對(duì)于單細(xì)胞測(cè)序而言,，常常需要先構(gòu)建細(xì)胞圖譜,，在此基礎(chǔ)上再開(kāi)展后續(xù)各項(xiàng)分析，并且數(shù)據(jù)分析時(shí)以細(xì)胞聚類(lèi)（cell cluster）為討論對(duì)象,，而不是像常規(guī)Bulk測(cè)序一樣以組別為分析對(duì)象,，因此單細(xì)胞測(cè)序項(xiàng)目對(duì)樣本入組要求沒(méi)有Bulk測(cè)序那樣嚴(yán)格，但是單細(xì)胞測(cè)序,，特別是目的為圖譜研究時(shí),，需要通過(guò)提高樣本復(fù)雜度（增加樣本數(shù)），盡可能的構(gòu)建某一疾病類(lèi)型,、群體細(xì)胞圖譜信息,。因此，單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)時(shí)首先需要保證生物學(xué)重復(fù),，不同樣本來(lái)源的樣本建議單獨(dú)進(jìn)行細(xì)胞解離和捕獲,、建庫(kù),、測(cè)序，以保證捕獲到足夠的細(xì)胞數(shù),，單個(gè)樣本分別捕獲細(xì)胞時(shí),，后續(xù)分析除了整體分析以外，還可以做單樣本分析,，保證分析的完備準(zhǔn)確性,。烈冰實(shí)驗(yàn)室包含從樣本處理到測(cè)序下機(jī)的全套實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。陜西10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序多組學(xué)測(cè)序

烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),，針對(duì)龐大的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù),，能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類(lèi)型鑒定的快、精,、準(zhǔn)：一鍵導(dǎo)入gene list構(gòu)建個(gè)性化基因列表,；輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Feature plot；任意修改Cluster的顏色和名稱(chēng)助力高效鑒定細(xì)胞類(lèi)型,；一鍵獲得t-SNE圖,、Heatmap和Violin圖：輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖、Heatmap,、Violin圖,，還可以通過(guò)調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來(lái)調(diào)節(jié)美觀,。平臺(tái)上線300+task自主分析工具,、50+pipeline工作流模板，幫助烈冰生信分析團(tuán)隊(duì)和自主分析用戶實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動(dòng)化分析,，節(jié)省工作時(shí)間并提升整體工作效率,。上海二代測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序百萬(wàn)通量平臺(tái)從樣本處理到終端數(shù)據(jù)分析，只要您需要,，烈冰提供全流程的無(wú)憂服務(wù),。

10X Genomics 是一種基于 drop 的微流控技術(shù)，液體在配套芯片中的微管道中流動(dòng),，因此細(xì)胞直徑會(huì)受到芯片中微管道直徑的限制,，微流體通道的直徑約為 50 ~ 60 um，因此捕獲細(xì)胞的直徑不能超過(guò) 40um,。當(dāng)細(xì)胞直徑過(guò)大時(shí),，容易出現(xiàn)管道堵塞，造成GEM生成失敗,，對(duì)于神經(jīng)科學(xué)研究和心血管疾病研究的老師而言,，準(zhǔn)備采用單細(xì)胞技術(shù)用于課題研究的時(shí)候，往往會(huì)遇到一個(gè)尷尬的問(wèn)題，就是目標(biāo)細(xì)胞,，例如神經(jīng)元細(xì)胞,、成熟心肌細(xì)胞由于體積過(guò)大，不適用于 10X 單細(xì)胞技術(shù),。其中神經(jīng)元細(xì)胞的直徑很大,，直接超過(guò)了芯片中管道的直徑，雖然心肌細(xì)胞直徑低于 50um,，但是成熟心肌細(xì)胞的長(zhǎng)度很長(zhǎng),，有可能堵塞通道造成實(shí)驗(yàn)失敗，這也是為什么現(xiàn)在很多已發(fā)表的心臟單細(xì)胞文章,，主要研究方向是心臟發(fā)育的原因了,，主要還是因?yàn)槲窗l(fā)育成熟的心肌細(xì)胞比較小，不會(huì)出現(xiàn)堵塞管道的風(fēng)險(xiǎn),。因此可以考慮組織解離后過(guò) 40um 濾網(wǎng),，過(guò)濾掉大細(xì)胞，避免出現(xiàn)管道堵塞,、實(shí)驗(yàn)失敗的風(fēng)險(xiǎn),。此種方案的缺點(diǎn)是大細(xì)胞被過(guò)濾掉,，丟失相關(guān)細(xì)胞數(shù)據(jù),；另外組織解離獲得高質(zhì)量細(xì)胞懸液以后，繼續(xù)做細(xì)胞裂解抽細(xì)胞核,，開(kāi)展細(xì)胞核測(cè)序,。具體可訪問(wèn)烈冰官網(wǎng)給我們留言，烈小冰將安排專(zhuān)業(yè)技術(shù)為您詳細(xì)解答,。

