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西安10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)機(jī)構(gòu)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-06-13

針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序的細(xì)胞上樣數(shù),,為什么不建議捕獲到的細(xì)胞數(shù)量越高越好,?一味地追求高數(shù)量的細(xì)胞捕獲可能會(huì)存在一些問題,。例如在上機(jī)細(xì)胞懸液濃度固定時(shí),如果目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)增加到8000甚至10000,,上樣細(xì)胞懸液體積勢(shì)必增加,,在細(xì)胞懸液質(zhì)量不是很理想(細(xì)胞活性<90%、碎片率>5%,、結(jié)團(tuán)率均>5%)的情況下,,引入的背景信號(hào)會(huì)增加,分析結(jié)果不理想的直接體現(xiàn)包括:cell,、non-cell無法有效區(qū)分和Fraction reads in cells偏低,。當(dāng)cell和non-cell無法有效區(qū)分時(shí),會(huì)使得數(shù)據(jù)出現(xiàn)假陽(yáng)性和假陰性結(jié)果,!當(dāng)目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)很大時(shí),,多細(xì)胞率會(huì)增加,數(shù)據(jù)分析時(shí),,此部分“cell”表現(xiàn)為基因檢測(cè)數(shù)和UMI檢測(cè)數(shù)是正常cell的N倍(N是一個(gè)GEM包裹的細(xì)胞數(shù)),,導(dǎo)致所有細(xì)胞的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)(單個(gè)細(xì)胞基因檢測(cè)中位數(shù)、單個(gè)細(xì)胞UMI檢測(cè)中位數(shù))虛高,。此部分“cell”雖然可以通過設(shè)置數(shù)據(jù)分析閾值進(jìn)行過濾,,但是容易會(huì)有此類數(shù)據(jù)的殘留和正常高基因檢測(cè)細(xì)胞的人為去除!烈冰開展了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組,、單細(xì)胞多組學(xué)以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案,。西安10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)機(jī)構(gòu)

10× Genomics單細(xì)胞方案要求使用具有較高活性的單細(xì)胞懸液。在實(shí)際實(shí)驗(yàn)中,,我們發(fā)現(xiàn)因?yàn)闃颖绢愋秃椭苽鋯渭?xì)胞懸液方法的不同,,容易出現(xiàn)單細(xì)胞懸液中死亡細(xì)胞的比例較高的情況。去除單細(xì)胞懸液中的死細(xì)胞和其他污染物對(duì)獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)是至關(guān)重要的,。這是因?yàn)?,死亡的?xì)胞易裂解導(dǎo)致其中的RNA釋放出來。這種cell-free RNA會(huì)導(dǎo)致檢測(cè)的背景噪聲,,并會(huì)影響單細(xì)胞數(shù)據(jù)的質(zhì)量,。因此當(dāng)樣本活性較差時(shí),對(duì)細(xì)胞懸液中細(xì)胞活性檢測(cè)后,,需要進(jìn)行一般死細(xì)胞去除的工作(一般懸液活性小于70%時(shí)考慮此操作),,以保證較高的上機(jī)捕獲細(xì)胞的質(zhì)量。濟(jì)南10X單細(xì)胞測(cè)序ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測(cè)序的龐大世界,。

單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)再樣本細(xì)胞上機(jī)分選簽,,需要對(duì)細(xì)胞數(shù)量、細(xì)胞活性進(jìn)準(zhǔn)判斷,,這對(duì)Single Cell分選標(biāo)記,、建庫(kù),、下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細(xì)胞計(jì)數(shù)偏高,,將會(huì)影響建庫(kù)的成功率,;計(jì)數(shù)偏低,則會(huì)提高雙細(xì)胞的比例,;而細(xì)胞活率過低,,就會(huì)使測(cè)序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣,因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要,。而在鋪板過程中,,由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果,。因此烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞分選平臺(tái)配套了專門定制的電動(dòng)移液器,,其具有Prime Treat、Cell Load,、Bead Load、Wash,、Lysis,、Retrieval多種操作模式,來對(duì)應(yīng)各種不同的操作,。通過已經(jīng)設(shè)定的程序來控制液體的流速,,大幅度降低人為操作習(xí)慣帶來的差異,保證實(shí)驗(yàn)操作的一致性,。

