空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的關(guān)鍵就在于,,解決了空間位置保留的問(wèn)題,。被放置在芯片區(qū)域內(nèi)的冰凍組織切片在經(jīng)過(guò)H&E染色和成像記錄后,會(huì)被進(jìn)行透化處理,,釋放細(xì)胞中的RNA,。芯片上的捕獲引物的中段設(shè)置了帶有獨(dú)特標(biāo)識(shí)的條形碼區(qū)域。芯片被劃分為了數(shù)個(gè)不同的捕獲區(qū)域,,每個(gè)捕獲區(qū)域中錨定的引物都帶有不同的條形碼序列,。每個(gè)區(qū)域?qū)?yīng)的組織位置會(huì)被記錄下來(lái),然后再進(jìn)行測(cè)序后,,通過(guò)條形碼將不同區(qū)域的測(cè)序結(jié)果,,映射到對(duì)應(yīng)的組織位置上,拼貼形成組織樣品的空間轉(zhuǎn)錄組圖像,??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)提供了空間轉(zhuǎn)錄組水平下的科學(xué)研究視角。濟(jì)南BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持
RNA測(cè)序(RNA-seq)是轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的重要工具,,也是生命科學(xué)領(lǐng)域常用的技術(shù)之一,。相比于傳統(tǒng)通路研究低維度、低通量的局限性,,轉(zhuǎn)錄組學(xué)有以下優(yōu)勢(shì):1)能夠動(dòng)態(tài)考察細(xì)胞基因組的表達(dá),,多維度地反映差異變化;2)可用于研究占RNA絕大部分的非編碼RNA,,研究其結(jié)構(gòu)以及在細(xì)胞生命活動(dòng)中的重要調(diào)控作用,;3)與蛋白組學(xué)研究相互補(bǔ)充,多角度呈現(xiàn)細(xì)胞水平的變化信息,。作為轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的技術(shù)基礎(chǔ),,RNA測(cè)序技術(shù)也在不斷地更新迭代,現(xiàn)如今更大通量,、更深精度的測(cè)序?yàn)楸姸嗫蒲泻歪t(yī)學(xué)工作者提供了豐富的工具和探索真理的手段,。合肥BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)測(cè)序空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以分子方式定義病理,完成了病理數(shù)字化結(jié)合病理影像化的革新,。
轉(zhuǎn)錄組分析指對(duì)細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的分析,。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序一般是對(duì)用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)進(jìn)行親和純化的RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄生成的成熟mRNA和ncRNA進(jìn)行高通量測(cè)序,。相對(duì)于傳統(tǒng)的芯片雜交平臺(tái),轉(zhuǎn)錄組測(cè)序無(wú)需預(yù)先針對(duì)已知序列設(shè)計(jì)探針,,即可對(duì)任意物種的整體轉(zhuǎn)錄活動(dòng)進(jìn)行檢測(cè),,提供更精確的數(shù)字化信號(hào),是目前深入研究轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性的強(qiáng)大工具,。FFPE空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)原理 為同時(shí)獲得空間表達(dá)和組織學(xué)背景信息,該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進(jìn)行組織學(xué)染色和成像,然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進(jìn)行表達(dá)定量,。
作為2019年的明星技術(shù)之一,10x Genomics單細(xì)胞測(cè)序憑借其高通量,、低成本,、易操作、穩(wěn)定性高等優(yōu)勢(shì)一直保持著高熱度,,目前利用該平臺(tái)發(fā)表的文章已達(dá)500多篇,。空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)優(yōu)勢(shì):實(shí)現(xiàn)基因表達(dá)數(shù)據(jù)與空間定位信息的結(jié)合,,解析多種類型組織切片樣本中基因表達(dá)譜,;無(wú)需組織解離,保留組織結(jié)構(gòu)及細(xì)胞微環(huán)境,,鑒定異質(zhì)性組織中細(xì)胞類型,,避免相關(guān)偏好性;可用于挖掘新的組織生物標(biāo)記物,;可與現(xiàn)行實(shí)驗(yàn)室組織分析方法輕松對(duì)接,,短時(shí)間內(nèi)即可完成切片及文庫(kù)制備流程??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)的迅速發(fā)展和應(yīng)用推廣,,為從多維度揭示疾病進(jìn)展提供了強(qiáng)有力的工具。
烈冰與國(guó)內(nèi)高校,、研究所,、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作,服務(wù)于600+臨床與研究機(jī)構(gòu),,1000+客戶和5000+重要科研項(xiàng)目,,助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國(guó)際學(xué)術(shù)期刊(不完全統(tǒng)計(jì)),在單細(xì)胞領(lǐng)域,,烈冰助力用戶發(fā)表單細(xì)胞文獻(xiàn)30+篇,,總IF>300+,IF>10+以上文章占比65%以上,,包含Immunity、NatureCellBiology,、NaturePlants,、AdvancedScience等生物領(lǐng)域國(guó)際主流學(xué)術(shù)期刊,,已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機(jī)制,,免疫研究,、腦神經(jīng)、白血病,、胚胎發(fā)育,、糖尿病、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等,。豐富的測(cè)序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn),,烈冰配套全程個(gè)性化、定制化地?cái)?shù)據(jù)分析服務(wù),。溫州上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)
國(guó)產(chǎn)化PanoCell空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序平臺(tái),,提供高性價(jià)比服務(wù)方案。濟(jì)南BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持
空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是在組織原位檢測(cè)全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)的?種技術(shù),,可以展?組織切?中不同區(qū)域的基因表達(dá)情況,,同時(shí)能夠得到?的基因在組織內(nèi)部的空間位置信息。與傳統(tǒng)的全基因轉(zhuǎn)錄組或單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序相?,,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序漿病理影像(H&E染?)與測(cè)序數(shù)據(jù)映射在?起,,進(jìn)?可以分析組織切內(nèi)部空間結(jié)構(gòu)的細(xì)胞異質(zhì)性。常規(guī)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)丟失了細(xì)胞在原組織中至關(guān)重要的空間位置信息,,而單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的同時(shí)保留并記錄了細(xì)胞的空間位置信息,。空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能夠揭示細(xì)胞間的相互作用以及細(xì)胞所處的微環(huán)境,,將成為發(fā)育生物學(xué),、神經(jīng)生物學(xué)、免疫生物學(xué)等領(lǐng)域的研究利器,。濟(jì)南BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司一直專注于生物科技,、醫(yī)藥科技、信息科技,、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,,市場(chǎng)營(yíng)銷策劃,市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查,、社會(huì)調(diào)研,、民意調(diào)查、民意測(cè)驗(yàn)),,從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),,計(jì)算機(jī),、軟件及耗材(除專控),,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】,是一家醫(yī)藥健康的企業(yè),,擁有自己**的技術(shù)體系,。公司目前擁有較多的高技術(shù)人才,以不斷增強(qiáng)企業(yè)重點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)力,,加快企業(yè)技術(shù)創(chuàng)新,,實(shí)現(xiàn)穩(wěn)健生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)。公司以誠(chéng)信為本,,業(yè)務(wù)領(lǐng)域涵蓋單細(xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,,我們本著對(duì)客戶負(fù)責(zé),對(duì)員工負(fù)責(zé),,更是對(duì)公司發(fā)展負(fù)責(zé)的態(tài)度,,爭(zhēng)取做到讓每位客戶滿意。公司深耕單細(xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,,正積蓄著更大的能量,,向更廣闊的空間、更寬泛的領(lǐng)域拓展,。