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長沙高通量測序單細胞測序商業(yè)化服務(wù)

來源: 發(fā)布時間:2022-08-11

10×Genomics單細胞方案要求使用具有較高活性的單細胞懸液,。在實際實驗中,我們發(fā)現(xiàn)因為樣本類型和制備單細胞懸液方法的不同,,容易出現(xiàn)單細胞懸液中死亡細胞的比例較高的情況,。去除單細胞懸液中的死細胞和其他污染物對獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)是至關(guān)重要的。這是因為,,死亡的細胞易裂解導(dǎo)致其中的RNA釋放出來,。這種cell-freeRNA會導(dǎo)致檢測的背景噪聲,并會影響單細胞數(shù)據(jù)的質(zhì)量,。因此當(dāng)樣本活性較差時,,對細胞懸液中細胞活性檢測后,需要進行一般死細胞去除的工作(一般懸液活性小于70%時考慮此操作),,以保證較高的上機捕獲細胞的質(zhì)量,。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定,。長沙高通量測序單細胞測序商業(yè)化服務(wù)

烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺,,針對龐大的單細胞測序數(shù)據(jù),能夠?qū)崿F(xiàn)細胞類型鑒定的快,、精,、準(zhǔn):一鍵導(dǎo)入genelist構(gòu)建個性化基因列表;輕松一點即可展示Marker基因的Featureplot,;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型,;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖,、Heatmap,、Violin圖,還可以通過調(diào)節(jié)寬,、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀,。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動化分析,,節(jié)省工作時間并提升整體工作效率重慶10X Chromium X單細胞測序服務(wù)公司經(jīng)驗豐富的實驗團隊,為獲得示組織內(nèi)真實表達水平的高質(zhì)量冷凍切片提供硬件和技術(shù)保障,。

科技的發(fā)展讓單細胞測序已經(jīng)應(yīng)用于疾病發(fā)展過程中的關(guān)鍵過程和事件,,如前病變向惡性的轉(zhuǎn)化,、惡性向轉(zhuǎn)移性的發(fā)展,以及對多種用藥的反應(yīng),。單細胞測序技術(shù)作為一個需要將組織解離成為單細胞懸液,,或者是采用細胞核捕獲的策略捕獲單細胞核,進而對于每一個單細胞或者細胞核進行測序得到結(jié)果的技術(shù),,其空間定位信息是丟失的,。這就衍生出了一個問題就是如果單細胞A與B并不出現(xiàn)在一個組織區(qū)域中他們會互相影響或者轉(zhuǎn)化么?免疫研究中,,兩個具有非常強的PDL1-PD1的配對關(guān)系的細胞在組織切片上風(fēng)馬牛不相及,,這樣PDL1-PD1的關(guān)系會生效么?

多樣本數(shù)據(jù)合并:FractionofReadsKept:合并樣本時,,各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計算出來的數(shù)據(jù)利用率,。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,需要進行Downsample處理,,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細胞測序深度標(biāo)化到同一水平,,從而避免因測序深度差異導(dǎo)致的基因檢測數(shù)量、基因表達水平的差異,。烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),,深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,;從操作便捷,、結(jié)果可視化、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,,加速科研進程!ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測序的龐大世界,。

單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉(zhuǎn)錄組測序分析,,可精確地描述每一個細胞的狀態(tài),在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有特殊的應(yīng)用價值,。然而,,單細胞測序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息,,對于揭示發(fā)育過程,、病理微環(huán)境都存在很大的局限性??臻g轉(zhuǎn)錄組測序以點陣形式記錄病理切片細胞的空間信息并進行測序,,可以精確指示點陣內(nèi)的全部基因表達情況??臻g轉(zhuǎn)錄組測序的加入,,無疑讓單細胞測序如虎添翼,,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。烈冰引進國際主流單細胞和空間轉(zhuǎn)錄組測序平臺,,保障細胞精度的前提下提供組織內(nèi)部精細區(qū)域的空間信息,。上海10X Genomics單細胞測序服務(wù)機構(gòu)

烈冰測序數(shù)據(jù)分析平臺,不依賴已有物種信息,,可研究非模式物種,,針對不同平臺的數(shù)據(jù),制定多套流程,;長沙高通量測序單細胞測序商業(yè)化服務(wù)

從單細胞測序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細胞類型的功能解析,,越來越需要一種多組學(xué)的細胞生物學(xué)視角。通過單細胞多組學(xué)——即對不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個單細胞來源中檢測多種細胞特征,。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達,、細胞表面蛋白表達、免疫組庫序列(包括T細胞和B細胞受體)以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開放染色質(zhì)區(qū)域,。隨著單個實驗可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),,研究人員的獲益更多,包括保留珍貴樣本,、提高生產(chǎn)力,、減少因批次效應(yīng)引起的錯誤,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時間),。長沙高通量測序單細胞測序商業(yè)化服務(wù)

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司主要經(jīng)營范圍是醫(yī)藥健康,,擁有一支專業(yè)技術(shù)團隊和良好的市場口碑。烈冰生物致力于為客戶提供良好的單細胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學(xué)測序,,一切以用戶需求為中心,,深受廣大客戶的歡迎。公司從事醫(yī)藥健康多年,,有著創(chuàng)新的設(shè)計,、強大的技術(shù),還有一批專業(yè)化的隊伍,,確保為客戶提供良好的產(chǎn)品及服務(wù),。烈冰生物秉承“客戶為尊、服務(wù)為榮,、創(chuàng)意為先,、技術(shù)為實”的經(jīng)營理念,全力打造公司的重點競爭力。