單細(xì)胞測(cè)序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),可實(shí)現(xiàn)零代碼操作,、簡(jiǎn)單方便:?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器的操作簡(jiǎn)單,,不需要命令行操作。簡(jiǎn)單拖拽,、設(shè)置參數(shù)即可運(yùn)行,,即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運(yùn)用自如;可視化展示海量結(jié)果文件:可視化展示Cluster的基因數(shù),,UMI數(shù)量,、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對(duì)應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量,、基因表達(dá)量,、RNA表達(dá)量、樣本細(xì)胞分布,、線粒體RNA表達(dá)量等,;3D立體展示,文章動(dòng)圖先人一步:?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器針對(duì)t-SNE圖,、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進(jìn)行三維立體展示,,更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類情況。烈冰斥巨資引進(jìn)Novaseq6000,,開啟更大通量測(cè)序新紀(jì)元,。南通烈冰單細(xì)胞測(cè)序
科研的魅力之處,在于無窮盡的探尋生命的本底,,通過單細(xì)胞測(cè)序,,我們對(duì)組織的分子基礎(chǔ)的研究也從初級(jí)到深層,并在單細(xì)胞層面逐漸達(dá)成一致,,那么不禁要問一句,,組織的空間位置到底重不重要?空間異質(zhì)性是功能的關(guān)鍵特征,,細(xì)胞的位置信息更能反應(yīng)細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控機(jī)制和細(xì)胞譜系發(fā)生過程,。因此時(shí)間和空間即像組織的AB面,而不可否認(rèn)的是,,此時(shí)空間坐標(biāo)的記錄,,像一個(gè)還未長(zhǎng)大的娃娃,,雖未觸及分子基礎(chǔ)研究的深層,但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個(gè)高峰,。高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)公司測(cè)序可準(zhǔn)確地分析基因表達(dá)差異,、基因結(jié)構(gòu)變異、篩選分子標(biāo)記(SNPs或SSR)等生命科學(xué)重要問題,。
樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化,,在對(duì)細(xì)胞進(jìn)行清洗和計(jì)數(shù)后,單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上,,直至用于后續(xù)的上機(jī)和文庫制備步驟,。在理想狀況下,一旦制備好樣本,,應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟,。然而,您還有必要了解各類細(xì)胞的不同性質(zhì),,因?yàn)檫@可能會(huì)影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時(shí)間,,以及它們?cè)谥苽浜蠖嗑帽銘?yīng)當(dāng)被盡快使用。例如,,有些細(xì)胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時(shí)間,,它們就開始形成團(tuán)塊。這些團(tuán)塊很難解離,,增加了堵塞的風(fēng)險(xiǎn),,而且每個(gè)團(tuán)塊被當(dāng)成單細(xì)胞計(jì)數(shù),又降低了細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性,。此外,,有些細(xì)胞更加粘稠,形成團(tuán)塊的速度更快,。對(duì)于這些細(xì)胞,必須盡量減少制備和使用之間的時(shí)間差,。
