析工作流中，輸出同樣存儲在SingleCellExperiment對象中,，該對象可用于下游分析,。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn)，致力通過質(zhì)量的服務(wù),，助力各位科研工作者取得新的突破,。通過空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)可獲取組織中具體的位置轉(zhuǎn)錄信息，為研究和診斷提供有效數(shù)據(jù)支撐。10x空間轉(zhuǎn)錄組質(zhì)量

轉(zhuǎn)錄本的空間位置信息可以通過在原位陣列上捕獲的組織切片中的轉(zhuǎn)錄本來獲取,，目前已有多種技術(shù)策略被開發(fā)報(bào)道,， 如空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)（Spatial Transcriptomics，ST）和 Visium 技術(shù),，通過將包含空間位置信息的條形碼,、UMI 標(biāo)簽、poly-dT 的探針固定在商用微陣列載玻片上,，來捕獲包含 poly(A) 尾巴的轉(zhuǎn)錄本,，并獲取全轉(zhuǎn)錄組水平的基因表達(dá)及位置信息。一些無需成像即可計(jì)算重建空間基因表達(dá)模式所需信息的技術(shù)也被開發(fā)了出來,，其中之一就是是 DNA 顯微技術(shù),，它記錄 cDNA 之間的接近度，該信息可用于重建轉(zhuǎn)錄本之間的相對位置,。云南歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組有什么用空間轉(zhuǎn)錄組樣本的組織切片的細(xì)胞中會(huì)釋放出mRNA,，遷移到每個(gè)spot的mRNA會(huì)被標(biāo)記上相應(yīng)的barcode序列。

空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)作為當(dāng)今前沿的科研技術(shù),，相信很多老師都希望將其運(yùn)用于自己的課題中,，快速發(fā)表高分文章。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn),，致力通過質(zhì)量的服務(wù),，助力各位科研工作者取得新的突破。由上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司（以下簡稱“歐易生物”）主辦的“空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)培訓(xùn)班”落下帷幕,。培訓(xùn)中,，歐易講師團(tuán)隊(duì)以其豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)及專業(yè)的生信能力，從空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的發(fā)展歷程,、測序原理,、實(shí)驗(yàn)實(shí)操及數(shù)據(jù)挖掘等多維度，向遠(yuǎn)道而來的學(xué)員們展開了系統(tǒng)性的培訓(xùn),。

空間轉(zhuǎn)錄組是在組織原位檢測基因表達(dá)的一種技術(shù),，與bulk RNA-seq或單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序相比，空間轉(zhuǎn)錄組避免了組織中細(xì)胞位置信息的丟失,，使得我們在檢測基因表達(dá)的同時(shí)獲得基因在組織內(nèi)部的空間位置信息,。正是由于空間轉(zhuǎn)錄組可以從多維度解析生物學(xué)過程的特點(diǎn)，近年來關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組無論是在技術(shù)開發(fā),，還是大規(guī)模應(yīng)用或商業(yè)化,，都得到蓬勃發(fā)展。例如2019年4月,，Science發(fā)文通過空間轉(zhuǎn)錄組揭示ALS（肌萎縮側(cè)索硬化癥,，又稱漸凍癥）分子病理的時(shí)空動(dòng)態(tài),；2019年8月，Nature在線發(fā)表了景乃禾團(tuán)隊(duì)解析小鼠早期胚胎細(xì)胞的時(shí)空表達(dá)數(shù)據(jù),；2020年9月,，Cell上發(fā)表了一篇利用空間轉(zhuǎn)錄組解析人鱗狀細(xì)胞*的文章；2021年1月,，Science發(fā)表了將組織擴(kuò)展和原位RNA測序結(jié)合起來的新型空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)ExSeq,；2021年4月，10x Genomics公司宣布了新一代FFPE空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化解決方案,。在未來的5-10年里,，空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)妥妥的是技術(shù)熱點(diǎn)。

和單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組一樣,，空間轉(zhuǎn)錄組也可以進(jìn)行細(xì)胞間通訊分析,，區(qū)別在于空間位置信息可以同時(shí)用于識別潛在的細(xì)胞間相互作用。通常通過了解配體受體（LR）對并測試 LR 對是否更有可能在鄰近細(xì)胞或 spot 中表達(dá)來完成,。還有很多其他類型的分析可用于空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù),，包括基因模式的識別，空間區(qū)域的轉(zhuǎn)錄組定義,， 基因間的相互作用推斷,，轉(zhuǎn)錄本的亞細(xì)胞定位以及基于H＆E圖像的基因表達(dá)估算等。1. 歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn),，致力通過質(zhì)量的服務(wù),，助力各位科研工作者取得新的突破,?？臻g轉(zhuǎn)錄組細(xì)胞通訊分析方法簡介及實(shí)操。安徽空間轉(zhuǎn)錄組使用

空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)和 10X Visium 依靠這種微陣列技術(shù),，區(qū)別在于微陣列載玻片上的組織上的轉(zhuǎn)錄本信息,。10x空間轉(zhuǎn)錄組質(zhì)量

空間轉(zhuǎn)錄組的應(yīng)用有哪些？一,、發(fā)現(xiàn)疾病的空間異質(zhì)性：同時(shí)了解患病組織中的細(xì)胞類型及其定位有助于解決空間分辨的轉(zhuǎn)錄組學(xué)問題,。在不同的環(huán)境下，明智地選擇這些方法在生物學(xué)研究中也是至關(guān)重要的,，例如在神經(jīng)科學(xué)中,，基于FISH的方法很普遍；基于LCM的方法適用于小樣本（例如臨床樣本）以及整個(gè)轉(zhuǎn)錄組或基因組分析,。二,、構(gòu)建空間轉(zhuǎn)錄組圖譜：借助于空間分辨的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)，建立圖譜可能是在分子水平上研究生物體結(jié)構(gòu)的重要步驟,。目前的多項(xiàng)研究通過單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)結(jié)合空間轉(zhuǎn)錄技術(shù),，得到多個(gè)***的時(shí)空轉(zhuǎn)錄組圖譜（相關(guān)研究后續(xù)會(huì)在如下專輯更新）,。10x空間轉(zhuǎn)錄組質(zhì)量

上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司是一家服務(wù)型類企業(yè)，積極探索行業(yè)發(fā)展,，努力實(shí)現(xiàn)產(chǎn)品創(chuàng)新,。是一家私營合伙企業(yè)企業(yè)，隨著市場的發(fā)展和生產(chǎn)的需求,，與多家企業(yè)合作研究,，在原有產(chǎn)品的基礎(chǔ)上經(jīng)過不斷改進(jìn)，追求新型,，在強(qiáng)化內(nèi)部管理,，完善結(jié)構(gòu)調(diào)整的同時(shí)，良好的質(zhì)量,、合理的價(jià)格,、完善的服務(wù)，在業(yè)界受到寬泛好評,。以滿足顧客要求為己任,；以顧客永遠(yuǎn)滿意為標(biāo)準(zhǔn)；以保持行業(yè)優(yōu)先為目標(biāo),，提供***的科研服務(wù),，科研檢測，學(xué)術(shù)研究,，技術(shù)咨詢,。歐易生物將以真誠的服務(wù)、創(chuàng)新的理念,、***的產(chǎn)品,，為彼此贏得全新的未來！