為什么需要單細(xì)胞分辨率,? 生物學(xué)就像宇宙一樣。它非常復(fù)雜,,有許多獨特的單體,,也就是細(xì)胞。這些細(xì)胞相互作用并扮演不同的角色,,在更大的體系中構(gòu)建并驅(qū)動多個過程,。就像伽利略探索宇宙的努力一樣,發(fā)現(xiàn)和定義這些細(xì)胞也需要高分辨率的工具,,才能解開促成生物學(xué)復(fù)雜性的基因表達(dá)異質(zhì)性,。單細(xì)胞測序能夠在以一個細(xì)胞為功能單位中開展生物學(xué)研究,闡明具體細(xì)節(jié),,構(gòu)建出一幅更大,、更精細(xì)的圖譜,說明導(dǎo)致產(chǎn)生某種外在表型的不同類型的分子和細(xì)胞之間是如何相互作用的:患者為什么會復(fù)發(fā),?是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問題,。過去的十年,我們是知識的承載者,;現(xiàn)在,,我們在努力構(gòu)建醫(yī)學(xué)的大數(shù)據(jù)時代,;未來我們將重新定義知識形態(tài)!北京10X Genomics單細(xì)胞測序平臺
科研的魅力之處,,在于無窮盡的探尋生命的本底,,通過單細(xì)胞測序,我們對組織的分子基礎(chǔ)的研究也從初級到深層,,并在單細(xì)胞層面逐漸達(dá)成一致,,那么不禁要問一句,組織的空間位置到底重不重要,?空間異質(zhì)性是功能的關(guān)鍵特征,,細(xì)胞的位置信息更能反應(yīng)細(xì)胞命運調(diào)控機(jī)制和細(xì)胞譜系發(fā)生過程。因此時間和空間即像組織的AB面,,而不可否認(rèn)的是,,此時空間坐標(biāo)的記錄,像一個還未長大的娃娃,,雖未觸及分子基礎(chǔ)研究的深層,,但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個高峰。合肥上海烈冰單細(xì)胞測序烈冰科技成立10余年,,為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù),。
單細(xì)胞測序結(jié)果動輒上百G數(shù)據(jù)量,龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺和分析能力有著很高的要求,,首先針對下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié):單細(xì)胞測序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列,,不可避免的會出現(xiàn)低質(zhì)量的測序結(jié)果,存在各種情況的序列污染,。因此序列過濾及質(zhì)量評估就會變得極為重要,。序列質(zhì)量主要通過測序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來表征,即堿基測序結(jié)果的錯誤率在1% / 0.1%以下的比例,。理想的測序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30,。保證數(shù)據(jù)獲得后的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性,為后續(xù)細(xì)胞類型鑒定和功能分析打下堅實基礎(chǔ),。
相對于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問題,,10X平臺普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1000-20000不等的測序細(xì)胞量,這個量級的測序細(xì)胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型,。因此,,這兩種技術(shù)對于基于基因表達(dá)進(jìn)行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上,無論是從細(xì)胞數(shù)量上來說還是表達(dá)檢測可靠性來說,,都會更實用,。同時依托Random Cell Label技術(shù),使得其對于NovaSeq,、HiSeq X Ten,、Hiseq 4000等設(shè)備存在的Index hooping現(xiàn)象,相對于Smart-Seq數(shù)據(jù)來說,,影響幾乎可以忽略不計(10X Genomics官方網(wǎng)站曾給出hooping測試結(jié)果,,顯示無影響。烈冰專精單細(xì)胞多組學(xué)測序領(lǐng)域,。
烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業(yè),,為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù),先后經(jīng)歷基因芯片時代,、基因測序,、轉(zhuǎn)錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來,,單細(xì)胞測序進(jìn)入發(fā)展的快車道,,烈冰作為國內(nèi)首批引進(jìn)單細(xì)胞實驗雙平臺的公司,依托自主研發(fā)的NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)分析平臺,,為用戶提供一站式全流程的單細(xì)胞測序服務(wù)和解決方案,。4年的單細(xì)胞技術(shù)的積累,烈冰已具備大鼠,、小鼠,、斑馬魚、猴,、裸鼴鼠,、水稻、擬南芥等10+物種,,皮膚,、腦、脂肪,、心臟,、花序等50+組織類型,100+細(xì)胞類型,,1000+靶標(biāo)基因,,10000+樣本處理經(jīng)驗。從樣本處理到終端數(shù)據(jù)分析,,只要您需要,,烈冰提供全流程的無憂服務(wù)。合肥上海烈冰單細(xì)胞測序
烈冰測序服務(wù)已助力300余篇國際期刊研究文章發(fā)表,。北京10X Genomics單細(xì)胞測序平臺
作為單細(xì)胞測序的一個重要里程碑,,10x genomic公司于2016年2月推出10x Chromium Single Cell Gene Expression Solution,此平臺整合了儀器,、試劑盒和信息學(xué)軟件,,能精確對接illumina測序儀,,因此可實現(xiàn)大量大細(xì)胞的快速高效標(biāo)記、測序和分析,,獲得單細(xì)胞水平的基因表達(dá)譜和差異情況,,并通過對復(fù)雜細(xì)胞群體進(jìn)行深入細(xì)致分析,繪制大規(guī)模單細(xì)胞表達(dá)圖譜,。 以量化細(xì)胞內(nèi)的群體異質(zhì)性,,并逐個鑒定細(xì)胞類型、細(xì)胞狀態(tài)和動態(tài)細(xì)胞躍遷,。除了有望鑒定新的細(xì)胞亞型和稀有細(xì)胞群體,,單細(xì)胞技術(shù)還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動態(tài)和基因調(diào)控關(guān)系。北京10X Genomics單細(xì)胞測序平臺
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技,、醫(yī)藥科技,、信息科技、計算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,,市場營銷策劃,,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),,計算機(jī),、軟件及耗材(除專控),,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項目,,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】的公司,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實,、誠實可信的企業(yè),。烈冰生物深耕行業(yè)多年,始終以客戶的需求為向?qū)?,為客戶提?**的單細(xì)胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序,。烈冰生物致力于把技術(shù)上的創(chuàng)新展現(xiàn)成對用戶產(chǎn)品上的貼心,為用戶帶來良好體驗。烈冰生物始終關(guān)注自身,,在風(fēng)云變化的時代,,對自身的建設(shè)毫不懈怠,高度的專注與執(zhí)著使烈冰生物在行業(yè)的從容而自信,。