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濟(jì)南BD Rhapsody單細(xì)胞平臺(tái)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-07-22

細(xì)胞計(jì)數(shù)和活力評(píng)估在評(píng)估樣本質(zhì)量時(shí),需要在細(xì)胞清洗和過濾之后測(cè)定細(xì)胞活力,,這一點(diǎn)至關(guān)重要,。測(cè)定細(xì)胞活力有許多種方法,烈冰多年單細(xì)胞測(cè)序經(jīng)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)臺(tái)盼藍(lán)法在鑒定活細(xì)胞與死細(xì)胞的比例時(shí)效果很好,。細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性以及目標(biāo)回收量和實(shí)際回收量之間的一致性,,取決于我們了解樣本中有多少個(gè)細(xì)胞。一旦過濾和清洗完成,,可采用細(xì)胞計(jì)數(shù)設(shè)備(如血球計(jì)數(shù)器或自動(dòng)細(xì)胞計(jì)數(shù)儀)進(jìn)行定量,。這些設(shè)備不但能提供準(zhǔn)確的細(xì)胞計(jì)數(shù),還能計(jì)算出向微流體芯片上樣適量細(xì)胞所需的細(xì)胞懸液體積,。烈冰實(shí)驗(yàn)室包含從樣本處理到測(cè)序下機(jī)的全套實(shí)驗(yàn)平臺(tái),。濟(jì)南BD Rhapsody單細(xì)胞平臺(tái)

您的珍貴樣本,還可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng),BD RhapsodyTM單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)采用微孔技術(shù),,對(duì)細(xì)胞的捕獲沒有偏好性,,實(shí)現(xiàn)高達(dá)80%的微孔板捕獲率,由于單個(gè)微孔板中容納了22萬+個(gè)微孔,,而現(xiàn)階段單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)技術(shù)通常要求單個(gè)樣本捕獲3000-5000,,至高達(dá)10000個(gè)細(xì)胞,即可滿足科研探索需求,,因此這種“泊松分布”的原理類似于上樣細(xì)胞的無限稀釋過程,,但22萬+微孔的存在,也對(duì)大體量細(xì)胞數(shù)目的科學(xué)研究有很好的包容性,,細(xì)胞通量分為可擴(kuò)展至100-40000個(gè)細(xì)胞的捕獲(單個(gè)微孔板),滿足您的多重需求,。廣東BD VDJ單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)BD單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)同時(shí)兼容單細(xì)胞蛋白組測(cè)序(Ab-seq)和免疫組庫測(cè)序等工作,。

烈冰生物在上海、北京,、廣州,、西安、江西等多地部署單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)組中心,,多地部署搭建BD Rhapsody單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),,基于微孔的強(qiáng)大的高通量單細(xì)胞分析系統(tǒng),為您提供可靠的單細(xì)胞分析工作流程,,該系統(tǒng)可通過簡(jiǎn)單的唯恐把工作流程和多重條碼標(biāo)記系統(tǒng),,對(duì)高通量單細(xì)胞進(jìn)行多組學(xué)的信息捕獲,由此捕獲的信息科進(jìn)一步生成各種類型的二代測(cè)序(NGS)文庫,。之后對(duì)文庫進(jìn)行測(cè)序和基于NovelBrain生物大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)(云平臺(tái))的數(shù)據(jù)可視化分析,,實(shí)現(xiàn)高位分辨率下的組織內(nèi)基因的表達(dá)差異和表達(dá)豐度。

對(duì)于單細(xì)胞測(cè)序而言,,常常需要先構(gòu)建細(xì)胞圖譜,,在此基礎(chǔ)上再開展后續(xù)各項(xiàng)分析,并且數(shù)據(jù)分析時(shí)以細(xì)胞聚類(cell cluster)為討論對(duì)象,,而不是像常規(guī)Bulk測(cè)序一樣以組別為分析對(duì)象,,因此單細(xì)胞測(cè)序項(xiàng)目對(duì)樣本入組要求沒有Bulk測(cè)序那樣嚴(yán)格,但是單細(xì)胞測(cè)序,,特別是目的為圖譜研究時(shí),,需要通過提高樣本復(fù)雜度(增加樣本數(shù)),盡可能的構(gòu)建某一疾病類型,、群體細(xì)胞圖譜信息,。因此,單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)時(shí)首先需要保證生物學(xué)重復(fù),,不同樣本來源的樣本建議單獨(dú)進(jìn)行細(xì)胞解離和捕獲,、建庫,、測(cè)序,以保證捕獲到足夠的細(xì)胞數(shù),,單個(gè)樣本分別捕獲細(xì)胞時(shí),,后續(xù)分析除了整體分析以外,還可以做單樣本分析,,保證分析的完備準(zhǔn)確性,。從樣本處理到終端數(shù)據(jù)分析,只要您需要,,烈冰提供全流程的無憂服務(wù),。

