單細胞RNA-seq,、RNA-seq和逆轉(zhuǎn)錄qPCR(RT-qPCR)都采用一個共同過程,,即分離RNA并將其轉(zhuǎn)化為cDNA進行分析,。不過,,每種分析在開展方式和獲得的數(shù)據(jù)上有所不同,。RNA-seq和RT-qPCR都是先從大量細胞中分離RNA,,然后將其轉(zhuǎn)化為cDNA,。RNA-seq是使用cDNA來構(gòu)建新一代測序文庫,,從而測定整個轉(zhuǎn)錄組的基因表達,。RT-qPCR則是從cDNA中擴增特定靶點,,并通過熒光測定表達水平,。RT-qPCR限于已知靶點,而RNA-seq可實現(xiàn)無偏倚的全轉(zhuǎn)錄組基因表達分析,。然而,,這兩者只能提供細胞群體內(nèi)基因表達的平均情況。單細胞RNA-seq則在分離RNA之前將單細胞分離到微孔或單個微反應(yīng)容器中,。然后用細胞特異性的條形碼標記RNA,,確保來自每個細胞的cDNA可以追溯到起源細胞。與RNA-seq相似,,帶有條形碼的cDNA也被用于構(gòu)建新一代測序文庫,,從而能夠?qū)γ總€細胞的整個轉(zhuǎn)錄組進行基因表達測定。ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測序的龐大世界,。長沙二代測序單細胞測序百萬通量平臺
烈冰生物搭建近10臺10XGemomics平臺,,目前為全國范圍內(nèi)的高校、醫(yī)院和研究所等單位的科研學(xué)者提供鼓舞,,10X微流體“雙十字”交叉系統(tǒng)為8或16通道系統(tǒng),,每個通道上限可捕獲20000細胞,16通道一次可檢測細胞范圍為百萬級別的細胞水平,。此外,,單個細胞捕獲效率高達65%,可準確鑒別稀有細胞類型,,利于稀有樣本或小細胞量類型樣本研究,;細胞可適性高,對細胞大?。ㄖ睆匠^40um細胞需要制備成細胞核)及類型無限制,。細胞捕獲周期較短,能夠?qū)崿F(xiàn)自動分離,,無需人工操作,,1天內(nèi)可完成從細胞懸液到cDNA文庫構(gòu)建的所有的測序準備工作。二代測序單細胞測序百萬通量平臺單個細胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達狀態(tài),,并鑒定細胞的類型,。
多樣本數(shù)據(jù)合并:FractionofReadsKept:合并樣本時,各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計算出來的數(shù)據(jù)利用率,。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,,需要進行Downsample處理,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平,,從而避免因測序深度差異導(dǎo)致的基因檢測數(shù)量,、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),,深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,;從操作便捷、結(jié)果可視化,、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,加速科研進程,!
烈冰科技專注為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù),,先后經(jīng)歷基因芯片時代、基因測序,、轉(zhuǎn)錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭,。2018年以來,單細胞測序進入發(fā)展的快車道,,烈冰作為國內(nèi)首批引進單細胞實驗雙平臺的公司,,依托自主研發(fā)的NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)分析平臺,為用戶提供一站式全流程的單細胞測序服務(wù)和解決方案,。4年的單細胞技術(shù)的積累,,烈冰已具備大鼠、小鼠,、斑馬魚,、猴、裸鼴鼠,、水稻,、擬南芥等10+物種,皮膚,、腦,、脂肪、心臟,、花序等50+組織類型,,100+細胞類型,1000+靶標基因,,10000+樣本處理經(jīng)驗,。單細胞測序是高通量測序下的又一重大技術(shù)突破。
科技的發(fā)展讓單細胞測序已經(jīng)應(yīng)用于疾病發(fā)展過程中的關(guān)鍵過程和事件,,如前病變向惡性的轉(zhuǎn)化,、惡性向轉(zhuǎn)移性的發(fā)展,以及對多種用藥的反應(yīng),。單細胞測序技術(shù)作為一個需要將組織解離成為單細胞懸液,,或者是采用細胞核捕獲的策略捕獲單細胞核,進而對于每一個單細胞或者細胞核進行測序得到結(jié)果的技術(shù),其空間定位信息是丟失的,。這就衍生出了一個問題就是如果單細胞A與B并不出現(xiàn)在一個組織區(qū)域中他們會互相影響或者轉(zhuǎn)化么,?免疫研究中,兩個具有非常強的PDL1-PD1的配對關(guān)系的細胞在組織切片上風馬牛不相及,,這樣PDL1-PD1的關(guān)系會生效么?烈冰單細胞多組學(xué)測序助您探究細胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)特征,。南京10X Chromium X單細胞測序
深度的單細胞測序數(shù)據(jù)解讀助力醫(yī)療健康大時代,。長沙二代測序單細胞測序百萬通量平臺
單細胞轉(zhuǎn)錄組測序是在單細胞水平上高通量測序分析基因表達譜的技術(shù),突破傳統(tǒng)高通量測序的局限性,,組織解離后,,單個樣本一次上機能捕獲500-20000個細胞,基于每個細胞分別建庫測序,,獲得單個細胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達狀態(tài),,并鑒定細胞的類型,可以在不同樣本間從細胞類型的組成和豐度角度進行比較,,反映細胞間的異質(zhì)性,。而2021年橫空出世的10XGenomicsChromiumX平臺實現(xiàn)了單塊chip上的百萬級別通量的細胞捕獲,系統(tǒng)實現(xiàn)16個通道同時運行,,每個通道可捕獲2000-20000個細胞(不混樣),,并支持原ChromiumController體統(tǒng)外的多種細胞捕獲百萬級別通量實驗,可準確鑒別稀有細胞類型和適配大規(guī)模單細胞研究,。長沙二代測序單細胞測序百萬通量平臺
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司坐落在江月路999號奇亞特中心22幢,,是一家專業(yè)的生物科技、醫(yī)藥科技,、信息科技,、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查,、社會調(diào)研、民意調(diào)查,、民意測驗),,從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù),計算機,、軟件及耗材(除??兀浖_發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】公司,。一批專業(yè)的技術(shù)團隊,,是實現(xiàn)企業(yè)戰(zhàn)略目標的基礎(chǔ),是企業(yè)持續(xù)發(fā)展的動力,。公司業(yè)務(wù)范圍主要包括:單細胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細胞多組學(xué)測序等,。公司奉行顧客至上、質(zhì)量為本的經(jīng)營宗旨,,深受客戶好評,。公司憑著雄厚的技術(shù)力量、飽滿的工作態(tài)度,、扎實的工作作風,、良好的職業(yè)道德,樹立了良好的單細胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學(xué)測序形象,,贏得了社會各界的信任和認可,。