細(xì)胞計(jì)數(shù)和活力評估在評估樣本質(zhì)量時(shí),,需要在細(xì)胞清洗和過濾之后測定細(xì)胞活力,,這一點(diǎn)至關(guān)重要,。測定細(xì)胞活力有許多種方法,,烈冰多年單細(xì)胞測序經(jīng)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)臺盼藍(lán)法在鑒定活細(xì)胞與死細(xì)胞的比例時(shí)效果很好,。細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性以及目標(biāo)回收量和實(shí)際回收量之間的一致性,,取決于我們了解樣本中有多少個(gè)細(xì)胞,。一旦過濾和清洗完成,,可采用細(xì)胞計(jì)數(shù)設(shè)備(如血球計(jì)數(shù)器或自動(dòng)細(xì)胞計(jì)數(shù)儀)進(jìn)行定量,。這些設(shè)備不但能提供準(zhǔn)確的細(xì)胞計(jì)數(shù),還能計(jì)算出向微流體芯片上樣適量細(xì)胞所需的細(xì)胞懸液體積,。全線搭建10X Genomics Chromium X單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)測序平臺,。武漢10X Genomics單細(xì)胞測序技術(shù)支持
基于10XNextGEM技術(shù),單細(xì)胞測序一次實(shí)驗(yàn)可以同時(shí)檢測近萬個(gè)細(xì)胞,,可在一個(gè)樣本中同時(shí)獲3端mRNA表達(dá)譜,、如需和免疫組庫(TCR和BCR)的數(shù)據(jù)進(jìn)行聯(lián)合時(shí),即某些研究還需結(jié)合基因的表達(dá)譜和V(D)J數(shù)據(jù)進(jìn)行復(fù)雜組織樣本的是影響免疫應(yīng)答分析,,監(jiān)測免疫療法的效果,,研究疾病發(fā)生、發(fā)展的分子機(jī)制,,可進(jìn)行單細(xì)胞免疫組庫測序:烈冰單細(xì)胞免疫組庫平臺具備:1000+項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),,一次實(shí)驗(yàn)可同時(shí)獲取1000-20000個(gè)細(xì)胞的文庫構(gòu)建,獲得轉(zhuǎn)錄組和免疫組數(shù)據(jù),;具備完善的免疫組庫測序和實(shí)驗(yàn)質(zhì)控流程,,獲取V(D)J全長序列的配對信息;豐富的免疫組庫測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn),,實(shí)現(xiàn)專屬個(gè)性化數(shù)據(jù)分析服務(wù),,搭配單細(xì)胞分析云平臺,一鍵導(dǎo)出交互性的動(dòng)態(tài)結(jié)果報(bào)告,。南昌二代測序單細(xì)胞測序烈冰測序數(shù)據(jù)分析平臺,,不依賴已有物種信息,可研究非模式物種,,針對不同平臺的數(shù)據(jù),,制定多套流程;
關(guān)于單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)樣本制備,,這與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致,,也就是通過酶促或機(jī)械消化,、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個(gè)樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液。隨后是細(xì)胞計(jì)數(shù)和質(zhì)量控制步驟,,以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞,,并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片。如有必要,,您還可以使用抗體對樣本進(jìn)行染色,,標(biāo)記細(xì)胞表面蛋白或其他生物分析物,或者通過FACS來富集感興趣的細(xì)胞類型,。解離樣本時(shí)采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)而定,。也許需要額外的制備步驟,具體取決于組織質(zhì)量,、樣本豐度,、細(xì)胞大小,以及是否需要提取出細(xì)胞核進(jìn)行染色質(zhì)可接近性分析,。無論具體的考慮因素如何,,所有樣本類型都遵循同一個(gè)基本原則,那就是生成高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液,。
樣本制備后的保存為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化,,在對細(xì)胞進(jìn)行清洗和計(jì)數(shù)后,單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上,,直至用于后續(xù)的上機(jī)和文庫制備步驟,。在理想狀況下,一旦制備好樣本,,應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟,。然而,您還有必要了解各類細(xì)胞的不同性質(zhì),,因?yàn)檫@可能會(huì)影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時(shí)間,,以及它們在制備后多久便應(yīng)當(dāng)被盡快使用。例如,,有些細(xì)胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時(shí)間,,它們就開始形成團(tuán)塊。這些團(tuán)塊很難解離,,增加了堵塞的風(fēng)險(xiǎn),,而且每個(gè)團(tuán)塊被當(dāng)成單細(xì)胞計(jì)數(shù),又降低了細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性,。此外,,有些細(xì)胞更加粘稠,形成團(tuán)塊的速度更快,。對于這些細(xì)胞,,必須盡量減少制備和使用之間的時(shí)間差單細(xì)胞多組學(xué)測序可識別重要的轉(zhuǎn)錄因子,,進(jìn)行譜系和發(fā)育追蹤。
烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺,,針對龐大的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù),能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快,、精,、準(zhǔn):一鍵導(dǎo)入genelist構(gòu)建個(gè)性化基因列表;輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Featureplot,;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型,;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖,、Heatmap,、Violin圖,還可以通過調(diào)節(jié)寬,、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀,。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,,幫助烈冰生信分析團(tuán)隊(duì)和自主分析用戶實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動(dòng)化分析,,節(jié)省工作時(shí)間并提升整體工作效率從樣本處理到終端數(shù)據(jù)分析,只要您需要,,烈冰提供全流程的無憂服務(wù),。陜西二代測序單細(xì)胞測序多組學(xué)測序
高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進(jìn)行測定,。武漢10X Genomics單細(xì)胞測序技術(shù)支持
烈冰科技作為國內(nèi)率先同時(shí)擁有10XGenomics和BDRhapsody雙分選平臺的測序服務(wù)商及云計(jì)算服務(wù)供應(yīng)商,,經(jīng)過多年實(shí)戰(zhàn),擁有豐富的單細(xì)胞懸液制備和分選經(jīng)驗(yàn),,實(shí)測BDRhapsody對能夠高效捕獲粒細(xì)胞,。針對不同的分選平臺、建庫方法,,實(shí)戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預(yù)處理工作流程,;烈冰科技NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)平臺能有效支撐生命科學(xué)研究、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求,。高通量測序?qū)嶒?yàn)平臺,,包括NovaSeq6000、10XChromiumX,、BDFACSMelody,、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等,配合一支來自海內(nèi)外名校,、多學(xué)科交叉型的高素質(zhì)綜合團(tuán)隊(duì),,為您的科學(xué)研究保駕護(hù)航,。武漢10X Genomics單細(xì)胞測序技術(shù)支持
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司坐落在江月路999號奇亞特中心22幢,是一家專業(yè)的生物科技,、醫(yī)藥科技,、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,,市場營銷策劃,,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查、社會(huì)調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測驗(yàn)),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),,計(jì)算機(jī),、軟件及耗材(除專控),,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動(dòng)】公司。一批專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì),,是實(shí)現(xiàn)企業(yè)戰(zhàn)略目標(biāo)的基礎(chǔ),,是企業(yè)持續(xù)發(fā)展的動(dòng)力。公司業(yè)務(wù)范圍主要包括:單細(xì)胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細(xì)胞多組學(xué)測序等,。公司奉行顧客至上,、質(zhì)量為本的經(jīng)營宗旨,深受客戶好評,。公司憑著雄厚的技術(shù)力量,、飽滿的工作態(tài)度、扎實(shí)的工作作風(fēng),、良好的職業(yè)道德,,樹立了良好的單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序形象,贏得了社會(huì)各界的信任和認(rèn)可,。