RNA測(cè)序（RNA-seq）或芯片分析等大量樣本的轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法作為一類(lèi)強(qiáng)大的工具,，可提供混合樣本的基因表達(dá)平均數(shù)據(jù),，幫助科學(xué)家開(kāi)始揭示這種異質(zhì)性。隨后,，技術(shù)創(chuàng)新的飛躍在單細(xì)胞技術(shù)上達(dá)到新高度——使得科學(xué)家能夠定義細(xì)胞類(lèi)型特異的基因表達(dá),，從過(guò)去的平均數(shù)據(jù)中分辨出真正驅(qū)動(dòng)其表達(dá)模式的細(xì)胞異質(zhì)性。這讓研究人員能夠更詳細(xì)地表征組織異質(zhì)性,，鑒定稀有細(xì)胞類(lèi)型,，并逐個(gè)細(xì)胞地仔細(xì)分析其分子機(jī)制。當(dāng)獲得了對(duì)其研究的生物系統(tǒng)更為真實(shí)的圖譜后,，研究人員就有了更為堅(jiān)實(shí)可靠的知識(shí)基礎(chǔ),，并能在這個(gè)基礎(chǔ)上規(guī)劃下一步實(shí)驗(yàn)，以獲取更深入的可行動(dòng)見(jiàn)解,。經(jīng)驗(yàn)豐富的實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì),，為獲得示組織內(nèi)真實(shí)表達(dá)水平的高質(zhì)量冷凍切片提供硬件和技術(shù)保障。吉林10X單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析可視化

單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)再樣本細(xì)胞上機(jī)分選簽,，需要對(duì)細(xì)胞數(shù)量,、細(xì)胞活性進(jìn)準(zhǔn)判斷,，這對(duì)SingleCell分選標(biāo)記、建庫(kù),、下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用,。如若細(xì)胞計(jì)數(shù)偏高,，將會(huì)影響建庫(kù)的成功率,；計(jì)數(shù)偏低,，則會(huì)提高雙細(xì)胞的比例,；而細(xì)胞活率過(guò)低,，就會(huì)使測(cè)序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣,，因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要。而在鋪板過(guò)程中,，由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,，不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果,。因此烈冰生物BDRhapsody單細(xì)胞分選平臺(tái)配套了專(zhuān)門(mén)定制的電動(dòng)移液器，其具有PrimeTreat,、CellLoad,、BeadLoad、Wash,、Lysis,、Retrieval多種操作模式，來(lái)對(duì)應(yīng)各種不同的操作,。通過(guò)已經(jīng)設(shè)定的程序來(lái)控制液體的流速,，大幅度降低人為操作習(xí)慣帶來(lái)的差異，保證實(shí)驗(yàn)操作的一致性,。湖州單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)測(cè)序的革新讓科學(xué)研究從個(gè)體基因差異逐漸轉(zhuǎn)為個(gè)體細(xì)胞的基因差異,。

烈冰生物搭建近10臺(tái)10XGemomics平臺(tái)，目前為全國(guó)范圍內(nèi)的高校,、醫(yī)院和研究所等單位的科研學(xué)者提供鼓舞,，10X微流體“雙十字”交叉系統(tǒng)為8或16通道系統(tǒng)，每個(gè)通道上限可捕獲20000細(xì)胞,，16通道一次可檢測(cè)細(xì)胞范圍為百萬(wàn)級(jí)別的細(xì)胞水平,。此外，單個(gè)細(xì)胞捕獲效率高達(dá)65%,，可準(zhǔn)確鑒別稀有細(xì)胞類(lèi)型,，利于稀有樣本或小細(xì)胞量類(lèi)型樣本研究；細(xì)胞可適性高,，對(duì)細(xì)胞大?。ㄖ睆匠^(guò)40um細(xì)胞需要制備成細(xì)胞核）及類(lèi)型無(wú)限制。細(xì)胞捕獲周期較短,，能夠?qū)崿F(xiàn)自動(dòng)分離,，無(wú)需人工操作，1天內(nèi)可完成從細(xì)胞懸液到cDNA文庫(kù)構(gòu)建的所有的測(cè)序準(zhǔn)備工作,。

為什么需要單細(xì)胞分辨率,？生物學(xué)就像宇宙一樣。它非常復(fù)雜,，有許多獨(dú)特的單體,，也就是細(xì)胞。這些細(xì)胞相互作用并扮演不同的角色,，在更大的體系中構(gòu)建并驅(qū)動(dòng)多個(gè)過(guò)程,。就像伽利略探索宇宙的努力一樣，發(fā)現(xiàn)和定義這些細(xì)胞也需要高分辨率的工具，才能解開(kāi)促成生物學(xué)復(fù)雜性的基因表達(dá)異質(zhì)性,。單細(xì)胞測(cè)序能夠在以一個(gè)細(xì)胞為功能單位中開(kāi)展生物學(xué)研究,，闡明具體細(xì)節(jié)，構(gòu)建出一幅更大,、更精細(xì)的圖譜,，說(shuō)明導(dǎo)致產(chǎn)生某種外在表型的不同類(lèi)型的分子和細(xì)胞之間是如何相互作用的：患者為什么會(huì)復(fù)發(fā)？是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問(wèn)題,。強(qiáng)勢(shì)發(fā)文,！烈冰單細(xì)胞測(cè)序助力揭示愈傷組織能再生的機(jī)制。

針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié)：主要是對(duì)細(xì)胞數(shù)量,、基因表達(dá)量,、測(cè)序質(zhì)量進(jìn)行整體描述。過(guò)濾標(biāo)準(zhǔn)：由于細(xì)胞破碎后游離RNA會(huì)釋放到環(huán)境或孔中,，并且測(cè)序中也會(huì)存在一些死細(xì)胞,，導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值。因此,，我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來(lái)過(guò)濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞,。以10×Genomics為例，細(xì)胞數(shù)量判斷主要通過(guò)分析UMICounts-Barcode曲線斜率拐點(diǎn),，當(dāng)存在多個(gè)斜率拐點(diǎn)的時(shí)候,，結(jié)合預(yù)期UMI=500時(shí)的細(xì)胞數(shù)量進(jìn)行過(guò)濾。當(dāng)斜率拐點(diǎn)低于UMI=500的時(shí)候,，選擇UMI=500作為細(xì)胞的判斷的標(biāo)準(zhǔn),；否則，選擇和預(yù)期細(xì)胞數(shù)量接近的拐點(diǎn)作為細(xì)胞判斷的位置,。這樣我們能夠有效獲得真實(shí)的并且在基因數(shù)量上可以分析的數(shù)據(jù)。單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái),，烈冰提供高性?xún)r(jià)比服務(wù)方案,。西安10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)公司

單細(xì)胞科聯(lián)合空間轉(zhuǎn)錄組，展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達(dá)情況,，揭示精細(xì)病理區(qū)域中“喚醒”的信號(hào)通路,。吉林10X單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析可視化

烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,；從操作便捷、結(jié)果可視化,、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程！此外,，烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器（SingleCellBrowser）,，不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化，還是可以實(shí)現(xiàn)三維立體化展示的軟件,。專(zhuān)業(yè)的生信代碼交給專(zhuān)業(yè)的烈冰,，專(zhuān)業(yè)的生物學(xué)意義交給專(zhuān)業(yè)的您！吉林10X單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析可視化

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