第二，數(shù)據(jù)庫的建立,。盡管當前空間轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù)在快速地增長,，但尚未有對應(yīng)的數(shù)據(jù)庫來對這些數(shù)據(jù)進行匯總集成。第三,，研究物種及組織的多樣化,。在當前時代，除 LCM 之外,，研究的***主要集中于人類和小鼠的大腦,，而其他***（例如肝臟）的空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究相對滯后。對除人類和小鼠以外的其他生物以及除大腦以外的其他***的技術(shù)現(xiàn)代化,，將為開發(fā)有用的空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)地圖集提供廣闊的前景,。第四，集成度高,、交互性強,、易擴展、文檔信息完善的開源工作流程的開發(fā),。該類工具的開發(fā)將簡化不同類型空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)的整合和分析,。HE 染色適用于空間轉(zhuǎn)錄組的組織學(xué)呈現(xiàn)方法。北京空間轉(zhuǎn)錄組報價

廣義上來說,，目前一共有4種解析“空間性轉(zhuǎn)錄組”的策略：2.第一種是利用計算機算法,，根據(jù)單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)來模擬重構(gòu)組織的空間形態(tài)。例如Seurat,，這是一個在單細胞數(shù)據(jù)分析中***用到的R包,，我們可以利用scRNA-seq數(shù)據(jù)，加上對markegene進行原位測序的結(jié)果來重構(gòu)組織的空間信息,。3.第二種,，激光顯微切割+二代測序（LCM+NGS）。這種技術(shù)對儀器和實驗人員的操作要求較高,，而且獲取的通量也比較低,，如果組織非常珍貴或者研究的內(nèi)容十分精細,，可以考慮這個。但是這種策略比較難被官方干運用,。4.第三種策略,，就是基于高分辨圖像的原位測序。**經(jīng)典的是smFISH當然,，這種方法的通量比較低,。當然隨著技術(shù)的發(fā)現(xiàn)，剛發(fā)布的FISH-seq技術(shù)通過多輪雜交的方式,，已經(jīng)把測序通量提高到了10000+個轉(zhuǎn)錄本,。5.***就是“基于空間條形碼（spatialbarcodes）的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)。本文主要討論的也就是這種技術(shù),。后面主要討論的都是基于這種策略,。 湖南空間轉(zhuǎn)錄組報價作者通過對三個人類腦皮層組織的空間轉(zhuǎn)錄組測序，可評估不同腦皮層區(qū)域中基因表達特征和細胞類型定位情況,。

基于原位測序的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù),。基于原位測序（ISS）的方法通過測序產(chǎn)生空間轉(zhuǎn)錄組信息,，這種方法只依靠連接酶連接兩段DNA—一段已知序列的引物和一個探針與模板匹配,，不匹配的探針就會被洗掉。2013年開發(fā)的ISS中,，每個探針使用一個查詢堿基來測序基因條形碼,。FISSEQ和后來的EXeq使用了SOLiD，每個探針使用兩個查詢堿基來測序環(huán)化和RCA擴增的cDNAs,。在STARmap中,，基因條形碼由SEDAL測序，其中還使用了兩個類似固體的查詢堿基來避免錯誤,。BARseq還用基因條形碼放大了RCA探針,。基于ISS技術(shù)的優(yōu)勢包括：單細胞分辨率,、亞細胞轉(zhuǎn)錄物定位和可應(yīng)用于更大的組織區(qū)域,。缺點是：檢測效率較低。

