單細(xì)胞多組學(xué)提升見解基于測序的數(shù)據(jù)能夠?qū)⒄蔑@其強大之處,,因為它能夠了解同一單細(xì)胞的多種生物分析指標(biāo),。如果說單細(xì)胞基因表達(dá)提供了一種顏色的詳細(xì)信息,那么單細(xì)胞多組學(xué)提供了同一細(xì)節(jié)的全彩色圖譜,,為您帶來樣本的真實視圖,。烈冰2021年強勢引進(jìn)的10xGenomicsChromium單細(xì)胞平臺能夠從同一單細(xì)胞中讀取細(xì)胞復(fù)雜性的多組學(xué)特征,。與傳統(tǒng)方法不同,單細(xì)胞多組學(xué)簡化了您需要開展的實驗,,也節(jié)省了您需要分析的樣本,而能獲得相同的結(jié)果,。這不但節(jié)省了寶貴的樣本,,還保證了更高的生物學(xué)準(zhǔn)確性,因為您不需要匹配拆分樣本的數(shù)據(jù)集并通過計算來推斷各個組學(xué)之間的關(guān)系,。單細(xì)胞測序是高通量測序下的又一重大技術(shù)突破,。廣東10X Chromium X單細(xì)胞測序
相對于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問題,10X平臺普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1000-20000不等的測序細(xì)胞量,,這個量級的測序細(xì)胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的SingleCell群體類型,。因此,,這兩種技術(shù)對于基于基因表達(dá)進(jìn)行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上,無論是從細(xì)胞數(shù)量上來說還是表達(dá)檢測可靠性來說,,都會更實用,。同時依托RandomCellLabel技術(shù),使得其對于NovaSeq,、HiSeqXTen,、Hiseq4000等設(shè)備存在的Indexhooping現(xiàn)象,相對于Smart-Seq數(shù)據(jù)來說,,影響幾乎可以忽略不計(10XGenomics官方網(wǎng)站曾給出hooping測試結(jié)果,,顯示無影響。武漢高通量測序單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析可視化烈冰對于一個細(xì)胞群體中的每個細(xì)胞單獨進(jìn)行建庫測序分析,。
基因和基因產(chǎn)物并不是單獨運作的,,而是參與了相互關(guān)聯(lián)的復(fù)雜通路、網(wǎng)絡(luò)和分子系統(tǒng),,這些合在一起實現(xiàn)了細(xì)胞,、組織和生物體的運作。定義這些系統(tǒng)并確定它們的特征和相互作用,,對于了解生物系統(tǒng)如何運作至關(guān)重要,。”為了推動科學(xué)發(fā)現(xiàn),,科學(xué)家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛在生物復(fù)雜性的研究工具,。對于越來越多的研究人員來說,單細(xì)胞RNA測序和單細(xì)胞多組學(xué)——即在單細(xì)胞分辨率下對基因表達(dá)及其他基于DNA,、RNA或蛋白質(zhì)的分析物進(jìn)行定量分析的基因組方法——在幫助解決他們面臨的生物學(xué)問題上已證實是行之有效的,。
單細(xì)胞測序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團(tuán)隊傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺,可實現(xiàn)零代碼操作,、簡單方便:單細(xì)胞瀏覽器的操作簡單,,不需要命令行操作。簡單拖拽,、設(shè)置參數(shù)即可運行,,即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運用自如;可視化展示海量結(jié)果文件:可視化展示Cluster的基因數(shù),,UMI數(shù)量,、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量,、基因表達(dá)量,、RNA表達(dá)量、樣本細(xì)胞分布,、線粒體RNA表達(dá)量等,;3D立體展示,,文章動圖先人一步:單細(xì)胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進(jìn)行三維立體展示,,更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類情況,。烈冰生物全轉(zhuǎn)錄組測序通過雙文庫構(gòu)建,實現(xiàn)多種RNA的一網(wǎng)打盡,。
機體為響應(yīng)各種應(yīng)激,,其細(xì)胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”;當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時,,往往會經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,,導(dǎo)致一些基因被沉默,一些基因被重新“喚醒”,,但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的,;scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細(xì)胞狀態(tài)。擬時序分析,,即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時間的變化情況,,構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育,但這里的時間并不是真時間,,而是一個虛擬的時間,,是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中,,也會存在多種不同的細(xì)胞形態(tài),。因此,不論測定了多少樣本,,我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述,。烈冰生物成立于2010年,專注于單細(xì)胞測序領(lǐng)域科研服務(wù),。成都10X Genomics單細(xì)胞測序平臺
單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析,,認(rèn)準(zhǔn)烈冰NovelBrain生物信息數(shù)據(jù)分析平臺。廣東10X Chromium X單細(xì)胞測序
單細(xì)胞獲得困難,,不同組織要求不盡相同難以搞定,?烈冰2000+項目消化經(jīng)驗,100+組織類型解離protocol,,精心設(shè)計不同組織實驗的解離,、細(xì)胞懸浮實驗體系,確保單細(xì)胞的獲得,。凍存樣本無法實驗,,珍貴樣本無法使用,?烈冰采用國際認(rèn)可的凍存組織復(fù)蘇技術(shù)以及死細(xì)胞過濾技術(shù),,確保凍存組織使用,。珍貴樣本,細(xì)胞數(shù)量太少,,消化背景雜無法做單細(xì)胞,?采用國際認(rèn)可的10XGenomics,BDRhapsody雙平臺模式,,根據(jù)樣本實際情況和用戶需求提供客觀有效的實驗方案,細(xì)胞量少,,背景雜也能做單細(xì)胞。單細(xì)胞RNA分類精度不足,,部分細(xì)胞無法細(xì)分,?烈冰同時采用單細(xì)胞蛋白質(zhì)組與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),真正做到從上游到下游的全流程檢測,,確保超高的細(xì)胞分類精度,。廣東10X Chromium X單細(xì)胞測序
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,是一家服務(wù)型的公司,。烈冰生物致力于為客戶提供良好的單細(xì)胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序,,一切以用戶需求為中心,深受廣大客戶的歡迎,。公司從事醫(yī)藥健康多年,,有著創(chuàng)新的設(shè)計、強大的技術(shù),,還有一批專業(yè)化的隊伍,,確保為客戶提供良好的產(chǎn)品及服務(wù)。烈冰生物秉承“客戶為尊,、服務(wù)為榮,、創(chuàng)意為先、技術(shù)為實”的經(jīng)營理念,,全力打造公司的重點競爭力,。