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成都10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序百萬(wàn)通量平臺(tái)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-07-29

多樣本數(shù)據(jù)合并:FractionofReadsKept:合并樣本時(shí),各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計(jì)算出來(lái)的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,,需要進(jìn)行Downsample處理,,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測(cè)序深度標(biāo)化到同一水平,從而避免因測(cè)序深度差異導(dǎo)致的基因檢測(cè)數(shù)量,、基因表達(dá)水平的差異,。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶(hù)定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,;從操作便捷、結(jié)果可視化,、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程,!測(cè)序可準(zhǔn)確地分析基因表達(dá)差異,、基因結(jié)構(gòu)變異、篩選分子標(biāo)記(SNPs或SSR)等生命科學(xué)重要問(wèn)題。成都10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序百萬(wàn)通量平臺(tái)

10X Genomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),,也是目前國(guó)內(nèi)和國(guó)際上公認(rèn)的單細(xì)胞測(cè)序大規(guī)模實(shí)驗(yàn)平臺(tái)技術(shù),,該平臺(tái)基于動(dòng)態(tài)微流控原理,突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性,,組織解離后,,單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-20000個(gè)細(xì)胞, 基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序,,獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),,并鑒定細(xì)胞的類(lèi)型,可以在不同樣本間從細(xì)胞類(lèi)型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,,反映細(xì)胞間的異質(zhì)性,,提供足夠靈活的定制測(cè)定法以滿(mǎn)足多種實(shí)驗(yàn)需要,并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時(shí)間和降低測(cè)序成本,。沈陽(yáng)單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)基因測(cè)序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實(shí)驗(yàn)室研究逐漸演變到臨床應(yīng)用,,是下一個(gè)改變世界的技術(shù)。

現(xiàn)有的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)陣營(yíng)在幾個(gè)主要領(lǐng)域存在差別,。一個(gè)是分隔單個(gè)細(xì)胞以在其中進(jìn)行微反應(yīng)的物理平臺(tái),。在這個(gè)空間,單個(gè)細(xì)胞的內(nèi)容物釋放,,轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引,,以便下游識(shí)別。現(xiàn)有技術(shù)的另一個(gè)主要區(qū)別是如何添加索引,,就像生成測(cè)序文庫(kù)所涉及的流程步驟一樣,。10XGenomics單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)采用動(dòng)態(tài)微流控技(Drop-Seq具有類(lèi)似的技術(shù)原理)。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,,其中一列縱向孔道輸入細(xì)胞,,凝膠微珠與細(xì)胞碰撞后會(huì)吸附在凝膠微珠上,并通過(guò)微流控技術(shù),,將之輸入到第二縱向孔道,,即油相孔道中。這時(shí)候,,就形成了一個(gè)個(gè)油滴并輸出并收集在EP管中,。每一個(gè)油滴中會(huì)落入一個(gè)細(xì)胞以及一個(gè)凝膠微珠,那么在每一個(gè)凝膠微珠中上長(zhǎng)滿(mǎn)了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列,,再加上一端PolyT的抓手,,構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠。而這個(gè)凝膠微珠抓手就會(huì)使用oligodT抓住mRNA構(gòu)建文庫(kù),。

烈冰科技作為國(guó)內(nèi)率先同時(shí)擁有10XGenomics和BDRhapsody雙分選平臺(tái)的測(cè)序服務(wù)商及云計(jì)算服務(wù)供應(yīng)商,,經(jīng)過(guò)多年實(shí)戰(zhàn),,擁有豐富的單細(xì)胞懸液制備和分選經(jīng)驗(yàn),實(shí)測(cè)BDRhapsody對(duì)能夠高效捕獲粒細(xì)胞,。針對(duì)不同的分選平臺(tái),、建庫(kù)方法,實(shí)戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預(yù)處理工作流程,;烈冰科技NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)平臺(tái)能有效支撐生命科學(xué)研究,、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求。高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)平臺(tái),,包括NovaSeq6000,、10XChromiumX、BDFACSMelody,、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等,,配合一支來(lái)自海內(nèi)外名校,、多學(xué)科交叉型的高素質(zhì)綜合團(tuán)隊(duì),,為您的科學(xué)研究保駕護(hù)航。單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái),,烈冰提供高性?xún)r(jià)比服務(wù)方案,。

