單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果動(dòng)輒上百G數(shù)據(jù)量,,龐大的數(shù)據(jù)對(duì)于分析平臺(tái)和分析能力有著很高的要求,,首先針對(duì)下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié):?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列,不可避免的會(huì)出現(xiàn)低質(zhì)量的測(cè)序結(jié)果,,存在各種情況的序列污染,。因此序列過濾及質(zhì)量評(píng)估就會(huì)變得極為重要,。序列質(zhì)量主要通過測(cè)序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來表征,即堿基測(cè)序結(jié)果的錯(cuò)誤率在1% / 0.1%以下的比例,。理想的測(cè)序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30,。保證數(shù)據(jù)獲得后的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性,為后續(xù)細(xì)胞類型鑒定和功能分析打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ),。烈冰生物為您提供多平臺(tái)一站式全流程單細(xì)胞測(cè)序服務(wù),。蘇州10X單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析
針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié):主要是對(duì)細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量,、測(cè)序質(zhì)量進(jìn)行整體描述,。過濾標(biāo)準(zhǔn):由于細(xì)胞破碎后游離RNA會(huì)釋放到環(huán)境或孔中,并且測(cè)序中也會(huì)存在一些死細(xì)胞,,導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值,。因此,,我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來過濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞。以10× Genomics為例,,細(xì)胞數(shù)量判斷主要通過分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點(diǎn),,當(dāng)存在多個(gè)斜率拐點(diǎn)的時(shí)候,結(jié)合預(yù)期UMI=500時(shí)的細(xì)胞數(shù)量進(jìn)行過濾,。當(dāng)斜率拐點(diǎn)低于UMI=500的時(shí)候,,選擇UMI=500作為細(xì)胞的判斷的標(biāo)準(zhǔn);否則,,選擇和預(yù)期細(xì)胞數(shù)量接近的拐點(diǎn)作為細(xì)胞判斷的位置,。這樣我們能夠有效獲得真實(shí)的并且在基因數(shù)量上可以分析的數(shù)據(jù)。成都10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)支持十二年測(cè)序經(jīng)驗(yàn),,烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)領(lǐng)域的佼佼者,。
單細(xì)胞獲得困難,,不同組織要求不盡相同難以搞定,? 烈冰2000+項(xiàng)目消化經(jīng)驗(yàn),100+組織類型解離protocol,,精心設(shè)計(jì)不同組織實(shí)驗(yàn)的解離,、細(xì)胞懸浮實(shí)驗(yàn)體系,確保單細(xì)胞的獲得,。 凍存樣本無法實(shí)驗(yàn),,珍貴樣本無法使用? 烈冰采用國(guó)際認(rèn)可的凍存組織復(fù)蘇技術(shù)以及死細(xì)胞過濾技術(shù),,確保凍存組織使用,。 珍貴樣本,細(xì)胞數(shù)量太少,,消化背景雜無法做單細(xì)胞,? 采用國(guó)際認(rèn)可的10X Genomics,BD Rhapsody雙平臺(tái)模式,,根據(jù)樣本實(shí)際情況和用戶需求提供客觀有效的實(shí)驗(yàn)方案,細(xì)胞量少,,背景雜也能做單細(xì)胞。 單細(xì)胞RNA分類精度不足,,部分細(xì)胞無法細(xì)分,? 烈冰同時(shí)采用單細(xì)胞蛋白質(zhì)組與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù),真正做到從上游到下游的全流程檢測(cè),,確保超高的細(xì)胞分類精度,。
科研的魅力之處,在于無窮盡的探尋生命的本底,,通過單細(xì)胞測(cè)序,,我們對(duì)組織的分子基礎(chǔ)的研究也從初級(jí)到深層,,并在單細(xì)胞層面逐漸達(dá)成一致,那么不禁要問一句,,組織的空間位置到底重不重要,?空間異質(zhì)性是功能的關(guān)鍵特征,細(xì)胞的位置信息更能反應(yīng)細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控機(jī)制和細(xì)胞譜系發(fā)生過程,。因此時(shí)間和空間即像組織的AB面,,而不可否認(rèn)的是,此時(shí)空間坐標(biāo)的記錄,,像一個(gè)還未長(zhǎng)大的娃娃,,雖未觸及分子基礎(chǔ)研究的深層,但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個(gè)高峰,。全線搭建10X Genomics Chromium X單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)測(cè)序平臺(tái),。
