烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)，可實(shí)現(xiàn)零代碼操作,、簡(jiǎn)單方便：?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器的操作簡(jiǎn)單,，不需要命令行操作。簡(jiǎn)單拖拽,、設(shè)置參數(shù)即可運(yùn)行,，即使生信0基礎(chǔ)用戶(hù)也可以運(yùn)用自如；可視化展示海量結(jié)果文件：可視化展示Cluster的基因數(shù),，UMI數(shù)量,、線粒體RNA占比信息；以及不同Cluster對(duì)應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量,、基因表達(dá)量,、RNA表達(dá)量、樣本細(xì)胞分布,、線粒體RNA表達(dá)量等,；3D立體展示，文章動(dòng)圖先人一步：?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器針對(duì)t-SNE圖,、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進(jìn)行三維立體展示,，更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類(lèi)情況。烈冰引進(jìn)國(guó)際主流空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序平臺(tái),，提供保留組織內(nèi)部精細(xì)區(qū)域的空間信息的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,。濟(jì)南空間轉(zhuǎn)錄組

細(xì)胞中基因的表達(dá)是嚴(yán)格按照時(shí)間和空間順序發(fā)生，因此細(xì)胞類(lèi)型和基因表達(dá)具有時(shí)間特異性和空間特異性,。時(shí)間特異性可以通過(guò)收集不同時(shí)間點(diǎn)的樣本進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序來(lái)分析,。但是單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果動(dòng)輒上百G數(shù)據(jù)量，龐大的數(shù)據(jù)對(duì)于分析平臺(tái)和分析能力有著很高的要求,，單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（scRNA-Seq）在單細(xì)胞懸液制備的過(guò)程中破壞了細(xì)胞的空間結(jié)構(gòu),，無(wú)法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個(gè)問(wèn)題,，其以點(diǎn)陣形式記錄組織切片細(xì)胞的空間信息,。廈門(mén)烈冰空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是高通量測(cè)序下的又一重大技術(shù)突破,。

作為2019年的明星技術(shù)之一，10x Genomics單細(xì)胞測(cè)序憑借其高通量,、低成本,、易操作、穩(wěn)定性高等優(yōu)勢(shì)一直保持著高熱度,，目前利用該平臺(tái)發(fā)表的文章已達(dá)500多篇,。空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)優(yōu)勢(shì)：實(shí)現(xiàn)基因表達(dá)數(shù)據(jù)與空間定位信息的結(jié)合,，解析多種類(lèi)型組織切片樣本中基因表達(dá)譜,；無(wú)需組織解離，保留組織結(jié)構(gòu)及細(xì)胞微環(huán)境,，鑒定異質(zhì)性組織中細(xì)胞類(lèi)型,，避免相關(guān)偏好性；可用于挖掘新的組織生物標(biāo)記物,；可與現(xiàn)行實(shí)驗(yàn)室組織分析方法輕松對(duì)接,，短時(shí)間內(nèi)即可完成切片及文庫(kù)制備流程。

當(dāng)組織冷凍切片附在帶有spatialbarcode的空間轉(zhuǎn)錄組芯片上時(shí),，通過(guò)透化處理,，細(xì)胞內(nèi)的mRNA釋放出來(lái)，從而被芯片上帶有oligo-dT的探針捕獲,。被捕獲的mRNA開(kāi)始逆轉(zhuǎn)錄,，得到的cDNA中包含了spatialbarcode序列。通過(guò)上機(jī)測(cè)序,，可以將每個(gè)mRNA轉(zhuǎn)錄的序列映射回組織切片中的映射回組織切片中的原始位置,。Visium空間轉(zhuǎn)錄組的重點(diǎn)在于芯片部分：正式文庫(kù)構(gòu)建的芯片上有4個(gè)捕獲區(qū)域（6.5mmX6.5mm，可以檢測(cè)4個(gè)樣本）每個(gè)捕獲區(qū)域含有約5000個(gè)被條形碼標(biāo)記的點(diǎn)（barcodedspots）每個(gè)spot直徑55μm,，每個(gè)spot能捕獲1-10個(gè)細(xì)胞spot與spot中心點(diǎn)之間的距離為100μm每個(gè)spot含有上百萬(wàn)個(gè)可以與mRNA結(jié)合的捕獲探針,，每個(gè)探針上都帶有獨(dú)特的spatialbarcodes，用以標(biāo)記捕獲的mRNA的空間位置,。全線搭建10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序平臺(tái)。

