單細(xì)胞測序結(jié)果動輒上百G數(shù)據(jù)量,，龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺和分析能力有著很高的要求,，首先針對下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié)：單細(xì)胞測序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列，不可避免的會出現(xiàn)低質(zhì)量的測序結(jié)果,，存在各種情況的序列污染,。因此序列過濾及質(zhì)量評估就會變得極為重要。序列質(zhì)量主要通過測序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來表征,，即堿基測序結(jié)果的錯(cuò)誤率在1%/0.1%以下的比例,。理想的測序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性,，為后續(xù)細(xì)胞類型鑒定和功能分析打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ),。烈冰科技成立10余年，為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù),。天津10X Chromium X單細(xì)胞測序商業(yè)化服務(wù)

烈冰與國內(nèi)高校,、研究所、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作,，服務(wù)于600+臨床與研究機(jī)構(gòu),，1000+客戶和5000+重要科研項(xiàng)目，助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國際學(xué)術(shù)期刊（不完全統(tǒng)計(jì)）,，在單細(xì)胞領(lǐng)域,，烈冰助力用戶發(fā)表單細(xì)胞文獻(xiàn)30+篇，總IF＞300+,，IF＞10+以上文章占比65%以上,，包含Immunity、NatureCellBiology,、NaturePlants,、AdvancedScience等生物領(lǐng)域國際主流學(xué)術(shù)期刊，已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究,、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機(jī)制,，免疫研究、腦神經(jīng),、白血病,、胚胎發(fā)育、糖尿病,、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等,。廈門烈冰生物單細(xì)胞測序豐富的測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn)，烈冰配套全程個(gè)性化,、定制化地?cái)?shù)據(jù)分析服務(wù),。

單細(xì)胞RNA-seq、RNA-seq和逆轉(zhuǎn)錄qPCR（RT-qPCR）都采用一個(gè)共同過程，即分離RNA并將其轉(zhuǎn)化為cDNA進(jìn)行分析,。不過,，每種分析在開展方式和獲得的數(shù)據(jù)上有所不同。RNA-seq和RT-qPCR都是先從大量細(xì)胞中分離RNA,，然后將其轉(zhuǎn)化為cDNA,。RNA-seq是使用cDNA來構(gòu)建新一代測序文庫，從而測定整個(gè)轉(zhuǎn)錄組的基因表達(dá),。RT-qPCR則是從cDNA中擴(kuò)增特定靶點(diǎn),，并通過熒光測定表達(dá)水平。RT-qPCR限于已知靶點(diǎn),，而RNA-seq可實(shí)現(xiàn)無偏倚的全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)分析,。然而，這兩者只能提供細(xì)胞群體內(nèi)基因表達(dá)的平均情況,。單細(xì)胞RNA-seq則在分離RNA之前將單細(xì)胞分離到微孔或單個(gè)微反應(yīng)容器中,。然后用細(xì)胞特異性的條形碼標(biāo)記RNA，確保來自每個(gè)細(xì)胞的cDNA可以追溯到起源細(xì)胞,。與RNA-seq相似,，帶有條形碼的cDNA也被用于構(gòu)建新一代測序文庫，從而能夠?qū)γ總€(gè)細(xì)胞的整個(gè)轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行基因表達(dá)測定,。

關(guān)于10XGenomics單細(xì)胞平臺的樣本類型和樣本制備：10X平臺在上機(jī)前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊,，獲得分離良好的細(xì)胞懸液、無細(xì)胞隨便,、極少的細(xì)胞團(tuán)塊,，且細(xì)胞活力高（＞70%）；此外,，了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要,。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān),。各種尺寸不同的細(xì)胞（一般直徑不大于50μm）均可與我們基因表達(dá)解決方案中使用的10XGenomics平臺兼容,。一般來說，細(xì)胞制備方案將根據(jù)組織來源和細(xì)胞類型而變化,。每種組織類型都是獨(dú)特的,，因此，必須在開始任何單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)之前優(yōu)化樣本制備,，烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗(yàn),，累積10+物種、50+組織的消化protocol,，若您的樣本為組織,，且尚未成功將組織樣本消化成單細(xì)胞懸液，烈冰將盡可能提供技術(shù)及實(shí)驗(yàn)上的幫助。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次突破性的改變,，一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進(jìn)行測定,。

烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,；從操作便捷、結(jié)果可視化,、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程,！此外,，烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器（SingleCellBrowser），不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,，還是可以實(shí)現(xiàn)三維立體化展示的軟件,。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰，專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您,，詳情請咨詢烈冰生物,。個(gè)性化制定測序項(xiàng)目方面，滿足從檢測基因到蛋白的多組學(xué)測序要求,。北京高通量測序單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析可視化

截至2021年10月,，烈冰助力發(fā)表單細(xì)胞測序文章近20篇。天津10X Chromium X單細(xì)胞測序商業(yè)化服務(wù)

烈冰科技作為國內(nèi)率先同時(shí)擁有10XGenomics和BDRhapsody雙分選平臺的測序服務(wù)商及云計(jì)算服務(wù)供應(yīng)商,，經(jīng)過多年實(shí)戰(zhàn),，擁有豐富的單細(xì)胞懸液制備和分選經(jīng)驗(yàn)，實(shí)測BDRhapsody對能夠高效捕獲粒細(xì)胞,。針對不同的分選平臺,、建庫方法，實(shí)戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預(yù)處理工作流程,；烈冰科技NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)平臺能有效支撐生命科學(xué)研究,、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求。高通量測序?qū)嶒?yàn)平臺,，包括NovaSeq6000,、10XChromiumX、BDFACSMelody,、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等,，配合一支來自海內(nèi)外名校、多學(xué)科交叉型的高素質(zhì)綜合團(tuán)隊(duì),，為您的科學(xué)研究保駕護(hù)航,。天津10X Chromium X單細(xì)胞測序商業(yè)化服務(wù)

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