科研的魅力之處,，在于無(wú)窮盡的探尋生命的本底，通過(guò)單細(xì)胞測(cè)序,，我們對(duì)組織的分子基礎(chǔ)的研究也從初級(jí)到深層,，并在單細(xì)胞層面逐漸達(dá)成一致，那么不禁要問(wèn)一句,，組織的空間位置到底重不重要,？空間異質(zhì)性是功能的關(guān)鍵特征，細(xì)胞的位置信息更能反應(yīng)細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控機(jī)制和細(xì)胞譜系發(fā)生過(guò)程,。因此時(shí)間和空間即像組織的AB面,，而不可否認(rèn)的是，此時(shí)空間坐標(biāo)的記錄,，像一個(gè)還未長(zhǎng)大的娃娃,，雖未觸及分子基礎(chǔ)研究的深層，但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個(gè)高峰?；驕y(cè)序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實(shí)驗(yàn)室研究逐漸演變到臨床應(yīng)用,，是下一個(gè)改變世界的技術(shù)。

從單細(xì)胞測(cè)序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類(lèi)型的功能解析,，越來(lái)越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角,。通過(guò)單細(xì)胞多組學(xué)——即對(duì)不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個(gè)單細(xì)胞來(lái)源中檢測(cè)多種細(xì)胞特征。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá),、細(xì)胞表面蛋白表達(dá),、免疫組庫(kù)序列（包括T細(xì)胞和B細(xì)胞受體）以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開(kāi)放染色質(zhì)區(qū)域。隨著單個(gè)實(shí)驗(yàn)可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),，研究人員的獲益更多,，包括保留珍貴樣本、提高生產(chǎn)力,、減少因批次效應(yīng)引起的錯(cuò)誤,，并節(jié)省更多的高科技資源（從資助基金到人員時(shí)間）。單細(xì)胞測(cè)序因其強(qiáng)大的探究疾病--細(xì)胞--基因的關(guān)系,，一度成為高通量測(cè)序技術(shù)的“天花板”,。廈門(mén)10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序

烈冰生物首批引進(jìn) Chromium X 平臺(tái)，開(kāi)啟百萬(wàn)級(jí)通量單細(xì)胞測(cè)序新時(shí)代,。陜西10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序多組學(xué)測(cè)序

相對(duì)于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問(wèn)題,，10X平臺(tái)普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1000-20000不等的測(cè)序細(xì)胞量，這個(gè)量級(jí)的測(cè)序細(xì)胞量已經(jīng)可以說(shuō)能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類(lèi)型,。因此,，這兩種技術(shù)對(duì)于基于基因表達(dá)進(jìn)行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上，無(wú)論是從細(xì)胞數(shù)量上來(lái)說(shuō)還是表達(dá)檢測(cè)可靠性來(lái)說(shuō),，都會(huì)更實(shí)用,。同時(shí)依托Random Cell Label技術(shù)，使得其對(duì)于NovaSeq,、HiSeq X Ten,、Hiseq 4000等設(shè)備存在的Index hooping現(xiàn)象，相對(duì)于Smart-Seq數(shù)據(jù)來(lái)說(shuō),，影響幾乎可以忽略不計(jì)（10X Genomics官方網(wǎng)站曾給出hooping測(cè)試結(jié)果,，顯示無(wú)影響。陜西10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序多組學(xué)測(cè)序

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