所謂的高通量測(cè)序技術(shù),又名大規(guī)模平行測(cè)序,,是將 DNA(或者 cDNA)隨機(jī)片段化,、加接頭,制備測(cè)序文庫(kù),,通過對(duì)文庫(kù)中數(shù)以萬計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng),,檢測(cè)對(duì)應(yīng)的信號(hào),獲取序列信息,。與傳統(tǒng)測(cè)序法(Sanger法等)相比,,高通量測(cè)序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有明顯的優(yōu)勢(shì),又快(兩天)又多(數(shù)百萬克?。?,成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù)。單細(xì)胞測(cè)序是一個(gè)系統(tǒng)的工程,,開展項(xiàng)目前您可能會(huì)先評(píng)估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,,如果匹配,實(shí)驗(yàn)過程如何規(guī)劃,,實(shí)驗(yàn)平臺(tái)如何選擇,,樣本如何制備,數(shù)據(jù)如何分析等等,,而在這一切開始之前,,我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了,從銷售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持,,我們開通全線對(duì)接渠道,,幫助您快速定位項(xiàng)目訴求,提供從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴,。烈冰生物成立于2010年,,專注于單細(xì)胞測(cè)序領(lǐng)域科研服務(wù)。吉林10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)
基因測(cè)序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實(shí)驗(yàn)室研究逐漸演變到臨床應(yīng)用,,是下一個(gè)改變世界的技術(shù),。蘇州10X單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析
烈冰生物成立于2010年,與時(shí)俱進(jìn),,堅(jiān)持為科研學(xué)者提供國(guó)際前沿的高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)和深度的生物信息數(shù)據(jù)分析服務(wù),,已逐步發(fā)展為單細(xì)胞多組學(xué)檢測(cè)服務(wù)****。專注于“單細(xì)胞測(cè)序系列技術(shù)服務(wù)”的專精領(lǐng)域,,在上海,、北京、廣州,、西安和江西等地?fù)碛袛?shù)千平辦公場(chǎng)所,,并布局多中心產(chǎn)品研發(fā)生產(chǎn)基地和營(yíng)銷、運(yùn)營(yíng)中心,。2016年起連續(xù)被評(píng)為上海市****,,60+項(xiàng)自主知識(shí)產(chǎn)權(quán),轉(zhuǎn)化率近80%,。產(chǎn)品覆蓋從單細(xì)胞測(cè)序,,核測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué),,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序等多組學(xué)聯(lián)合的實(shí)驗(yàn)+數(shù)據(jù)分析全流程服務(wù)平臺(tái)。為600+國(guó)內(nèi)高校和醫(yī)院,、5000+深度合作學(xué)者用戶,、10000+生命科學(xué)探索的重要科研項(xiàng)目在醫(yī)藥開發(fā)、科學(xué)研究,、醫(yī)學(xué)及臨床研究,,疾病分子標(biāo)志物篩選、生命和神經(jīng)發(fā)育研究等提供多層次,、多組學(xué)檢測(cè)服務(wù)和解決方案,,助力300+CNS國(guó)際學(xué)術(shù)期刊文章發(fā)表,30+篇單細(xì)胞技術(shù)聯(lián)合(助力)發(fā)文,,IF 10+文章占比>65%,。蘇州10X單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技、醫(yī)藥科技,、信息科技,、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,,市場(chǎng)營(yíng)銷策劃,市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查,、社會(huì)調(diào)研,、民意調(diào)查、民意測(cè)驗(yàn)),,從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),,計(jì)算機(jī)、軟件及耗材(除??兀?,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】的公司,,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實(shí),、誠(chéng)實(shí)可信的企業(yè)。烈冰生物深耕行業(yè)多年,,始終以客戶的需求為向?qū)?,為客戶提?**的單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序。烈冰生物不斷開拓創(chuàng)新,,追求出色,,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺(tái),,以應(yīng)用為重點(diǎn),,以服務(wù)為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價(jià)值,,提供更優(yōu)服務(wù),。烈冰生物始終關(guān)注自身,在風(fēng)云變化的時(shí)代,,對(duì)自身的建設(shè)毫不懈怠,,高度的專注與執(zhí)著使烈冰生物在行業(yè)的從容而自信。