單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)再樣本細(xì)胞上機(jī)分選簽,，需要對(duì)細(xì)胞數(shù)量,、細(xì)胞活性進(jìn)準(zhǔn)判斷,，這對(duì)Single Cell分選標(biāo)記,、建庫(kù),、下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用,。如若細(xì)胞計(jì)數(shù)偏高,，將會(huì)影響建庫(kù)的成功率,；計(jì)數(shù)偏低，則會(huì)提高雙細(xì)胞的比例,；而細(xì)胞活率過(guò)低,，就會(huì)使測(cè)序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣，因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要,。而在鋪板過(guò)程中,，由于不同操作人員手法具有不可避免的差異，不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果,。因此烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞分選平臺(tái)配套了專門定制的電動(dòng)移液器,，其具有Prime Treat、Cell Load,、Bead Load,、Wash、Lysis,、Retrieval多種操作模式,，來(lái)對(duì)應(yīng)各種不同的操作。通過(guò)已經(jīng)設(shè)定的程序來(lái)控制液體的流速,，大幅度降低人為操作習(xí)慣帶來(lái)的差異,，保證實(shí)驗(yàn)操作的一致性。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測(cè)序服務(wù),。上海10X單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析可視化

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是在單細(xì)胞水平上高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),，突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性，組織解離后,，單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-20000個(gè)細(xì)胞,， 基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序，獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),，并鑒定細(xì)胞的類型,，可以在不同樣本間從細(xì)胞類型的組成和豐度角度進(jìn)行比較，反映細(xì)胞間的異質(zhì)性,。而2021年橫空出世的10X Genomics Chromium X平臺(tái)實(shí)現(xiàn)了單塊chip上的百萬(wàn)級(jí)別通量的細(xì)胞捕獲,，系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)16個(gè)通道同時(shí)運(yùn)行，每個(gè)通道可捕獲2000-20000個(gè)細(xì)胞（不混樣）,，并支持原Chromium Controller體統(tǒng)外的多種細(xì)胞捕獲百萬(wàn)級(jí)別通量實(shí)驗(yàn),，可準(zhǔn)確鑒別稀有細(xì)胞類型和適配大規(guī)模單細(xì)胞研究。淄博單細(xì)胞測(cè)序多組學(xué)測(cè)序豐富的測(cè)序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn),，烈冰配套全程個(gè)性化,、定制化地?cái)?shù)據(jù)分析服務(wù)。

一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲,，小心得不償失,，原因在這：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類進(jìn)行,，而細(xì)胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后，獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜,，通過(guò)降維（pca）,，無(wú)監(jiān)督聚類以及可視化（t-SNE）得到的。進(jìn)行細(xì)胞聚類時(shí)需要考慮到每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式,，因此即使是相同的數(shù)據(jù),，在剔除幾個(gè)細(xì)胞的情況下，前后獲得的聚類圖也會(huì)出現(xiàn)明顯不同,。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過(guò)多時(shí),，無(wú)論是假陰性和假陽(yáng)性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù)，都會(huì)對(duì)正常細(xì)胞聚類產(chǎn)生影響,，造成聚類結(jié)果失真,。這也是很多文章，特別是很多高分文章,，為什么單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了,。烈冰建議單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在3000-5000個(gè)時(shí)，數(shù)據(jù)量在100G左右時(shí),，可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求,。