單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果動(dòng)輒上百G數(shù)據(jù)量,龐大的數(shù)據(jù)對(duì)于分析平臺(tái)和分析能力有著很高的要求,,首先針對(duì)下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié):?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列,,不可避免的會(huì)出現(xiàn)低質(zhì)量的測(cè)序結(jié)果,存在各種情況的序列污染,。因此序列過(guò)濾及質(zhì)量評(píng)估就會(huì)變得極為重要,。序列質(zhì)量主要通過(guò)測(cè)序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來(lái)表征,即堿基測(cè)序結(jié)果的錯(cuò)誤率在1%/0.1%以下的比例,。理想的測(cè)序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30,。保證數(shù)據(jù)獲得后的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性,為后續(xù)細(xì)胞類(lèi)型鑒定和功能分析打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ),。單細(xì)胞科聯(lián)合空間轉(zhuǎn)錄組,,展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達(dá)情況,揭示精細(xì)病理區(qū)域中“喚醒”的信號(hào)通路,。沈陽(yáng)單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)

全線(xiàn)搭建10X Genomics Chromium X單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)測(cè)序平臺(tái),。成都10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序百萬(wàn)通量平臺(tái)

細(xì)胞中基因的表達(dá)是嚴(yán)格按照時(shí)間和空間順序發(fā)生,因此細(xì)胞類(lèi)型和基因表達(dá)具有時(shí)間特異性和空間特異性,。時(shí)間特異性可以通過(guò)收集不同時(shí)間點(diǎn)的樣本進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序來(lái)分析,。但是單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(scRNA-Seq)在單細(xì)胞懸液制備的過(guò)程中破壞了細(xì)胞的空間結(jié)構(gòu),無(wú)法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息,。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個(gè)問(wèn)題,,其以點(diǎn)陣形式記錄組織切片細(xì)胞的空間信息,在保留組織形態(tài)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,獲得細(xì)胞/基因的空間表達(dá)特異性,。成都10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序百萬(wàn)通量平臺(tái)

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司坐落在江月路999號(hào)奇亞特中心22幢,,是一家專(zhuān)業(yè)的生物科技、醫(yī)藥科技,、信息科技,、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開(kāi)發(fā)、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢(xún),市場(chǎng)營(yíng)銷(xiāo)策劃,,市場(chǎng)信息咨詢(xún)與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查,、社會(huì)調(diào)研、民意調(diào)查,、民意測(cè)驗(yàn)),,從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),計(jì)算機(jī),、軟件及耗材(除專(zhuān)控),,軟件開(kāi)發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門(mén)批準(zhǔn)后方可開(kāi)展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】公司,。目前我公司在職員工以90后為主,,是一個(gè)有活力有能力有創(chuàng)新精神的團(tuán)隊(duì)。公司以誠(chéng)信為本,,業(yè)務(wù)領(lǐng)域涵蓋單細(xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,,我們本著對(duì)客戶(hù)負(fù)責(zé),對(duì)員工負(fù)責(zé),,更是對(duì)公司發(fā)展負(fù)責(zé)的態(tài)度,,爭(zhēng)取做到讓每位客戶(hù)滿(mǎn)意。公司憑著雄厚的技術(shù)力量,、飽滿(mǎn)的工作態(tài)度,、扎實(shí)的工作作風(fēng)、良好的職業(yè)道德,,樹(shù)立了良好的單細(xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序形象,,贏得了社會(huì)各界的信任和認(rèn)可,。