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吉林10X Chromium X單細胞測序平臺

來源: 發(fā)布時間:2022-06-15

相對于Smart-Seq技術在細胞數(shù)量上的問題,,10X平臺普遍提供的細胞數(shù)量都在1000-20000不等的測序細胞量,,這個量級的測序細胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此,,這兩種技術對于基于基因表達進行準確細胞分型上,無論是從細胞數(shù)量上來說還是表達檢測可靠性來說,,都會更實用,。同時依托Random Cell Label技術,使得其對于NovaSeq,、HiSeq X Ten,、Hiseq 4000等設備存在的Index hooping現(xiàn)象,相對于Smart-Seq數(shù)據(jù)來說,,影響幾乎可以忽略不計(10X Genomics官方網(wǎng)站曾給出hooping測試結果,,顯示無影響。烈冰生物為您提供多平臺一站式全流程單細胞測序服務,。吉林10X Chromium X單細胞測序平臺

10X Genomics和Drop-Seq具有類似的技術原理,。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,一列縱向孔道輸入細胞,,凝膠微珠與細胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上,,并通過微流控技術,將之輸入到第二縱向孔道,,即油相孔道中,。這時候,就形成了一個個油滴并輸出并收集在EP管中,。每一個油滴中會落入一個細胞以及一個凝膠微珠,,那么在每一個凝膠微珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,,構成我們的捕獲凝膠微珠,。而這個凝膠微珠抓手就會使用oligo dT抓住mRNA構建文庫。溫州單細胞測序多組學測序烈冰一站式單細胞測序服務:立足科學研究,,解碼生命本質,。

單細胞多組學帶來的突破 單細胞測序方法不但改進了實驗過程,還幫助科學家在健康和疾病研究的關鍵領域取得新進展,。那些過去從轉錄平均值或單項參數(shù)讀取中無法獲得的新發(fā)現(xiàn)正在改變我們對傳染病,、神經(jīng)退行性疾病等疾病的認識。從鑒定新的細胞類型和狀態(tài),,到揭開疾病用藥應答和耐藥的潛在機制,,單細胞測序正在推動突破性的研究,有望改變生物學和醫(yī)療,。無論是無法解釋的疾病,,還是人體或自然界中尚未探索的系統(tǒng),曾經(jīng)模糊的東西正變得越來越清晰,。隨著我們邁向科學的未來,,我們手頭的工具就像伽利略的望遠鏡一樣能夠提高焦距和放大倍數(shù),,而定義科學未來的知識新深度是十年前的人們所無法想象的。

Single Cell Sequencing技術,,即利用優(yōu)化后的高通量測序技術(NGS,,Next Generation Sequencing)分析每一個單個細胞的序列信息,從而更高分辨率地揭示細胞間的細胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況,。那么問題來了,,如何獲得單個細胞?如果無法獲得單個細胞這一切都是不成立的,;如何獲得大批量的單個細胞,?單個組織細胞群體通常在百萬級別以上,如果被檢測的測序細胞數(shù)量過小精確度不足,;如何低成本地獲得大批量單個細胞,?單細胞測序成本非常高,尤其是需要測2000~3000個以上的細胞的時候,,如果單個細胞的分選成本也很高,,技術根本無法普及。所以,,正因為這些問題的存在使得高通量測序在單個細胞測序應用中的普及度一直不足,,直到幾個突破性技術的誕生。烈冰實驗室包含從樣本處理到測序下機的全套實驗平臺,。

為什么需要單細胞分辨率,? 生物學就像宇宙一樣。它非常復雜,,有許多獨特的單體,,也就是細胞。這些細胞相互作用并扮演不同的角色,,在更大的體系中構建并驅動多個過程,。就像伽利略探索宇宙的努力一樣,發(fā)現(xiàn)和定義這些細胞也需要高分辨率的工具,,才能解開促成生物學復雜性的基因表達異質性,。單細胞測序能夠在以一個細胞為功能單位中開展生物學研究,闡明具體細節(jié),,構建出一幅更大,、更精細的圖譜,說明導致產(chǎn)生某種外在表型的不同類型的分子和細胞之間是如何相互作用的:患者為什么會復發(fā),?是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問題,。烈冰生物首批引進 Chromium X 平臺,開啟百萬級通量單細胞測序新時代,。烈冰生物單細胞測序多組學測序

ATCG堿基的排列組合構成了測序的龐大世界,。吉林10X Chromium X單細胞測序平臺

針對單細胞測序數(shù)據(jù)分析時的reads數(shù)、基因表達量及細胞數(shù)量判定過程中:以捕獲5000個細胞,、100G的測序量為標準,,每個細胞的reads數(shù)大約在50k左右;每個細胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細胞類型,,例如成熟的B,,T,粒細胞數(shù)量較多的組織中,,由于該類型細胞表達的基因數(shù)普遍較少,,導致基因中位數(shù)下降。而某些疾病組織,、或者體外培養(yǎng)的如干細胞等,,他們的基因表達數(shù)較高,甚至可以超過1W,,這就導致該類樣本基因中位數(shù)非常高,。因此,我們對細胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認時,,需要考察實際組織的細胞組成,。吉林10X Chromium X單細胞測序平臺

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司專注技術創(chuàng)新和產(chǎn)品研發(fā),發(fā)展規(guī)模團隊不斷壯大,。公司目前擁有較多的高技術人才,,以不斷增強企業(yè)重點競爭力,加快企業(yè)技術創(chuàng)新,,實現(xiàn)穩(wěn)健生產(chǎn)經(jīng)營,。公司業(yè)務范圍主要包括:單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉錄組測序,,單細胞多組學測序等。公司奉行顧客至上,、質量為本的經(jīng)營宗旨,,深受客戶好評。公司深耕單細胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序,,正積蓄著更大的能量,,向更廣闊的空間、更寬泛的領域拓展,。