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北京BD單細(xì)胞測序分析

來源: 發(fā)布時間:2022-06-07

烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業(yè),,為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù),,先后經(jīng)歷基因芯片時代、基因測序,、轉(zhuǎn)錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭,。2018年以來,,單細(xì)胞測序進(jìn)入發(fā)展的快車道,烈冰作為國內(nèi)首批引進(jìn)單細(xì)胞實驗雙平臺的公司,,依托自主研發(fā)的NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)分析平臺,,為用戶提供一站式全流程的單細(xì)胞測序服務(wù)和解決方案。4年的單細(xì)胞技術(shù)的積累,,烈冰已具備大鼠,、小鼠、斑馬魚,、猴,、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種,,皮膚,、腦、胰腺,、脂肪,、心臟、花序等50+組織類型,,100+細(xì)胞類型,,1000+靶標(biāo)基因,10000+樣本處理經(jīng)驗,。單細(xì)胞測序是高通量測序下的又一重大技術(shù)突破,。北京BD單細(xì)胞測序分析

烈冰生物已空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)提供從一個組織切片樣本中獲取包括空間信息在內(nèi)的全部轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),從而可以區(qū)分和定位功能基因在特定組織區(qū)域內(nèi)的活躍表達(dá),。其可以檢測組織樣本中的所有基因活動,,并繪制活動發(fā)生的位置,這將有助于科學(xué)家更好地構(gòu)建生物圖譜,,并進(jìn)一步理解疾病和生物學(xué)過程,。目前,空間轉(zhuǎn)錄組主要應(yīng)用于多種疾病,、免疫,、發(fā)育、神經(jīng)和病理學(xué)等研究領(lǐng)域,。烈冰生物具有專業(yè)的實驗團隊,、豐富的切片經(jīng)驗,配置了國際主流的儀器設(shè)備,,實驗團隊針對不同組織類型優(yōu)化完善實驗方案,,并制定了嚴(yán)謹(jǐn)規(guī)范的實驗室SOP流程,保證空間轉(zhuǎn)錄組切片的質(zhì)量,,全優(yōu)保障測序數(shù)據(jù)質(zhì)量,。南京單細(xì)胞細(xì)胞核測序公司烈冰開展了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞多組學(xué)以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案,。

烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),,深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,;從操作便捷,、結(jié)果可視化、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,,加速科研進(jìn)程,!此外,烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器(Single Cell Browser),,不僅可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,,還可以實現(xiàn)分析結(jié)果的三維立體化的展示呈現(xiàn)。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,,專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您,!

多樣本數(shù)據(jù)合并:Fraction of Reads Kept:合并樣本時,各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計算出來的數(shù)據(jù)利用率,。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,,需要進(jìn)行Downsample處理,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測序深度標(biāo)化到同一水平,,從而避免因測序深度差異導(dǎo)致的基因檢測數(shù)量,、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),,深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷,、結(jié)果可視化,、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,,加速科研進(jìn)程,!助力探索生命時空多維度的動態(tài)變化的生物學(xué)信息;助力生命健康醫(yī)療大時代,!

reads數(shù),、基因表達(dá)量及細(xì)胞數(shù)量判定過程中:以捕獲5000個細(xì)胞、100G的測序量為標(biāo)準(zhǔn),,每個細(xì)胞的reads數(shù)大約在50k左右,;每個細(xì)胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細(xì)胞類型,例如成熟的B,,T,,粒細(xì)胞數(shù)量較多的組織中,,由于該類型細(xì)胞表達(dá)的基因數(shù)普遍較少,,導(dǎo)致基因中位數(shù)下降。而某一疾病組織,、或者體外培養(yǎng)的如干細(xì)胞等,,他們的基因表達(dá)數(shù)較高,甚至可以超過1萬,,這就導(dǎo)致該類樣本基因中位數(shù)非常高,。因此,,我們對細(xì)胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認(rèn)時,需要考察實際組織的細(xì)胞組成,。烈冰斥巨資引進(jìn)Novaseq6000,,開啟更大通量測序新紀(jì)元。深圳BD VDJ測序多重?zé)晒饷庖呓M化

個性化制定測序項目方面,,滿足從檢測基因到蛋白的多組學(xué)測序要求,。北京BD單細(xì)胞測序分析

10X Genomics和Drop-Seq的技術(shù)原理。是利用十字交叉的通道,,從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,,縱向孔道輸入細(xì)胞,凝膠微珠與細(xì)胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上,,并通過微流控技術(shù),,將之輸入到油相孔道中。這時候,,就形成了一個個油滴后輸出并收集在EP管中,。每一個油滴中會落入一個細(xì)胞以及一個凝膠微珠,那么在每一個凝膠微珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,,再加上一端PolyT的抓手,,構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠。而這個凝膠微珠抓手就會使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫,,進(jìn)而完成細(xì)胞中RNA的捕獲過程,。北京BD單細(xì)胞測序分析

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家服務(wù)型類企業(yè),積極探索行業(yè)發(fā)展,,努力實現(xiàn)產(chǎn)品創(chuàng)新,。公司致力于為客戶提供安全、質(zhì)量有保證的良好產(chǎn)品及服務(wù),,是一家有限責(zé)任公司(自然)企業(yè),。公司業(yè)務(wù)涵蓋單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序,價格合理,,品質(zhì)有保證,,深受廣大客戶的歡迎。烈冰生物以創(chuàng)造***產(chǎn)品及服務(wù)的理念,,打造高指標(biāo)的服務(wù),,引導(dǎo)行業(yè)的發(fā)展。