基于10X Geomics 動態(tài)微流控技術,，利用Tn5轉座酶酶切開放染色質,，形成短片段，單細胞ATAC測序在表觀基因組學水平上,，揭示單細胞染色質的可及性問題,，區(qū)分細胞異質性,，獲得開放染色質的位置、轉錄因子的結合位點,、核小體的調控區(qū)域和染色質狀態(tài)等信息,，是單細胞表觀遺傳學的重要突破：分析每個細胞數(shù)千個獨特的染色質開放區(qū)域，識別細胞類型和細胞狀態(tài),；識別重要的轉錄因子,，進行譜系和發(fā)育追蹤；探究驅動細胞類型和狀態(tài)之間基因表達差異的非編碼序列,；探究細胞類型特異性和基因調控網絡特征等,。是當前重要的多組學研究基因表達和表觀遺傳學的手段。高通量測序技術是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,，一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定,。天津10X單細胞測序百萬通量平臺

10× Genomics官方建議，當單細胞懸液活性低于70%時應做去除死細胞操作,，并推薦使用MACS? Dead Cell Removal Kit(Miltenyi Biotec),。需要注意到，去除死細胞的操作會損失一定的細胞數(shù)量,，10× Genomics和Miltenyi Biotec都沒有給出單細胞懸液含有多少細胞數(shù)量才建議做去除死細胞的操作,。基于烈冰多年單細胞測序實驗經驗,，建議當細胞懸液進行質量和活性檢測后,，考慮對細胞活性在50%-70%的懸液進行去除死細胞的操作。而太低活性的懸液（小于30%）,，懸液中細胞大量死亡,，可能已經丟失了原組織內的細胞比例和狀態(tài)，失真嚴重,，建議重新收集樣本進行新的實驗,，保證數(shù)據的高質量和實驗結果的準確性。北京10X Chromium X單細胞測序百萬通量平臺單細胞科聯(lián)合空間轉錄組,，展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達情況,，揭示精細病理區(qū)域中“喚醒”的信號通路。

多樣本數(shù)據合并：Fraction of Reads Kept：合并樣本時,，各樣本根據Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計算出來的數(shù)據利用率,。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,，需要進行Downsample處理，以數(shù)據量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平,，從而避免因測序深度差異導致的基因檢測數(shù)量,、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據,，深度解讀數(shù)據分析結果,，深入挖掘其背后的生物學意義；從操作便捷,、結果可視化,、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,，加速科研進程,！

烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據分析平臺，針對龐大的單細胞測序數(shù)據,，能夠實現(xiàn)細胞類型鑒定的快,、精、準：一鍵導入gene list構建個性化基因列表,；輕松一點即可展示Marker基因的Feature plot,；任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型；一鍵獲得t-SNE圖,、Heatmap和Violin圖：輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖,、Heatmap、Violin圖,，還可以通過調節(jié)寬,、高和系數(shù)比例來調節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具,、50+pipeline工作流模板,，幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調用和一站式全流程自動化分析，節(jié)省工作時間并提升整體工作效率,。豐富的測序和數(shù)據分析經驗,，烈冰配套全程個性化、定制化地數(shù)據分析服務,。

科技的發(fā)展讓單細胞測序已經應用于疾病發(fā)展過程中的關鍵過程和事件,，如前病變向惡性的轉化、惡性向轉移性的發(fā)展,，以及對多種用藥的反應,。單細胞測序技術作為一個需要將組織解離成為單細胞懸液，或者是采用細胞核捕獲的策略捕獲單細胞核，進而對于每一個單細胞或者細胞核進行測序得到結果的技術,，其空間定位信息是丟失的,。這就衍生出了一個問題就是如果單細胞A與B并不出現(xiàn)在一個組織區(qū)域中他們會互相影響或者轉化么,？免疫研究中,，兩個具有非常強的PDL1-PD1的配對關系的細胞在組織切片上風馬牛不相及，這樣PDL1-PD1的關系會生效么,？烈冰科技成立10余年,，為科研學者提供專注的測序數(shù)據分析服務。重慶二代測序單細胞測序數(shù)據分析可視化

深度的單細胞測序數(shù)據解讀助力醫(yī)療健康大時代,。天津10X單細胞測序百萬通量平臺

10X Genomics和Drop-Seq具有類似的技術原理,。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠，一列縱向孔道輸入細胞,，凝膠微珠與細胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上,，并通過微流控技術，將之輸入到第二縱向孔道,，即油相孔道中,。這時候，就形成了一個個油滴并輸出并收集在EP管中,。每一個油滴中會落入一個細胞以及一個凝膠微珠,，那么在每一個凝膠微珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手,，構成我們的捕獲凝膠微珠,。而這個凝膠微珠抓手就會使用oligo dT抓住mRNA構建文庫。天津10X單細胞測序百萬通量平臺

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