對(duì)于單細(xì)胞測(cè)序而言,,常常需要先構(gòu)建細(xì)胞圖譜,在此基礎(chǔ)上再開展后續(xù)各項(xiàng)分析,,并且數(shù)據(jù)分析時(shí)以細(xì)胞聚類(cell cluster)為討論對(duì)象,,而不是像常規(guī)Bulk測(cè)序一樣以組別為分析對(duì)象,因此單細(xì)胞測(cè)序項(xiàng)目對(duì)樣本入組要求沒有Bulk測(cè)序那樣嚴(yán)格,,但是單細(xì)胞測(cè)序,,特別是目的為圖譜研究時(shí),需要通過提高樣本復(fù)雜度(增加樣本數(shù)),,盡可能的構(gòu)建某一疾病類型,、群體細(xì)胞圖譜信息,。因此,單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)時(shí)首先需要保證生物學(xué)重復(fù),,不同樣本來源的樣本建議單獨(dú)進(jìn)行細(xì)胞解離和捕獲,、建庫、測(cè)序,,以保證捕獲到足夠的細(xì)胞數(shù),,單個(gè)樣本分別捕獲細(xì)胞時(shí),后續(xù)分析除了整體分析以外,,還可以做單樣本分析,,保證分析的完備準(zhǔn)確性。烈冰測(cè)序數(shù)據(jù)分析平臺(tái),,不依賴已有物種信息,,可研究非模式物種,針對(duì)不同平臺(tái)的數(shù)據(jù),,制定多套流程,;
作為單細(xì)胞測(cè)序的一個(gè)重要里程碑,10x genomic公司于2016年2月推出10x Chromium Single Cell Gene Expression Solution,,此平臺(tái)整合了儀器,、試劑盒和信息學(xué)軟件,能精確對(duì)接illumina測(cè)序儀,,因此可實(shí)現(xiàn)大量大細(xì)胞的快速高效標(biāo)記,、測(cè)序和分析,獲得單細(xì)胞水平的基因表達(dá)譜和差異情況,,并通過對(duì)復(fù)雜細(xì)胞群體進(jìn)行深入細(xì)致分析,,繪制大規(guī)模單細(xì)胞表達(dá)圖譜。 以量化細(xì)胞內(nèi)的群體異質(zhì)性,,并逐個(gè)鑒定細(xì)胞類型,、細(xì)胞狀態(tài)和動(dòng)態(tài)細(xì)胞躍遷。除了有望鑒定新的細(xì)胞亞型和稀有細(xì)胞群體,,單細(xì)胞技術(shù)還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動(dòng)態(tài)和基因調(diào)控關(guān)系,。烈冰專精單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序領(lǐng)域。北京高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序價(jià)格
單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析,,認(rèn)準(zhǔn)烈冰NovelBrain生物信息數(shù)據(jù)分析平臺(tái),。南通烈冰單細(xì)胞測(cè)序
單細(xì)胞RNA-seq、RNA-seq和逆轉(zhuǎn)錄qPCR(RT-qPCR)都采用一個(gè)共同過程,,即分離RNA并將其轉(zhuǎn)化為cDNA進(jìn)行分析,。不過,每種分析在開展方式和獲得的數(shù)據(jù)上有所不同。RNA-seq和RT-qPCR都是先從大量細(xì)胞中分離RNA,,然后將其轉(zhuǎn)化為cDNA,。RNA-seq是使用cDNA來構(gòu)建新一代測(cè)序文庫,從而測(cè)定整個(gè)轉(zhuǎn)錄組的基因表達(dá),。RT-qPCR則是從cDNA中擴(kuò)增特定靶點(diǎn),,并通過熒光測(cè)定表達(dá)水平。RT-qPCR限于已知靶點(diǎn),,而RNA-seq可實(shí)現(xiàn)無偏倚的全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)分析,。然而,這兩者只能提供細(xì)胞群體內(nèi)基因表達(dá)的平均情況,。單細(xì)胞RNA-seq則在分離RNA之前將單細(xì)胞分離到微孔或單個(gè)微反應(yīng)容器中,。然后用細(xì)胞特異性的條形碼標(biāo)記RNA,確保來自每個(gè)細(xì)胞的cDNA可以追溯到起源細(xì)胞,。與RNA-seq相似,,帶有條形碼的cDNA也被用于構(gòu)建新一代測(cè)序文庫,從而能夠?qū)γ總€(gè)細(xì)胞的整個(gè)轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行基因表達(dá)測(cè)定,。南通烈冰單細(xì)胞測(cè)序
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司主要經(jīng)營(yíng)范圍是醫(yī)藥健康,,擁有一支專業(yè)技術(shù)團(tuán)隊(duì)和良好的市場(chǎng)口碑。公司自成立以來,,以質(zhì)量為發(fā)展,,讓匠心彌散在每個(gè)細(xì)節(jié),公司旗下單細(xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序深受客戶的喜愛,。公司從事醫(yī)藥健康多年,,有著創(chuàng)新的設(shè)計(jì)、強(qiáng)大的技術(shù),,還有一批專業(yè)化的隊(duì)伍,,確保為客戶提供良好的產(chǎn)品及服務(wù)。烈冰生物立足于全國(guó)市場(chǎng),,依托強(qiáng)大的研發(fā)實(shí)力,,融合前沿的技術(shù)理念,飛快響應(yīng)客戶的變化需求,。