關(guān)于單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)樣本制備,,這與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致,也就是通過(guò)酶促或機(jī)械消化,、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個(gè)樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液,。隨后是細(xì)胞計(jì)數(shù)和質(zhì)量控制步驟,以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞,,并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片,。如有必要,,您還可以使用抗體對(duì)樣本進(jìn)行染色,標(biāo)記細(xì)胞表面蛋白或其他生物分析物,,或者通過(guò)FACS來(lái)富集感興趣的細(xì)胞類型,。解離樣本時(shí)采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)而定。也許需要額外的制備步驟,,具體取決于組織質(zhì)量,、樣本豐度、細(xì)胞大小,,以及是否需要提取出細(xì)胞核進(jìn)行染色質(zhì)可接近性分析,。無(wú)論具體的考慮因素如何,所有樣本類型都遵循同一個(gè)基本原則,,那就是生成高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液,。單細(xì)胞科聯(lián)合空間轉(zhuǎn)錄組,展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達(dá)情況,,揭示精細(xì)病理區(qū)域中“喚醒”的信號(hào)通路,。西安10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)
對(duì)于單細(xì)胞測(cè)序而言,常常需要先構(gòu)建細(xì)胞圖譜,,在此基礎(chǔ)上再開展后續(xù)各項(xiàng)分析,,并且數(shù)據(jù)分析時(shí)以細(xì)胞聚類(cell cluster)為討論對(duì)象,而不是像常規(guī)Bulk測(cè)序一樣以組別為分析對(duì)象,,因此單細(xì)胞測(cè)序項(xiàng)目對(duì)樣本入組要求沒(méi)有Bulk測(cè)序那樣嚴(yán)格,,但是單細(xì)胞測(cè)序,特別是目的為圖譜研究時(shí),,需要通過(guò)提高樣本復(fù)雜度(增加樣本數(shù)),,盡可能的構(gòu)建某一疾病類型、群體細(xì)胞圖譜信息,。因此,,單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)時(shí)首先需要保證生物學(xué)重復(fù),不同樣本來(lái)源的樣本建議單獨(dú)進(jìn)行細(xì)胞解離和捕獲,、建庫(kù),、測(cè)序,以保證捕獲到足夠的細(xì)胞數(shù),,單個(gè)樣本分別捕獲細(xì)胞時(shí),,后續(xù)分析除了整體分析以外,還可以做單樣本分析,,保證分析的完備準(zhǔn)確性,。廣州二代測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序一次顛覆性的改變,一次對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條核酸序列進(jìn)行測(cè)定,。
多樣本數(shù)據(jù)合并:Fraction of Reads Kept:合并樣本時(shí),,各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計(jì)算出來(lái)的數(shù)據(jù)利用率,。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,需要進(jìn)行Downsample處理,,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測(cè)序深度標(biāo)化到同一水平,,從而避免因測(cè)序深度差異導(dǎo)致的基因檢測(cè)數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異,。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),,深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,;從操作便捷,、結(jié)果可視化、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,,加速科研進(jìn)程!
烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測(cè)序行業(yè),,為科研學(xué)者提供專注的測(cè)序數(shù)據(jù)分析服務(wù),先后經(jīng)歷基因芯片時(shí)代,、基因測(cè)序,、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序時(shí)代...在科技日新月異的洪流中始終獨(dú)占鰲頭。2018年以來(lái),,單細(xì)胞測(cè)序進(jìn)入發(fā)展的快車道,,烈冰作為國(guó)內(nèi)首批引進(jìn)單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)雙平臺(tái)的公司,依托自主研發(fā)的NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),,為用戶提供一站式全流程的單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)和解決方案,。4年的單細(xì)胞技術(shù)的積累,烈冰已具備大鼠,、小鼠,、斑馬魚、猴,、裸鼴鼠,、水稻、擬南芥等10+物種,,皮膚,、腦、脂肪,、心臟,、花序等50+組織類型,100+細(xì)胞類型,,1000+靶標(biāo)基因,,10000+樣本處理經(jīng)驗(yàn),。烈冰生物為您提供多平臺(tái)一站式全流程單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)。
烈冰生物成立于2010年,,與時(shí)俱進(jìn),,堅(jiān)持為科研學(xué)者提供國(guó)際前沿的高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)和深度的生物信息數(shù)據(jù)分析服務(wù),已逐步發(fā)展為單細(xì)胞多組學(xué)檢測(cè)服務(wù)****,。專注于“單細(xì)胞測(cè)序系列技術(shù)服務(wù)”的專精領(lǐng)域,,在上海、北京,、廣州,、西安和江西等地?fù)碛袛?shù)千平辦公場(chǎng)所,并布局多中心產(chǎn)品研發(fā)生產(chǎn)基地和營(yíng)銷,、運(yùn)營(yíng)中心,。2016年起連續(xù)被評(píng)為上海市****,60+項(xiàng)自主知識(shí)產(chǎn)權(quán),,轉(zhuǎn)化率近80%,。產(chǎn)品覆蓋從單細(xì)胞測(cè)序,核測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué),,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序等多組學(xué)聯(lián)合的實(shí)驗(yàn)+數(shù)據(jù)分析全流程服務(wù)平臺(tái)。為600+國(guó)內(nèi)高校和醫(yī)院,、5000+深度合作學(xué)者用戶,、10000+生命科學(xué)探索的重要科研項(xiàng)目在醫(yī)藥開發(fā)、科學(xué)研究,、醫(yī)學(xué)及臨床研究,,疾病分子標(biāo)志物篩選、生命和神經(jīng)發(fā)育研究等提供多層次,、多組學(xué)檢測(cè)服務(wù)和解決方案,,助力300+CNS國(guó)際學(xué)術(shù)期刊文章發(fā)表,30+篇單細(xì)胞技術(shù)聯(lián)合(助力)發(fā)文,,IF 10+文章占比>65%,。烈冰生物成立于2010年,專注于單細(xì)胞測(cè)序領(lǐng)域科研服務(wù),。南昌二代測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序
烈冰科技成立10余年,,為科研學(xué)者提供專注的測(cè)序數(shù)據(jù)分析服務(wù)。西安10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)
針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析時(shí)的reads數(shù),、基因表達(dá)量及細(xì)胞數(shù)量判定過(guò)程中:以捕獲5000個(gè)細(xì)胞,、100G的測(cè)序量為標(biāo)準(zhǔn),每個(gè)細(xì)胞的reads數(shù)大約在50k左右;每個(gè)細(xì)胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細(xì)胞類型,,例如成熟的B,,T,粒細(xì)胞數(shù)量較多的組織中,,由于該類型細(xì)胞表達(dá)的基因數(shù)普遍較少,,導(dǎo)致基因中位數(shù)下降。而某些疾病組織,、或者體外培養(yǎng)的如干細(xì)胞等,,他們的基因表達(dá)數(shù)較高,甚至可以超過(guò)1W,,這就導(dǎo)致該類樣本基因中位數(shù)非常高,。因此,我們對(duì)細(xì)胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認(rèn)時(shí),,需要考察實(shí)際組織的細(xì)胞組成,。西安10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技、醫(yī)藥科技,、信息科技,、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,市場(chǎng)營(yíng)銷策劃,,市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查,、社會(huì)調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測(cè)驗(yàn)),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),,計(jì)算機(jī),、軟件及耗材(除專控),,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】的公司,是一家集研發(fā),、設(shè)計(jì),、生產(chǎn)和銷售為一體的專業(yè)化公司。烈冰生物作為生物科技,、醫(yī)藥科技,、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,市場(chǎng)營(yíng)銷策劃,,市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查,、社會(huì)調(diào)研、民意調(diào)查,、民意測(cè)驗(yàn)),,從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),計(jì)算機(jī),、軟件及耗材(除??兀浖_發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】的企業(yè)之一,,為客戶提供良好的單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序。烈冰生物繼續(xù)堅(jiān)定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路,,既要實(shí)現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長(zhǎng),,又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域,實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破,。烈冰生物始終關(guān)注自身,,在風(fēng)云變化的時(shí)代,對(duì)自身的建設(shè)毫不懈怠,,高度的專注與執(zhí)著使烈冰生物在行業(yè)的從容而自信,。