從單細(xì)胞測序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類型的功能解析,，越來越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角。通過單細(xì)胞多組學(xué)——即對不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個單細(xì)胞來源中檢測多種細(xì)胞特征,。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá),、細(xì)胞表面蛋白表達(dá),、免疫組庫序列（包括T細(xì)胞和B細(xì)胞受體）以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開放染色質(zhì)區(qū)域。隨著單個實驗可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),，研究人員的獲益更多,，包括保留珍貴樣本、提高生產(chǎn)力,、減少因批次效應(yīng)引起的錯誤,，并節(jié)省更多的高科技資源（從資助基金到人員時間）。全線搭建10x Genomics單細(xì)胞測序平臺,。天津10X Genomics單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析

為什么需要單細(xì)胞分辨率,？生物學(xué)就像宇宙一樣。它非常復(fù)雜,，有許多獨特的單體,，也就是細(xì)胞。這些細(xì)胞相互作用并扮演不同的角色,，在更大的體系中構(gòu)建并驅(qū)動多個過程,。就像伽利略探索宇宙的努力一樣，發(fā)現(xiàn)和定義這些細(xì)胞也需要高分辨率的工具,，才能解開促成生物學(xué)復(fù)雜性的基因表達(dá)異質(zhì)性,。單細(xì)胞測序能夠在以一個細(xì)胞為功能單位中開展生物學(xué)研究，闡明具體細(xì)節(jié),，構(gòu)建出一幅更大,、更精細(xì)的圖譜，說明導(dǎo)致產(chǎn)生某種外在表型的不同類型的分子和細(xì)胞之間是如何相互作用的：患者為什么會復(fù)發(fā),？是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問題,。廣州10X Genomics單細(xì)胞測序百萬通量平臺截至2021年10月，烈冰助力發(fā)表單細(xì)胞測序文章近20篇,。

所謂的高通量測序技術(shù),，又名大規(guī)模平行測序，是將DNA（或者cDNA）隨機片段化,、加接頭,，制備測序文庫，通過對文庫中數(shù)以萬計的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng),，檢測對應(yīng)的信號,，獲取序列信息。與傳統(tǒng)測序法（Sanger法等）相比,，高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時具有明顯的優(yōu)勢,，又快（兩天）又多（數(shù)百萬克隆）,，成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù),。單細(xì)胞測序是一個系統(tǒng)的工程,，開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配，如果匹配,，實驗過程如何規(guī)劃,，實驗平臺如何選擇，樣本如何制備,，數(shù)據(jù)如何分析等等,，而在這一切開始之前，我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了,，從銷售到實驗到專業(yè)技術(shù)支持,，我們開通全線對接渠道，幫助您快速定位項目訴求,，提供從實驗設(shè)計到文章發(fā)表的全流程，我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴,。

10XGenomics是一種基于drop的微流控技術(shù),，液體在配套芯片中的微管道中流動，因此細(xì)胞直徑會受到芯片中微管道直徑的限制,，微流體通道的直徑約為50~60um,，因此捕獲細(xì)胞的直徑不能超過40um。當(dāng)細(xì)胞直徑過大時,，容易出現(xiàn)管道堵塞,，造成GEM生成失敗，對于神經(jīng)科學(xué)研究和心血管疾病研究的老師而言,，準(zhǔn)備采用單細(xì)胞技術(shù)用于課題研究的時候,，往往會遇到一個尷尬的問題，就是目標(biāo)細(xì)胞,，例如神經(jīng)元細(xì)胞,、成熟心肌細(xì)胞由于體積過大，不適用于10X單細(xì)胞技術(shù),。其中神經(jīng)元細(xì)胞的直徑很大,，直接超過了芯片中管道的直徑,，雖然心肌細(xì)胞直徑低于50um,，但是成熟心肌細(xì)胞的長度很長,，有可能堵塞通道造成實驗失敗,，這也是為什么現(xiàn)在很多已發(fā)表的心臟單細(xì)胞文章，主要研究方向是心臟發(fā)育的原因了,，主要還是因為未發(fā)育成熟的心肌細(xì)胞比較小,，不會出現(xiàn)堵塞管道的風(fēng)險,。因此可以考慮組織解離后過40um濾網(wǎng)，過濾掉大細(xì)胞,，避免出現(xiàn)管道堵塞,、實驗失敗的風(fēng)險。此種方案的缺點是大細(xì)胞被過濾掉,，丟失相關(guān)細(xì)胞數(shù)據(jù),；另外組織解離獲得高質(zhì)量細(xì)胞懸液以后，繼續(xù)做細(xì)胞裂解抽細(xì)胞核,，開展細(xì)胞核測序。具體可訪問烈冰官網(wǎng)給我們留言,，烈小冰將安排專業(yè)技術(shù)為您詳細(xì)解答,。烈冰全線實驗平臺滿足超深度、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復(fù)雜疾病研究的測序,。

多樣本數(shù)據(jù)合并：FractionofReadsKept：合并樣本時,，各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,，需要進(jìn)行Downsample處理，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測序深度標(biāo)化到同一水平,，從而避免因測序深度差異導(dǎo)致的基因檢測數(shù)量,、基因表達(dá)水平的差異,。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷,、結(jié)果可視化、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程,！單細(xì)胞科聯(lián)合空間轉(zhuǎn)錄組,，展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達(dá)情況，揭示精細(xì)病理區(qū)域中“喚醒”的信號通路,。沈陽單細(xì)胞測序商業(yè)化服務(wù)

烈冰科技成立10余年,，為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù)。天津10X Genomics單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析

10XGenomics和Drop-Seq具有類似的技術(shù)原理,。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,，一列縱向孔道輸入細(xì)胞,，凝膠微珠與細(xì)胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上，并通過微流控技術(shù),，將之輸入到第二縱向孔道,，即油相孔道中。這時候,，就形成了一個個油滴并輸出并收集在EP管中,。每一個油滴中會落入一個細(xì)胞以及一個凝膠微珠，那么在每一個凝膠微珠中上長滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列,，再加上一端PolyT的抓手,，構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠。而這個凝膠微珠抓手就會使用oligodT抓住mRNA構(gòu)建文庫,。天津10X Genomics單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析

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