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吉林烈冰生物單細(xì)胞測(cè)序

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-01

所謂的高通量測(cè)序技術(shù),,又名大規(guī)模平行測(cè)序,,是將DNA(或者cDNA)隨機(jī)片段化,、加接頭,,制備測(cè)序文庫(kù),通過(guò)對(duì)文庫(kù)中數(shù)以萬(wàn)計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng),,檢測(cè)對(duì)應(yīng)的信號(hào),,獲取序列信息。與傳統(tǒng)測(cè)序法(Sanger法等)相比,,高通量測(cè)序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有明顯的優(yōu)勢(shì),,又快(兩天)又多(數(shù)百萬(wàn)克隆),,成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù)。單細(xì)胞測(cè)序是一個(gè)系統(tǒng)的工程,,開展項(xiàng)目前您可能會(huì)先評(píng)估它提供的見解是否與您的研究問(wèn)題相匹配,,如果匹配,實(shí)驗(yàn)過(guò)程如何規(guī)劃,,實(shí)驗(yàn)平臺(tái)如何選擇,,樣本如何制備,數(shù)據(jù)如何分析等等,,而在這一切開始之前,,我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了,從銷售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持,,我們開通全線對(duì)接渠道,,幫助您快速定位項(xiàng)目訴求,提供從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)到文章發(fā)表的全流程,,我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴,。從樣本處理到終端數(shù)據(jù)分析,只要您需要,,烈冰提供全流程的無(wú)憂服務(wù),。吉林烈冰生物單細(xì)胞測(cè)序

針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié):主要是對(duì)細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量,、測(cè)序質(zhì)量進(jìn)行整體描述,。過(guò)濾標(biāo)準(zhǔn):由于細(xì)胞破碎后游離RNA會(huì)釋放到環(huán)境或孔中,并且測(cè)序中也會(huì)存在一些死細(xì)胞,,導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值,。因此,,我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來(lái)過(guò)濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞。以10×Genomics為例,,細(xì)胞數(shù)量判斷主要通過(guò)分析UMICounts-Barcode曲線斜率拐點(diǎn),,當(dāng)存在多個(gè)斜率拐點(diǎn)的時(shí)候,結(jié)合預(yù)期UMI=500時(shí)的細(xì)胞數(shù)量進(jìn)行過(guò)濾,。當(dāng)斜率拐點(diǎn)低于UMI=500的時(shí)候,,選擇UMI=500作為細(xì)胞的判斷的標(biāo)準(zhǔn);否則,,選擇和預(yù)期細(xì)胞數(shù)量接近的拐點(diǎn)作為細(xì)胞判斷的位置,。這樣我們能夠有效獲得真實(shí)的并且在基因數(shù)量上可以分析的數(shù)據(jù)。吉林10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)支持強(qiáng)勢(shì)發(fā)文,!烈冰單細(xì)胞測(cè)序助力揭示愈傷組織能再生的機(jī)制,。

樣本制備后的保存為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化,在對(duì)細(xì)胞進(jìn)行清洗和計(jì)數(shù)后,,單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上,,直至用于后續(xù)的上機(jī)和文庫(kù)制備步驟。在理想狀況下,,一旦制備好樣本,,應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而,,您還有必要了解各類細(xì)胞的不同性質(zhì),,因?yàn)檫@可能會(huì)影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時(shí)間,以及它們?cè)谥苽浜蠖嗑帽銘?yīng)當(dāng)被盡快使用,。例如,,有些細(xì)胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時(shí)間,它們就開始形成團(tuán)塊,。這些團(tuán)塊很難解離,,增加了堵塞的風(fēng)險(xiǎn),而且每個(gè)團(tuán)塊被當(dāng)成單細(xì)胞計(jì)數(shù),,又降低了細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性,。此外,有些細(xì)胞更加粘稠,,形成團(tuán)塊的速度更快,。對(duì)于這些細(xì)胞,必須盡量減少制備和使用之間的時(shí)間差