空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是在組織原位檢測(cè)全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)的?種技術(shù),，可以展?組織切?中不同區(qū)域的基因表達(dá)情況,，同時(shí)能夠得到?的基因在組織內(nèi)部的空間位置信息。與傳統(tǒng)的全基因轉(zhuǎn)錄組或單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序相?,，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序漿病理影像（H&E染?）與測(cè)序數(shù)據(jù)映射在?起,，進(jìn)?可以分析組織切內(nèi)部空間結(jié)構(gòu)的細(xì)胞異質(zhì)性。常規(guī)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)丟失了細(xì)胞在原組織中至關(guān)重要的空間位置信息,，而單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的同時(shí)保留并記錄了細(xì)胞的空間位置信息,?？臻g轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能夠揭示細(xì)胞間的相互作用以及細(xì)胞所處的微環(huán)境，將成為發(fā)育生物學(xué),、神經(jīng)生物學(xué),、免疫生物學(xué)等領(lǐng)域的研究利器?；驕y(cè)序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實(shí)驗(yàn)室研究逐漸演變到臨床應(yīng)用,，是下一個(gè)改變世界的技術(shù)。西安烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù)公司

烈冰生物成立于2010年,，專(zhuān)注于空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序領(lǐng)域科研服務(wù),。濟(jì)南空間轉(zhuǎn)錄組

空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的數(shù)據(jù)分析基本分為三個(gè)階段：1.數(shù)據(jù)的預(yù)處理部分；2.Spot點(diǎn)陣的分群與定義,；3.Spot分群的功能與生物學(xué)價(jià)值,。每一個(gè)部分都不可或缺，其結(jié)果都對(duì)后續(xù)的分析結(jié)果有重要影響,。由于空間轉(zhuǎn)錄組的序列結(jié)構(gòu)與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的左端序列結(jié)構(gòu)是非常接近的,，都是Cellbarcode/SpotBarcode+UMI+捕獲區(qū)域這樣的設(shè)計(jì)。右端普遍為捕獲的RNA序列,。因此采用單細(xì)胞的原始數(shù)據(jù)過(guò)濾策略即可,，左端可以考慮切下捕獲區(qū)域前的序列區(qū)域作為后續(xù)分析用的序列以減少分析負(fù)荷。隨后,，采用10X官方的Spatialranger的策略進(jìn)行后續(xù)分析,，解析出位于空間位置中的有效的Spot表達(dá)矩陣。濟(jì)南空間轉(zhuǎn)錄組

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司擁有生物科技,、醫(yī)藥科技,、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開(kāi)發(fā),、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢(xún),，市場(chǎng)營(yíng)銷(xiāo)策劃,，市場(chǎng)信息咨詢(xún)與調(diào)查（不得從事社會(huì)調(diào)查、社會(huì)調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測(cè)驗(yàn)），從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),，計(jì)算機(jī),、軟件及耗材（除專(zhuān)控），軟件開(kāi)發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,，經(jīng)相關(guān)部門(mén)批準(zhǔn)后方可開(kāi)展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】等多項(xiàng)業(yè)務(wù),，主營(yíng)業(yè)務(wù)涵蓋單細(xì)胞測(cè)序,，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái)，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,，單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,。公司目前擁有較多的高技術(shù)人才，以不斷增強(qiáng)企業(yè)重點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)力,，加快企業(yè)技術(shù)創(chuàng)新,，實(shí)現(xiàn)穩(wěn)健生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)。上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司主營(yíng)業(yè)務(wù)涵蓋單細(xì)胞測(cè)序,，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,，堅(jiān)持“質(zhì)量保證,、良好服務(wù)、顧客滿(mǎn)意”的質(zhì)量方針,，贏得廣大客戶(hù)的支持和信賴(lài),。公司憑著雄厚的技術(shù)力量、飽滿(mǎn)的工作態(tài)度,、扎實(shí)的工作作風(fēng),、良好的職業(yè)道德，樹(shù)立了良好的單細(xì)胞測(cè)序,，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序形象,，贏得了社會(huì)各界的信任和認(rèn)可,。