單細(xì)胞獲得困難，不同組織要求不盡相同難以搞定,？ 烈冰2000+項(xiàng)目消化經(jīng)驗(yàn),，100+組織類型解離protocol，精心設(shè)計(jì)不同組織實(shí)驗(yàn)的解離,、細(xì)胞懸浮實(shí)驗(yàn)體系,，確保單細(xì)胞的獲得,。 凍存樣本無(wú)法實(shí)驗(yàn),，珍貴樣本無(wú)法使用？ 烈冰采用國(guó)際認(rèn)可的凍存組織復(fù)蘇技術(shù)以及死細(xì)胞過(guò)濾技術(shù),，確保凍存組織使用,。 珍貴樣本，細(xì)胞數(shù)量太少,，消化背景雜無(wú)法做單細(xì)胞,？ 采用國(guó)際認(rèn)可的10X Genomics，BD Rhapsody雙平臺(tái)模式,，根據(jù)樣本實(shí)際情況和用戶需求提供客觀有效的實(shí)驗(yàn)方案,細(xì)胞量少,，背景雜也能做單細(xì)胞。 單細(xì)胞RNA分類精度不足,，部分細(xì)胞無(wú)法細(xì)分,？ 烈冰同時(shí)采用單細(xì)胞蛋白質(zhì)組與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù),，真正做到從上游到下游的全流程檢測(cè)，確保超高的細(xì)胞分類精度,。個(gè)性化制定測(cè)序項(xiàng)目方面,，滿足從檢測(cè)基因到蛋白的多組學(xué)測(cè)序要求。

科研的魅力之處,，在于無(wú)窮盡的探尋生命的本底,，通過(guò)單細(xì)胞測(cè)序，我們對(duì)組織的分子基礎(chǔ)的研究也從初級(jí)到深層,，并在單細(xì)胞層面逐漸達(dá)成一致,，那么不禁要問(wèn)一句，組織的空間位置到底重不重要,？空間異質(zhì)性是功能的關(guān)鍵特征,，細(xì)胞的位置信息更能反應(yīng)細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控機(jī)制和細(xì)胞譜系發(fā)生過(guò)程。因此時(shí)間和空間即像組織的AB面,，而不可否認(rèn)的是,，此時(shí)空間坐標(biāo)的記錄，像一個(gè)還未長(zhǎng)大的娃娃,，雖未觸及分子基礎(chǔ)研究的深層,，但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個(gè)高峰。附加流式分選細(xì)胞表面Marker,，對(duì)于較低分辨率的標(biāo)志物也能有效鑒定,，助力高要求測(cè)序項(xiàng)目。青島單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析

單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),，并鑒定細(xì)胞的類型,。上海10X單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析可視化

二代測(cè)序技術(shù)在測(cè)序方法上取得了重大突破，基于“邊合成邊測(cè)序”（sequencing by synthesis）和大規(guī)模平行測(cè)序技術(shù)（massive parallel analysis,MPS）,，使測(cè)序通量和讀取速度得到極大提升,，例如Illumina Solexa測(cè)序儀。Illumina的測(cè)序原理可以簡(jiǎn)化為四步：樣品文庫(kù)構(gòu)建,、簇生成,、測(cè)序和數(shù)據(jù)分析。由于讀長(zhǎng)限制,，樣品DNA或由RNA逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段,，并在3'和5'端接上3種序列：1）Index，用于區(qū)分樣品來(lái)源,；2）Adapter,，用于結(jié)合測(cè)序通道上的位點(diǎn)；3）Primer binding site，用于結(jié)合PCR引物啟動(dòng)擴(kuò)增反應(yīng),。上海10X單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析可視化

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,，是一家服務(wù)型的公司。公司自成立以來(lái),，以質(zhì)量為發(fā)展,，讓匠心彌散在每個(gè)細(xì)節(jié)，公司旗下單細(xì)胞測(cè)序,，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序深受客戶的喜愛(ài),。公司秉持誠(chéng)信為本的經(jīng)營(yíng)理念,，在醫(yī)藥健康深耕多年，以技術(shù)為先導(dǎo),，以自主產(chǎn)品為重點(diǎn),，發(fā)揮人才優(yōu)勢(shì)，打造醫(yī)藥健康良好品牌,。烈冰生物秉承“客戶為尊,、服務(wù)為榮、創(chuàng)意為先,、技術(shù)為實(shí)”的經(jīng)營(yíng)理念,，全力打造公司的重點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)力。