烈冰與國(guó)內(nèi)高校,、研究所,、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作,服務(wù)于600+臨床與研究機(jī)構(gòu),1000+客戶和5000+重要科研項(xiàng)目,,助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國(guó)際學(xué)術(shù)期刊(不完全統(tǒng)計(jì)),,在單細(xì)胞領(lǐng)域,烈冰助力用戶發(fā)表單細(xì)胞文獻(xiàn)30+篇,,總IF>300+,,IF>10+以上文章占比65%以上,包含Immunity,、NatureCellBiology,、NaturePlants、AdvancedScience等生物領(lǐng)域國(guó)際主流學(xué)術(shù)期刊,,已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究,、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機(jī)制,免疫研究,、腦神經(jīng),、白血病、胚胎發(fā)育,、糖尿病,、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等。烈冰對(duì)于一個(gè)細(xì)胞群體中的每個(gè)細(xì)胞單獨(dú)進(jìn)行建庫(kù)測(cè)序分析,。

細(xì)胞計(jì)數(shù)和活力評(píng)估在評(píng)估樣本質(zhì)量時(shí),,需要在細(xì)胞清洗和過(guò)濾之后測(cè)定細(xì)胞活力,這一點(diǎn)至關(guān)重要,。測(cè)定細(xì)胞活力有許多種方法,,烈冰多年單細(xì)胞測(cè)序經(jīng)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)臺(tái)盼藍(lán)法在鑒定活細(xì)胞與死細(xì)胞的比例時(shí)效果很好,。細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性以及目標(biāo)回收量和實(shí)際回收量之間的一致性,,取決于我們了解樣本中有多少個(gè)細(xì)胞。一旦過(guò)濾和清洗完成,,可采用細(xì)胞計(jì)數(shù)設(shè)備(如血球計(jì)數(shù)器或自動(dòng)細(xì)胞計(jì)數(shù)儀)進(jìn)行定量,。這些設(shè)備不但能提供準(zhǔn)確的細(xì)胞計(jì)數(shù),還能計(jì)算出向微流體芯片上樣適量細(xì)胞所需的細(xì)胞懸液體積,。烈冰全線實(shí)驗(yàn)平臺(tái)滿足超深度,、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復(fù)雜疾病研究的測(cè)序。長(zhǎng)沙10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)支持

基因測(cè)序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實(shí)驗(yàn)室研究逐漸演變到臨床應(yīng)用,,是下一個(gè)改變世界的技術(shù),。吉林烈冰生物單細(xì)胞測(cè)序

細(xì)胞中基因的表達(dá)是嚴(yán)格按照時(shí)間和空間順序發(fā)生,因此細(xì)胞類型和基因表達(dá)具有時(shí)間特異性和空間特異性,。時(shí)間特異性可以通過(guò)收集不同時(shí)間點(diǎn)的樣本進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序來(lái)分析,。但是單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(scRNA-Seq)在單細(xì)胞懸液制備的過(guò)程中破壞了細(xì)胞的空間結(jié)構(gòu),無(wú)法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個(gè)問(wèn)題,,其以點(diǎn)陣形式記錄組織切片細(xì)胞的空間信息,,在保留組織形態(tài)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,獲得細(xì)胞/基因的空間表達(dá)特異性,。吉林烈冰生物單細(xì)胞測(cè)序

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,,是一家服務(wù)型的公司。烈冰生物致力于為客戶提供良好的單細(xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,,一切以用戶需求為中心,,深受廣大客戶的歡迎。公司秉持誠(chéng)信為本的經(jīng)營(yíng)理念,,在醫(yī)藥健康深耕多年,,以技術(shù)為先導(dǎo),以自主產(chǎn)品為重點(diǎn),,發(fā)揮人才優(yōu)勢(shì),,打造醫(yī)藥健康良好品牌。烈冰生物秉承“客戶為尊,、服務(wù)為榮,、創(chuàng)意為先、技術(shù)為實(shí)”的經(jīng)營(yíng)理念,,全力打造公司的重點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)力,。