空間轉(zhuǎn)錄組學（Spatial Transcriptomics）是指在組織切片上完成,，保留樣本空間信息的組學研究,。空間轉(zhuǎn)錄組可展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達情況,，揭示精細病理區(qū)域中激發(fā)的信號通路,，完成分子特征驅(qū)動病理特征的機制解析?？臻g轉(zhuǎn)錄組學完成了病理數(shù)字化結合病理影像化的技術革新,，對于診斷標志物、耐藥位點以及靶向藥物的研發(fā),，免疫治等新興領域都具有重要作用,。當組織冷凍切片附在帶有spatialbarcode的空間轉(zhuǎn)錄組芯片上時，通過透化處理,，細胞內(nèi)的mRNA釋放出來,，從而被芯片上帶有oligo-dT的探針捕獲。被捕獲的mRNA開始逆轉(zhuǎn)錄,，得到的cDNA中包含了spatialbarcode序列,。通過上機測序，可以將每個mRNA轉(zhuǎn)錄的序列映射回組織切片中的映射回組織切片中的原始位置,。搭建多種測序數(shù)據(jù)的生物信息分析平臺,，5000+項目檢驗，真實可信賴,。廣州烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務

烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺,，針對龐大的單細胞測序數(shù)據(jù)，能夠?qū)崿F(xiàn)細胞類型鑒定的快,、精、準：一鍵導入genelist構建個性化基因列表,；輕松一點即可展示Marker基因的Featureplot,；任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型,；一鍵獲得t-SNE圖,、Heatmap和Violin圖：輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap,、Violin圖,，還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀,。平臺上線300+task自主分析工具,、50+pipeline工作流模板,，幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動化分析，節(jié)省您的工作時間并提升整體工作效率,。杭州scRNA空間轉(zhuǎn)錄組測序空間轉(zhuǎn)錄組測序技術遍地開花,，烈冰服務讓您的生物醫(yī)學研究如虎添翼。

空間轉(zhuǎn)錄組技術流程：1,、組織優(yōu)化由于不同物種,、組織來源的樣本所需的比較好透化時間不盡相同，在正式開展空間轉(zhuǎn)錄組測序?qū)嶒炃?，需要利用組織優(yōu)化kit進行條件的摸索,。組織優(yōu)化芯片上包含8個捕獲區(qū)域，每個區(qū)域均覆蓋了熒光標記探針,，可捕獲mRNA形成帶有熒光標簽的cDNA,，隨即可通過熒光成像結果判定比較好透化時間及組織優(yōu)化條件。2,、空間轉(zhuǎn)錄組測序確定組織優(yōu)化條件后,，即可進行切片、H&E染色及成像,、空間轉(zhuǎn)錄組文庫構建及測序分析流程,。

空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)質(zhì)量和玻片有效區(qū)域的利用率、貼片的質(zhì)量和透化時間息息相關,。貼片質(zhì)量不良會影響總的有效spot數(shù)等,；而透化不合理會導致spot的reads數(shù)、基因中位數(shù)等參數(shù),。而在特異性基因表達方面,，我們也可以統(tǒng)計空間轉(zhuǎn)錄組群體的特異性基因表達即Markergene，將他們在組織切片以及空轉(zhuǎn)上進行著色,。我們也可以對于任意一個已知的基因或者數(shù)據(jù)庫中的一些細胞Marker,，然后將其在基因表達在空間轉(zhuǎn)錄組的切片以及HE染色上展示自己的基因表達進而了解，群體中的可能的細胞組成關系,。烈冰專精空間轉(zhuǎn)錄組測序領域,。

烈冰配置了LEICA CM1950冷凍切片機，搭配切片經(jīng)驗豐富的實驗團隊,，可以提供一致性更高,、實驗操作更精細的冷凍切片準備方案，保持密切高效的溝通,，設計更適合的實驗方案,，確保每一個實驗細節(jié)有效進行,；烈冰升級配置尼康相差顯微鏡和CCD成像系統(tǒng),，更高清分辨率解析組織切片原始圖像信息,，10X,20X,40X,60X更多物鏡選擇，為不同大小的樣本提供更清晰的圖像,，更精細的圖像信息采集,、拼接策略，為樣本內(nèi)微小區(qū)域的組織學提供更清晰的影像,；深度的空間轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)解讀助力生物健康醫(yī)療時代,。高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組服務機構

烈冰開展了空間轉(zhuǎn)錄組、單細胞多組學以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案,。廣州烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務

當組織冷凍切片附在帶有spatialbarcode的空間轉(zhuǎn)錄組芯片上時,，通過透化處理，細胞內(nèi)的mRNA釋放出來,，從而被芯片上帶有oligo-dT的探針捕獲,。被捕獲的mRNA開始逆轉(zhuǎn)錄，得到的cDNA中包含了spatialbarcode序列,。通過上機測序,，可以將每個mRNA轉(zhuǎn)錄的序列映射回組織切片中的映射回組織切片中的原始位置。Visium空間轉(zhuǎn)錄組的重點在于芯片部分：正式文庫構建的芯片上有4個捕獲區(qū)域（6.5mmX6.5mm,，可以檢測4個樣本）每個捕獲區(qū)域含有約5000個被條形碼標記的點（barcodedspots）每個spot直徑55μm,，每個spot能捕獲1-10個細胞spot與spot中心點之間的距離為100μm每個spot含有上百萬個可以與mRNA結合的捕獲探針，每個探針上都帶有獨特的spatialbarcodes,，用以標記捕獲的mRNA的空間位置,。廣州烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司擁有生物科技、醫(yī)藥科技,、信息科技,、計算機科技領域內(nèi)的技術開發(fā)、技術服務,、技術轉(zhuǎn)讓,、技術咨詢，市場營銷策劃,，市場信息咨詢與調(diào)查（不得從事社會調(diào)查,、社會調(diào)研、民意調(diào)查,、民意測驗）,，從事貨物及技術的進出口業(yè)務，計算機,、軟件及耗材（除?？兀浖_發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目，經(jīng)相關部門批準后方可開展經(jīng)營活動】等多項業(yè)務,，主營業(yè)務涵蓋單細胞測序,，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉(zhuǎn)錄組測序,，單細胞多組學測序,。公司目前擁有較多的高技術人才，以不斷增強企業(yè)重點競爭力,，加快企業(yè)技術創(chuàng)新,，實現(xiàn)穩(wěn)健生產(chǎn)經(jīng)營。上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司主營業(yè)務涵蓋單細胞測序,，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細胞多組學測序,，堅持“質(zhì)量保證,、良好服務、顧客滿意”的質(zhì)量方針,，贏得廣大客戶的支持和信賴,。公司憑著雄厚的技術力量、飽滿的工作態(tài)度,、扎實的工作作風,、良好的職業(yè)道德，樹立了良好的單細胞測序,，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細胞多組學測序形象,，贏得了社會各界的信任和認可,。