基于10X Next GEM技術(shù),單細(xì)胞測序一次實驗可以同時檢測近萬個細(xì)胞,,可在一個樣本中同時獲3'端mRNA表達(dá)譜,、如需和免疫組庫(TCR和BCR)的數(shù)據(jù)進(jìn)行聯(lián)合時,即某些研究還需結(jié)合基因的表達(dá)譜和V(D)J數(shù)據(jù)進(jìn)行復(fù)雜組織樣本的是影響免疫應(yīng)答分析,,監(jiān)測免疫療法的效果,,研究疾病發(fā)生,、發(fā)展的分子機(jī)制,可進(jìn)行單細(xì)胞免疫組庫測序: 烈冰單細(xì)胞免疫組庫平臺具備:1000+項目經(jīng)驗,,一次實驗可同時獲取1000-20000個細(xì)胞的文庫構(gòu)建,,獲得轉(zhuǎn)錄組和免疫組數(shù)據(jù); 具備完善的免疫組庫測序和實驗質(zhì)控流程,,獲取V(D)J全長序列的配對信息,;豐富的免疫組庫測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗,實現(xiàn)專屬個性化數(shù)據(jù)分析服務(wù),,搭配單細(xì)胞分析云平臺,,一鍵導(dǎo)出交互性的動態(tài)結(jié)果報告。烈冰實驗室包含從樣本處理到測序下機(jī)的全套實驗平臺,。陜西高通量測序單細(xì)胞測序技術(shù)支持
烈冰與國內(nèi)高校,、研究所、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作,,服務(wù)于600+臨床與研究機(jī)構(gòu),,1000+客戶和5000+重要科研項目,助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國際學(xué)術(shù)期刊(不完全統(tǒng)計),,在單細(xì)胞領(lǐng)域,,烈冰助力用戶發(fā)表單細(xì)胞文獻(xiàn)30+篇,總IF>300+,,IF>10+以上文章占比65%以上,,包含Immunity、Nature Cell Biology,、Nature Plants ,、Advanced Science等生物領(lǐng)域國際主流學(xué)術(shù)期刊,已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究,、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機(jī)制,,免疫研究、腦神經(jīng),、白血病,、胚胎發(fā)育、糖尿病,、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等,。陜西10X單細(xì)胞測序平臺烈冰全線實驗平臺滿足超深度、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復(fù)雜疾病研究的測序,。
烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),,深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,;從操作便捷,、結(jié)果可視化,、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,,加速科研進(jìn)程,!此外,烈冰生信團(tuán)隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器(Single Cell Browser),,不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,,還是可以實現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,,專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您,!
多樣本數(shù)據(jù)合并:Fraction of Reads Kept:合并樣本時,各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計算出來的數(shù)據(jù)利用率,。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,,需要進(jìn)行Downsample處理,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測序深度標(biāo)化到同一水平,,從而避免因測序深度差異導(dǎo)致的基因檢測數(shù)量,、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),,深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷,、結(jié)果可視化,、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,,加速科研進(jìn)程!全線搭建10X Genomics Chromium X單細(xì)胞實驗測序平臺,。
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烈冰生物全轉(zhuǎn)錄組測序通過雙文庫構(gòu)建,,實現(xiàn)多種RNA的一網(wǎng)打盡。陜西高通量測序單細(xì)胞測序技術(shù)支持
針對單細(xì)胞測序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié):主要是對細(xì)胞數(shù)量,、基因表達(dá)量,、測序質(zhì)量進(jìn)行整體描述。過濾標(biāo)準(zhǔn):由于細(xì)胞破碎后游離RNA會釋放到環(huán)境或孔中,,并且測序中也會存在一些死細(xì)胞,,導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值。因此,,我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來過濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞,。以10× Genomics為例,細(xì)胞數(shù)量判斷主要通過分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點,,當(dāng)存在多個斜率拐點的時候,,結(jié)合預(yù)期UMI=500時的細(xì)胞數(shù)量進(jìn)行過濾。當(dāng)斜率拐點低于UMI=500的時候,,選擇UMI=500作為細(xì)胞的判斷的標(biāo)準(zhǔn),;否則,選擇和預(yù)期細(xì)胞數(shù)量接近的拐點作為細(xì)胞判斷的位置,。這樣我們能夠有效獲得真實的并且在基因數(shù)量上可以分析的數(shù)據(jù),。陜西高通量測序單細(xì)胞測序技術(shù)支持
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司總部位于江月路999號奇亞特中心22幢,是一家生物科技,、醫(yī)藥科技,、信息科技、計算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,,市場營銷策劃,,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),,計算機(jī),、軟件及耗材(除專控),軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項目,,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】的公司,。烈冰生物深耕行業(yè)多年,始終以客戶的需求為向?qū)?,為客戶提?**的單細(xì)胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序,。烈冰生物繼續(xù)堅定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路,既要實現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長,,又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域,,實現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破。烈冰生物始終關(guān)注自身,,在風(fēng)云變化的時代,,對自身的建設(shè)毫不懈怠,高度的專注與執(zhí)著使烈冰生物在行業(yè)的從容而自信,。