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廈門10X Genomics單細(xì)胞測序

來源: 發(fā)布時間:2022-06-26

Fluidigm C1平臺作為應(yīng)用于單細(xì)胞測序(Single Cell RNA Sequencing)領(lǐng)域的商業(yè)化分選技術(shù),,基于富魯達(Fluidigm?)的微流控技術(shù),大約在幾個小時中可以捕獲96個左右的細(xì)胞,,進行各類的Single-Cell測序建庫,。當(dāng)然,通量還是比較小,。但不可否認(rèn)的是,,現(xiàn)在很多非RNA類Single Cell測序,仍然在采用這樣的技術(shù),,如Single Cell DNA-Seq,,Single Cell ATAC-Seq等,都是采用此技術(shù)進行單細(xì)胞分選后再分別用不同試劑盒建庫,。所以可以說,,至少在10X和BD,或者其他企業(yè)推出有效的Single DNA測序技術(shù)之前,,C1仍然會是市場上的重要組成部分,。從樣本處理到終端數(shù)據(jù)分析,只要您需要,,烈冰提供全流程的無憂服務(wù),。廈門10X Genomics單細(xì)胞測序

為什么需要單細(xì)胞分辨率? 生物學(xué)就像宇宙一樣,。它非常復(fù)雜,,有許多獨特的單體,,也就是細(xì)胞。這些細(xì)胞相互作用并扮演不同的角色,,在更大的體系中構(gòu)建并驅(qū)動多個過程,。就像伽利略探索宇宙的努力一樣,發(fā)現(xiàn)和定義這些細(xì)胞也需要高分辨率的工具,,才能解開促成生物學(xué)復(fù)雜性的基因表達異質(zhì)性,。單細(xì)胞測序能夠在以一個細(xì)胞為功能單位中開展生物學(xué)研究,闡明具體細(xì)節(jié),,構(gòu)建出一幅更大,、更精細(xì)的圖譜,說明導(dǎo)致產(chǎn)生某種外在表型的不同類型的分子和細(xì)胞之間是如何相互作用的:患者為什么會復(fù)發(fā),?是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問題,。南京二代測序單細(xì)胞測序技術(shù)支持單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析,認(rèn)準(zhǔn)烈冰NovelBrain生物信息數(shù)據(jù)分析平臺,。

單細(xì)胞測序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,可實現(xiàn)零代碼操作,、簡單方便:單細(xì)胞瀏覽器的操作簡單,,不需要命令行操作。簡單拖拽,、設(shè)置參數(shù)即可運行,,即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運用自如;可視化展示海量結(jié)果文件:可視化展示Cluster的基因數(shù),,UMI數(shù)量,、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量,、基因表達量,、RNA表達量、樣本細(xì)胞分布,、線粒體RNA表達量等,;3D立體展示,文章動圖先人一步:單細(xì)胞瀏覽器針對t-SNE圖,、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進行三維立體展示,,更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類情況。

10× Genomics官方建議,,當(dāng)單細(xì)胞懸液活性低于70%時應(yīng)做去除死細(xì)胞操作,,并推薦使用MACS? Dead Cell Removal Kit(Miltenyi Biotec)。需要注意到,,去除死細(xì)胞的操作會損失一定的細(xì)胞數(shù)量,,10× Genomics和Miltenyi Biotec都沒有給出單細(xì)胞懸液含有多少細(xì)胞數(shù)量才建議做去除死細(xì)胞的操作,。基于烈冰多年單細(xì)胞測序?qū)嶒灲?jīng)驗,,建議當(dāng)細(xì)胞懸液進行質(zhì)量和活性檢測后,,考慮對細(xì)胞活性在50%-70%的懸液進行去除死細(xì)胞的操作。而太低活性的懸液(小于30%),,懸液中細(xì)胞大量死亡,,可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細(xì)胞比例和狀態(tài),失真嚴(yán)重,,建議重新收集樣本進行新的實驗,,保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性。十二年測序經(jīng)驗,,累計服務(wù)與5000余項重要科研項目,。

單細(xì)胞測序是指針對單個細(xì)胞進行全轉(zhuǎn)錄組測序分析,可精確地描述每一個細(xì)胞的狀態(tài),,在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有特殊的應(yīng)用價值,。然而,單細(xì)胞測序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息,,對于揭示發(fā)育過程,、病理微環(huán)境都存在很大的局限性??臻g轉(zhuǎn)錄組測序以點陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進行測序,,可以精確指示點陣內(nèi)的全部基因表達情況??臻g轉(zhuǎn)錄組測序的加入,,無疑讓單細(xì)胞測序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性,。烈冰生物首批引進 Chromium X 平臺,,開啟百萬級通量單細(xì)胞測序新時代。上海高通量測序單細(xì)胞測序多組學(xué)測序

烈冰斥巨資引進Novaseq6000,,開啟更大通量測序新紀(jì)元,。廈門10X Genomics單細(xì)胞測序

所謂的高通量測序技術(shù),又名大規(guī)模平行測序,,是將 DNA(或者 cDNA)隨機片段化,、加接頭,制備測序文庫,,通過對文庫中數(shù)以萬計的克隆(colony)進行延伸反應(yīng),,檢測對應(yīng)的信號,獲取序列信息,。與傳統(tǒng)測序法(Sanger法等)相比,,高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時具有明顯的優(yōu)勢,,又快(兩天)又多(數(shù)百萬克隆),,成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù),。單細(xì)胞測序是一個系統(tǒng)的工程,開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,,如果匹配,,實驗過程如何規(guī)劃,實驗平臺如何選擇,,樣本如何制備,,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開始之前,,我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了,,從銷售到實驗到專業(yè)技術(shù)支持,我們開通全線對接渠道,,幫助您快速定位項目訴求,,提供從實驗設(shè)計到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴,。廈門10X Genomics單細(xì)胞測序

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司坐落在江月路999號奇亞特中心22幢,,是一家專業(yè)的生物科技、醫(yī)藥科技,、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,,市場營銷策劃,,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù),,計算機,、軟件及耗材(除專控),,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項目,,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】公司。目前我公司在職員工以90后為主,,是一個有活力有能力有創(chuàng)新精神的團隊,。公司以誠信為本,,業(yè)務(wù)領(lǐng)域涵蓋單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序,我們本著對客戶負(fù)責(zé),,對員工負(fù)責(zé),,更是對公司發(fā)展負(fù)責(zé)的態(tài)度,爭取做到讓每位客戶滿意,。公司憑著雄厚的技術(shù)力量,、飽滿的工作態(tài)度、扎實的工作作風(fēng),、良好的職業(yè)道德,,樹立了良好的單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序形象,贏得了社會各界的信任和認(rèn)可,。