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長沙10X Chromium X單細胞測序

來源: 發(fā)布時間:2022-08-21

細胞中基因的表達是嚴格按照時間和空間順序發(fā)生,因此細胞類型和基因表達具有時間特異性和空間特異性。時間特異性可以通過收集不同時間點的樣本進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序來分析,。但是單細胞轉(zhuǎn)錄組測序(scRNA-Seq)在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結(jié)構(gòu),,無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個問題,,其以點陣形式記錄組織切片細胞的空間信息,在保留組織形態(tài)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,獲得細胞/基因的空間表達特異性,。過去的十年,我們是知識的承載者,;現(xiàn)在,,我們在努力構(gòu)建醫(yī)學的大數(shù)據(jù)時代;未來我們將重新定義知識形態(tài),!長沙10X Chromium X單細胞測序

基因和基因產(chǎn)物并不是單獨運作的,,而是參與了相互關(guān)聯(lián)的復(fù)雜通路、網(wǎng)絡(luò)和分子系統(tǒng),,這些合在一起實現(xiàn)了細胞,、組織和生物體的運作。定義這些系統(tǒng)并確定它們的特征和相互作用,,對于了解生物系統(tǒng)如何運作至關(guān)重要,。”為了推動科學發(fā)現(xiàn),,科學家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛在生物復(fù)雜性的研究工具,。對于越來越多的研究人員來說,單細胞RNA測序和單細胞多組學——即在單細胞分辨率下對基因表達及其他基于DNA,、RNA或蛋白質(zhì)的分析物進行定量分析的基因組方法——在幫助解決他們面臨的生物學問題上已證實是行之有效的,。合肥單細胞測序商業(yè)化服務(wù)全線搭建10X Genomics Chromium Controller單細胞測序平臺。

機體為響應(yīng)各種應(yīng)激,,其細胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”,;當細胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時,往往會經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,,導(dǎo)致一些基因被沉默,,一些基因被重新“喚醒”,但純化這些瞬態(tài)細胞進行研究是很困難或不可能的;scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細胞狀態(tài),。擬時序分析,,即根據(jù)不同細胞亞群基因表達量隨時間的變化情況,構(gòu)建細胞譜系發(fā)育,,但這里的時間并不是真時間,,而是一個虛擬的時間,是指的細胞與細胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡,。即使在同一個樣本中,,也會存在多種不同的細胞形態(tài)。因此,,不論測定了多少樣本,,我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細胞轉(zhuǎn)化和變化進行描述。

對于單細胞測序而言,,常常需要先構(gòu)建細胞圖譜,,在此基礎(chǔ)上再開展后續(xù)各項分析,并且數(shù)據(jù)分析時以細胞聚類(cellcluster)為討論對象,,而不是像常規(guī)Bulk測序一樣以組別為分析對象,,因此單細胞測序項目對樣本入組要求沒有Bulk測序那樣嚴格,但是單細胞測序,,特別是目的為圖譜研究時,,需要通過提高樣本復(fù)雜度(增加樣本數(shù)),盡可能的構(gòu)建某一疾病類型,、群體細胞圖譜信息,。因此,單細胞測序?qū)嶒炘O(shè)計時首先需要保證生物學重復(fù),,不同樣本來源的樣本建議單獨進行細胞解離和捕獲,、建庫、測序,,以保證捕獲到足夠的細胞數(shù),,單個樣本分別捕獲細胞時,后續(xù)分析除了整體分析以外,,還可以做單樣本分析,,保證分析的完備準確性。烈冰專研單細胞多組學測序領(lǐng)域,。

烈冰生物成立于2010年,,與時俱進,堅持為科研學者提供國際前沿的高通量測序?qū)嶒灪蜕疃鹊纳镄畔?shù)據(jù)分析服務(wù),,已逐步發(fā)展為單細胞多組學檢測服務(wù)****,。專注于“單細胞測序系列技術(shù)服務(wù)”的專精領(lǐng)域,,在上海、北京,、廣州,、西安和江西等地擁有數(shù)千平辦公場所,,并布局多中心產(chǎn)品研發(fā)生產(chǎn)基地和營銷,、運營中心。2016年起連續(xù)被評為上海市****,,60+項自主知識產(chǎn)權(quán),,轉(zhuǎn)化率近80%。產(chǎn)品覆蓋從單細胞測序,,核測序,,單細胞多組學,空間轉(zhuǎn)錄組測序等多組學聯(lián)合的實驗+數(shù)據(jù)分析全流程服務(wù)平臺,。為600+國內(nèi)高校和醫(yī)院,、5000+深度合作學者用戶、10000+生命科學探索的重要科研項目在醫(yī)藥開發(fā),、科學研究,、醫(yī)學及臨床研究,疾病分子標志物篩選,、生命和神經(jīng)發(fā)育研究等提供多層次,、多組學檢測服務(wù)和解決方案,助力300+CNS國際學術(shù)期刊文章發(fā)表,,30+篇單細胞技術(shù)聯(lián)合(助力)發(fā)文,,IF10+文章占比>65%。豐富的測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗,,烈冰配套全程個性化,、定制化地數(shù)據(jù)分析服務(wù)。合肥單細胞測序服務(wù)公司

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