科技的發(fā)展讓單細(xì)胞測序已經(jīng)應(yīng)用于疾病發(fā)展過程中的關(guān)鍵過程和事件,如前病變向惡性的轉(zhuǎn)化,、惡性向轉(zhuǎn)移性的發(fā)展,,以及對多種用藥的反應(yīng)。單細(xì)胞測序技術(shù)作為一個需要將組織解離成為單細(xì)胞懸液,,或者是采用細(xì)胞核捕獲的策略捕獲單細(xì)胞核,,進(jìn)而對于每一個單細(xì)胞或者細(xì)胞核進(jìn)行測序得到結(jié)果的技術(shù),其空間定位信息是丟失的,。這就衍生出了一個問題就是如果單細(xì)胞A與B并不出現(xiàn)在一個組織區(qū)域中他們會互相影響或者轉(zhuǎn)化么,?免疫研究中,兩個具有非常強的PDL1-PD1的配對關(guān)系的細(xì)胞在組織切片上風(fēng)馬牛不相及,,這樣PDL1-PD1的關(guān)系會生效么,?烈冰生物首批引進(jìn) Chromium X 平臺,開啟百萬級通量單細(xì)胞測序新時代,。烈冰單細(xì)胞測序技術(shù)支持
相對于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問題,,10X平臺普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1000-20000不等的測序細(xì)胞量,這個量級的測序細(xì)胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型,。因此,,這兩種技術(shù)對于基于基因表達(dá)進(jìn)行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上,無論是從細(xì)胞數(shù)量上來說還是表達(dá)檢測可靠性來說,,都會更實用,。同時依托Random Cell Label技術(shù),使得其對于NovaSeq,、HiSeq X Ten,、Hiseq 4000等設(shè)備存在的Index hooping現(xiàn)象,相對于Smart-Seq數(shù)據(jù)來說,,影響幾乎可以忽略不計(10X Genomics官方網(wǎng)站曾給出hooping測試結(jié)果,,顯示無影響。重慶二代測序單細(xì)胞測序技術(shù)支持過去的十年,,我們是知識的承載者;現(xiàn)在,,我們在努力構(gòu)建醫(yī)學(xué)的大數(shù)據(jù)時代,;未來我們將重新定義知識形態(tài)!
對于單細(xì)胞測序而言,,常常需要先構(gòu)建細(xì)胞圖譜,,在此基礎(chǔ)上再開展后續(xù)各項分析,并且數(shù)據(jù)分析時以細(xì)胞聚類(cell cluster)為討論對象,,而不是像常規(guī)Bulk測序一樣以組別為分析對象,,因此單細(xì)胞測序項目對樣本入組要求沒有Bulk測序那樣嚴(yán)格,,但是單細(xì)胞測序,特別是目的為圖譜研究時,,需要通過提高樣本復(fù)雜度(增加樣本數(shù)),,盡可能的構(gòu)建某一疾病類型、群體細(xì)胞圖譜信息,。因此,,單細(xì)胞測序?qū)嶒炘O(shè)計時首先需要保證生物學(xué)重復(fù),不同樣本來源的樣本建議單獨進(jìn)行細(xì)胞解離和捕獲,、建庫,、測序,以保證捕獲到足夠的細(xì)胞數(shù),,單個樣本分別捕獲細(xì)胞時,,后續(xù)分析除了整體分析以外,還可以做單樣本分析,,保證分析的完備準(zhǔn)確性,。
RNA測序(RNA-seq)或芯片分析等大量樣本的轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法作為一類強大的工具,可提供混合樣本的基因表達(dá)平均數(shù)據(jù),,幫助科學(xué)家開始揭示這種異質(zhì)性,。隨后,技術(shù)創(chuàng)新的飛躍在單細(xì)胞技術(shù)上達(dá)到新高度——使得科學(xué)家能夠定義細(xì)胞類型特異的基因表達(dá),,從過去的平均數(shù)據(jù)中分辨出真正驅(qū)動其表達(dá)模式的細(xì)胞異質(zhì)性,。這讓研究人員能夠更詳細(xì)地表征組織異質(zhì)性,鑒定稀有細(xì)胞類型,,并逐個細(xì)胞地仔細(xì)分析其分子機制,。當(dāng)獲得了對其研究的生物系統(tǒng)更為真實的圖譜后,研究人員就有了更為堅實可靠的知識基礎(chǔ),,并能在這個基礎(chǔ)上規(guī)劃下一步實驗,,以獲取更深入的可行動見解,。全線搭建10X Genomics Chromium Controller單細(xì)胞測序平臺。
Fluidigm C1平臺作為應(yīng)用于單細(xì)胞測序(Single Cell RNA Sequencing)領(lǐng)域的商業(yè)化分選技術(shù),基于富魯達(dá)(Fluidigm?)的微流控技術(shù),,大約在幾個小時中可以捕獲96個左右的細(xì)胞,進(jìn)行各類的Single-Cell測序建庫,。當(dāng)然,,通量還是比較小。但不可否認(rèn)的是,,現(xiàn)在很多非RNA類Single Cell測序,,仍然在采用這樣的技術(shù),如Single Cell DNA-Seq,,Single Cell ATAC-Seq等,,都是采用此技術(shù)進(jìn)行單細(xì)胞分選后再分別用不同試劑盒建庫,。所以可以說,至少在10X和BD,,或者其他企業(yè)推出有效的Single DNA測序技術(shù)之前,,C1仍然會是市場上的重要組成部分。深度的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)解讀助力醫(yī)療健康大時代,。天津10X Chromium X單細(xì)胞測序服務(wù)
烈冰科技已建立了多種國際和國內(nèi)主流的高通量測序?qū)嶒炂脚_,。烈冰單細(xì)胞測序技術(shù)支持
樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化,在對細(xì)胞進(jìn)行清洗和計數(shù)后,,單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上,,直至用于后續(xù)的上機和文庫制備步驟。在理想狀況下,,一旦制備好樣本,,應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而,,您還有必要了解各類細(xì)胞的不同性質(zhì),,因為這可能會影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時間,以及它們在制備后多久便應(yīng)當(dāng)被盡快使用,。例如,,有些細(xì)胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時間,它們就開始形成團(tuán)塊,。這些團(tuán)塊很難解離,,增加了堵塞的風(fēng)險,而且每個團(tuán)塊被當(dāng)成單細(xì)胞計數(shù),,又降低了細(xì)胞計數(shù)的準(zhǔn)確性,。此外,有些細(xì)胞更加粘稠,,形成團(tuán)塊的速度更快,。對于這些細(xì)胞,必須盡量減少制備和使用之間的時間差,。烈冰單細(xì)胞測序技術(shù)支持
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技,、醫(yī)藥科技、信息科技,、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查,、社會調(diào)研,、民意調(diào)查、民意測驗),,從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),,計算機、軟件及耗材(除??兀?,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】的公司,,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實,、誠實可信的企業(yè)。烈冰生物深耕行業(yè)多年,,始終以客戶的需求為向?qū)?,為客戶提?**的單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序。烈冰生物不斷開拓創(chuàng)新,,追求出色,,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺,,以應(yīng)用為重點,,以服務(wù)為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價值,,提供更優(yōu)服務(wù),。烈冰生物始終關(guān)注自身,在風(fēng)云變化的時代,,對自身的建設(shè)毫不懈怠,,高度的專注與執(zhí)著使烈冰生物在行業(yè)的從容而自信。