烈冰生物成立于2010年,,與時(shí)俱進(jìn),堅(jiān)持為科研學(xué)者提供國(guó)際前沿的高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)和深度的生物信息數(shù)據(jù)分析服務(wù),,已逐步發(fā)展為單細(xì)胞多組學(xué)檢測(cè)服務(wù)****,。專注于“單細(xì)胞測(cè)序系列技術(shù)服務(wù)”的專精領(lǐng)域,在上海,、北京,、廣州、西安和江西等地?fù)碛袛?shù)千平辦公場(chǎng)所,,并布局多中心產(chǎn)品研發(fā)生產(chǎn)基地和營(yíng)銷,、運(yùn)營(yíng)中心。2016年起連續(xù)被評(píng)為上海市****,,60+項(xiàng)自主知識(shí)產(chǎn)權(quán),,轉(zhuǎn)化率近80%。產(chǎn)品覆蓋從單細(xì)胞測(cè)序,,核測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué),,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序等多組學(xué)聯(lián)合的實(shí)驗(yàn)+數(shù)據(jù)分析全流程服務(wù)平臺(tái)。為600+國(guó)內(nèi)高校和醫(yī)院,、5000+深度合作學(xué)者用戶,、10000+生命科學(xué)探索的重要科研項(xiàng)目在醫(yī)藥開發(fā)、科學(xué)研究,、醫(yī)學(xué)及臨床研究,,疾病分子標(biāo)志物篩選、生命和神經(jīng)發(fā)育研究等提供多層次,、多組學(xué)檢測(cè)服務(wù)和解決方案,,助力300+CNS國(guó)際學(xué)術(shù)期刊文章發(fā)表,30+篇單細(xì)胞技術(shù)聯(lián)合(助力)發(fā)文,,IF 10+文章占比>65%,。十二年測(cè)序經(jīng)驗(yàn),烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)領(lǐng)域的佼佼者,。

烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),,深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,;從操作便捷,、結(jié)果可視化、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,,加速科研進(jìn)程!此外,,烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器(Single Cell Browser),,不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,還是可以實(shí)現(xiàn)三維立體化展示的軟件,。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,,專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您,詳情請(qǐng)咨詢烈冰生物,。烈冰生物全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序通過雙文庫(kù)構(gòu)建,,實(shí)現(xiàn)多種RNA的一網(wǎng)打盡。武漢10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)機(jī)構(gòu)

高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序一次顛覆性的改變,,一次對(duì)幾十萬到幾百萬條核酸序列進(jìn)行測(cè)定,。西安10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)機(jī)構(gòu)

細(xì)胞中基因的表達(dá)是嚴(yán)格按照時(shí)間和空間順序發(fā)生,因此細(xì)胞類型和基因表達(dá)具有時(shí)間特異性和空間特異性,。時(shí)間特異性可以通過收集不同時(shí)間點(diǎn)的樣本進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序來分析,。但是單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(scRNA-Seq)在單細(xì)胞懸液制備的過程中破壞了細(xì)胞的空間結(jié)構(gòu),無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個(gè)問題,,其以點(diǎn)陣形式記錄組織切片細(xì)胞的空間信息,,在保留組織形態(tài)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,獲得細(xì)胞/基因的空間表達(dá)特異性,。西安10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)機(jī)構(gòu)

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,,以科技創(chuàng)新實(shí)現(xiàn)***管理的追求。烈冰生物作為生物科技,、醫(yī)藥科技,、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,,市場(chǎng)營(yíng)銷策劃,,市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查、社會(huì)調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測(cè)驗(yàn)),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),,計(jì)算機(jī),、軟件及耗材(除專控),,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】的企業(yè)之一,,為客戶提供良好的單細(xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,。烈冰生物不斷開拓創(chuàng)新,追求出色,,以技術(shù)為先導(dǎo),,以產(chǎn)品為平臺(tái),以應(yīng)用為重點(diǎn),,以服務(wù)為保證,,不斷為客戶創(chuàng)造更高價(jià)值,提供更優(yōu)服務(wù),。烈冰生物創(chuàng)始人陳岱,,始終關(guān)注客戶,創(chuàng)新科技,,竭誠(chéng)為客戶提供良好的服務(wù),。