根據(jù)烈冰多年單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)經(jīng)驗(yàn),為什么不建議您一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲:?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類進(jìn)行,,而細(xì)胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后,,獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜,通過降維(pca),,無監(jiān)督聚類以及可視化(t-SNE)得到的,。進(jìn)行細(xì)胞聚類時(shí)需要考慮到每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式,因此即使是相同的數(shù)據(jù),,在剔除幾個(gè)細(xì)胞的情況下,,前后獲得的聚類圖也會(huì)出現(xiàn)明顯不同。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過多時(shí),,無論是假陰性和假陽性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù),,都會(huì)對(duì)正常細(xì)胞聚類產(chǎn)生影響,造成聚類結(jié)果失真,。這也是很多文章,,特別是很多高分文章,為什么單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了,。烈冰建議單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在3000-5000個(gè)時(shí),,數(shù)據(jù)量在100G左右時(shí),可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求,。BD Rhapsody平臺(tái)在細(xì)胞捕獲過程中沒有偏好性,,可同樣無差別捕獲中性粒細(xì)胞。寧波BD Rhapsody單細(xì)胞平臺(tái)

2019年,,烈冰已助力發(fā)表了采用BD Rahpsody平臺(tái)的單細(xì)胞風(fēng)濕類文章,。濟(jì)南BD Rhapsody單細(xì)胞平臺(tái)

烈冰生物搭建近10臺(tái)BD Rhapsody平臺(tái),目前為全國范圍內(nèi)的高校,、醫(yī)院和研究所等單位的科研學(xué)者提供服務(wù),,BD Rhapsody平臺(tái)采用U型微孔板,1個(gè)板即對(duì)應(yīng)1個(gè)樣本(不混樣的情況下),每個(gè)通道一般捕獲細(xì)胞數(shù)在1000-10000個(gè)之間,,而上限可捕獲40000細(xì)胞時(shí)也能獲得較低的雙細(xì)胞率,,此外,單個(gè)細(xì)胞捕獲效率高達(dá)80%,,可準(zhǔn)確鑒別稀有細(xì)胞類型,,有利于稀有樣本或小細(xì)胞量類型樣本研究;細(xì)胞可適性高,,對(duì)細(xì)胞大?。ㄖ睆匠^40um細(xì)胞需要制備成細(xì)胞核)及類型無限制。細(xì)胞捕獲周期較短,,能夠?qū)崿F(xiàn)自動(dòng)分離,,且實(shí)驗(yàn)端捕獲細(xì)胞過程全程可視化進(jìn)行,保障每一例珍貴樣本實(shí)驗(yàn)的成功進(jìn)行,,1天內(nèi)可完成從細(xì)胞懸液到cDNA文庫構(gòu)建的所有的測(cè)序準(zhǔn)備工作,。濟(jì)南BD Rhapsody單細(xì)胞平臺(tái)

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司主要經(jīng)營(yíng)范圍是醫(yī)藥健康,擁有一支專業(yè)技術(shù)團(tuán)隊(duì)和良好的市場(chǎng)口碑,。公司業(yè)務(wù)分為單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序等,目前不斷進(jìn)行創(chuàng)新和服務(wù)改進(jìn),,為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務(wù),。公司秉持誠信為本的經(jīng)營(yíng)理念,在醫(yī)藥健康深耕多年,,以技術(shù)為先導(dǎo),,以自主產(chǎn)品為重點(diǎn),發(fā)揮人才優(yōu)勢(shì),,打造醫(yī)藥健康良好品牌,。烈冰生物憑借創(chuàng)新的產(chǎn)品、專業(yè)的服務(wù),、眾多的成功案例積累起來的聲譽(yù)和口碑,,讓企業(yè)發(fā)展再上新高。