RNA測序(RNA-seq)或芯片分析等大量樣本的轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法作為一類強大的工具,,可提供混合樣本的基因表達平均數(shù)據(jù),,幫助科學(xué)家開始揭示這種異質(zhì)性,。隨后,,技術(shù)創(chuàng)新的飛躍在單細胞技術(shù)上達到新高度——使得科學(xué)家能夠定義細胞類型特異的基因表達,,從過去的平均數(shù)據(jù)中分辨出真正驅(qū)動其表達模式的細胞異質(zhì)性,。這讓研究人員能夠更詳細地表征組織異質(zhì)性,鑒定稀有細胞類型,,并逐個細胞地仔細分析其分子機制,。當獲得了對其研究的生物系統(tǒng)更為真實的圖譜后,研究人員就有了更為堅實可靠的知識基礎(chǔ),,并能在這個基礎(chǔ)上規(guī)劃下一步實驗,,以獲取更深入的可行動見解。烈冰單細胞多組學(xué)測序助您探究細胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)特征,。成都高通量測序單細胞測序平臺
FluidigmC1平臺作為應(yīng)用于單細胞測序(SingleCellRNASequencing)領(lǐng)域的商業(yè)化分選技術(shù),,基于富魯達(Fluidigm®)的微流控技術(shù),大約在幾個小時中可以捕獲96個左右的細胞,,進行各類的Single-Cell測序建庫,。當然,通量還是比較小,。但不可否認的是,,現(xiàn)在很多非RNA類SingleCell測序,仍然在采用這樣的技術(shù),,如SingleCellDNA-Seq,,SingleCellATAC-Seq等,都是采用此技術(shù)進行單細胞分選后再分別用不同試劑盒建庫,。所以可以說,,至少在10X和BD,或者其他企業(yè)推出有效的SingleDNA測序技術(shù)之前,,C1仍然會是市場上的重要組成部分,。西安10X單細胞測序服務(wù)機構(gòu)測序可準確地分析基因表達差異、基因結(jié)構(gòu)變異,、篩選分子標記(SNPs或SSR)等生命科學(xué)重要問題,。
為什么需要單細胞分辨率,?生物學(xué)就像宇宙一樣。它非常復(fù)雜,,有許多獨特的單體,,也就是細胞。這些細胞相互作用并扮演不同的角色,,在更大的體系中構(gòu)建并驅(qū)動多個過程,。就像伽利略探索宇宙的努力一樣,發(fā)現(xiàn)和定義這些細胞也需要高分辨率的工具,,才能解開促成生物學(xué)復(fù)雜性的基因表達異質(zhì)性,。單細胞測序能夠在以一個細胞為功能單位中開展生物學(xué)研究,闡明具體細節(jié),,構(gòu)建出一幅更大,、更精細的圖譜,說明導(dǎo)致產(chǎn)生某種外在表型的不同類型的分子和細胞之間是如何相互作用的:患者為什么會復(fù)發(fā),?是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問題,。
烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,;從操作便捷、結(jié)果可視化,、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,加速科研進程,!此外,,烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器(SingleCellBrowser),不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,,還是可以實現(xiàn)三維立體化展示的軟件,。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您,,詳情請咨詢烈冰生物,。烈冰全線實驗平臺滿足超深度、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復(fù)雜疾病研究的測序,。
從單細胞測序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細胞類型的功能解析,,越來越需要一種多組學(xué)的細胞生物學(xué)視角。通過單細胞多組學(xué)——即對不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個單細胞來源中檢測多種細胞特征,。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達,、細胞表面蛋白表達、免疫組庫序列(包括T細胞和B細胞受體)以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開放染色質(zhì)區(qū)域,。隨著單個實驗可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),,研究人員的獲益更多,,包括保留珍貴樣本、提高生產(chǎn)力,、減少因批次效應(yīng)引起的錯誤,,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時間)。烈冰科技已建立了多種國際和國內(nèi)主流的高通量測序?qū)嶒炂脚_,。陜西10X Chromium X單細胞測序數(shù)據(jù)分析可視化
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作為單細胞測序的一個重要里程碑,,10xgenomic公司于2016年2月推出10xChromiumSingleCellGeneExpressionSolution,,此平臺整合了儀器、試劑盒和信息學(xué)軟件,,能精確對接illumina測序儀,,因此可實現(xiàn)大量大細胞的快速高效標記、測序和分析,,獲得單細胞水平的基因表達譜和差異情況,,并通過對復(fù)雜細胞群體進行深入細致分析,繪制大規(guī)模單細胞表達圖譜,。以量化細胞內(nèi)的群體異質(zhì)性,并逐個鑒定細胞類型,、細胞狀態(tài)和動態(tài)細胞躍遷,。除了有望鑒定新的細胞亞型和稀有細胞群體,單細胞技術(shù)還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動態(tài)和基因調(diào)控關(guān)系,。成都高通量測序單細胞測序平臺
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