空間轉(zhuǎn)錄組的一般流程2,。這使得在后續(xù)步驟中覆蓋細胞組織圖像和基因表達數(shù)據(jù)成為可能。用我們的滲透試劑對組織進行滲透,，這意味著在細胞膜上形成小孔,。RNA分子可以通過這些通道離開細胞，并與芯片上相鄰的捕獲探針結(jié)合,。因此,，基因表達信息被捕獲在芯片上,。需要通過以下步驟將捕獲的RNA分子中存儲的信息轉(zhuǎn)換為數(shù)據(jù)。cDNA合成是為了創(chuàng)造穩(wěn)定的雙鏈DNA分子,。這是必要的,，因為cdna - rna -雜交體的降解速度很快。此外,，這是構(gòu)建可測序文庫之前的必要步驟,。所有之前收集的信息都被匯集起來，可以在線訪問,。這意味著在實踐中,，您可以查看組織切片的圖像并選擇組織中的不同區(qū)域。然后你可以確定哪些基因在這些區(qū)域中以什么數(shù)量表達,。因此,，你可以在一個單一的實驗中進行新分析。獲取空間轉(zhuǎn)錄組中各個spot的細胞類型注釋信息,。

1. 10x  Genomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫構(gòu)建的每張載玻片上有四個捕獲區(qū)域,，每個捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm，包含5000個被條形碼標記的點（barcoded spots）,，每個點的直徑為55 μm,，點和點之間中心的距離為100 μm，并且每個點都有一個barcode序列,。10X Visium空間轉(zhuǎn)錄組的實驗主要分為兩部分：組織學(xué)板塊和組學(xué)板塊,。組織學(xué)板塊包括樣品的包埋、切片,、固定,、染色及成像，記錄切片的形態(tài)學(xué)信息,；組學(xué)板塊包括cDNA的合成,、擴增、接頭連接和測序,，記錄切片的轉(zhuǎn)錄本信息和空間位置信息 ,。10X Genomics 繼單細胞測序后也推出了空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)。重慶空間轉(zhuǎn)錄組質(zhì)量

許多當前時代空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的基礎(chǔ)都是在自七十年代以來的幾十年間建立的,。北京空間轉(zhuǎn)錄組報價

 空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)(ST)是一種方法,，允許在組織樣本中可視化和定量分析轉(zhuǎn)錄組與空間分辨率。通過在載玻片上排列含有位置條形碼的寡核苷酸的組織切片,，該方法聲稱可以生成具有精確位置信息的高質(zhì)量的RNA-seq cDNA文庫,。條形碼芯片有1007個帶有獨特條形碼序列的引物位點。每個位置都有一個直徑100μm(對應(yīng)于一個組織域)中心到中心的距離是200μm。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗,，在空間轉(zhuǎn)錄組樣本處理,、實驗和數(shù)據(jù)挖掘上的成功經(jīng)驗，致力通過質(zhì)量的服務(wù),，助力各位科研工作者取得新的突破,。北京空間轉(zhuǎn)錄組報價

上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司位于聯(lián)航路1188號25幢，擁有一支專業(yè)的技術(shù)團隊,。致力于創(chuàng)造***的產(chǎn)品與服務(wù),，以誠信、敬業(yè),、進取為宗旨,，以建歐易生物產(chǎn)品為目標，努力打造成為同行業(yè)中具有影響力的企業(yè),。我公司擁有強大的技術(shù)實力,，多年來一直專注于檢驗檢測服務(wù)。（依法須經(jīng)批準的項目,，經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動,，具體經(jīng)營項目以相關(guān)部門批準文件或許可證件為準）一般項目：生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā),，醫(yī)藥中間體,、化工原料及產(chǎn)品（除危險品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品,、易制毒化學(xué)品）的研發(fā),、銷售，儀器儀表的銷售,，并提供相關(guān)技術(shù)咨詢,、技術(shù)服務(wù)，會務(wù)服務(wù),，企業(yè)管理咨詢,。的發(fā)展和創(chuàng)新，打造高指標產(chǎn)品和服務(wù),。自公司成立以來,，一直秉承“以質(zhì)量求生存，以信譽求發(fā)展”的經(jīng)營理念,，始終堅持以客戶的需求和滿意為重點,，為客戶提供良好的科研服務(wù)，科研檢測,，學(xué)術(shù)研究,，技術(shù)咨詢,，從而使公司不斷發(fā)展壯大。