空間轉錄組測序的關鍵就在于,,解決了空間位置保留的問題,。被放置在芯片區(qū)域內(nèi)的冰凍組織切片在經(jīng)過H&E染色和成像記錄后,會被進行透化處理,,釋放細胞中的RNA,。芯片上的捕獲引物的中段設置了帶有獨特標識的條形碼區(qū)域。芯片被劃分為了數(shù)個不同的捕獲區(qū)域,,每個捕獲區(qū)域中錨定的引物都帶有不同的條形碼序列,。每個區(qū)域對應的組織位置會被記錄下來,然后再進行測序后,,通過條形碼將不同區(qū)域的測序結果,,映射到對應的組織位置上,拼貼形成組織樣品的空間轉錄組圖像,。烈冰生物為您提供一站式全流程空間轉錄組測序服務,。無錫上海烈冰生物空間轉錄組測序服務
烈冰提供空間轉錄組全流程服務,包括樣本包埋,、貼片,、選片、HE染色、拍照成像,、組織透化,、建庫測序以及后續(xù)的FISH驗證等各個步驟,為您提供無憂服務,。烈冰搭建了以萊卡CM1950冷凍切片機,、尼康多熒光通路全自動掃描顯微鏡、3Dhistech-midi數(shù)字掃描儀為基礎的先進實驗平臺,,并制定嚴格規(guī)范的實驗室SOP,,經(jīng)過大量的切片、貼片實操演練,,對不同類型組織的切片厚度,、溫度進行優(yōu)化,確保獲得更好質(zhì)量的冷凍切片,。利用NovelBrain云分析平臺,,搭建0代碼需求的空間轉錄組分析流程,準確快速解析空間轉錄組數(shù)據(jù),。取同一樣本組織的相鄰區(qū)域進行單細胞轉錄組測序,,通過單細胞轉錄組數(shù)據(jù)和空間轉錄組數(shù)據(jù)的整合分析,判定空間區(qū)域內(nèi)的細胞類別,,精確解析組織空間內(nèi)的異質(zhì)化信息,。青島烈冰科技空間轉錄組服務機構助力探索生命時空多維度的動態(tài)變化的生物學信息;助力生命健康醫(yī)療大時代,!
烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業(yè),,為科研學者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務,先后經(jīng)歷基因芯片時代,、基因測序,、轉錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來,,烈冰依托自主研發(fā)的NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)分析平臺,,為用戶提供一站式全流程的空間轉錄組測序服務和解決方案。烈冰經(jīng)過十幾年的經(jīng)歷,,已具備大鼠,、小鼠、斑馬魚,、猴,、裸鼴鼠、水稻,、擬南芥等10+物種,,皮膚、腦、胰腺,、脂肪,、心臟、花序等50+組織類型,,100+細胞類型,,1000+靶標基因,10000+樣本處理經(jīng)驗,。
烈冰生物生信分析團隊緊追國際前沿,、整合添加多項國際期刊認可的空轉分析工具,構建一套完整的數(shù)據(jù)分析流程,;精心研發(fā)空轉結果瀏覽器,,可同步展示空間轉錄組與單細胞測序分析結果,詳細深入地解析空間轉錄組數(shù)據(jù),。完成從Rawdata(原始數(shù)據(jù))到Spot-Gene的具有定位信息的表達矩陣的過程后,,就進入了空轉的第二步,去進行Spot的Cluster的過程,,熟悉單細胞測序的研究者知道,,Cluster在單細胞測序中往往表示為細胞的類型,也就是說能聚在一起采用算法分為一個群體細胞是一個Celltype(當然分情況也會有不同),。而在空轉中,,也正是由于前面提到了細胞的非單一性,導致了這里的分群并不是單純的同一細胞類型,,而應該認為是具有相同細胞組成的點陣區(qū)域,或者說是近似的組織結構區(qū)域,。烈冰引進國際主流空間轉錄組測序平臺,,提供保留組織內(nèi)部精細區(qū)域的空間信息的轉錄組測序。
基于橋式PCR技術的簇生成可以將模版鏈迅速擴增成千上萬倍,,保證過程中足夠的測序深度,。測序時使用特殊標記的dNTP:1)堿基上通過敏感鍵修飾上不同的熒光基團,用于區(qū)分ATCG,;2)3端使用疊氮基團封閉,,保證一次循環(huán)只上一個dNTP。每一輪循環(huán)結束時,,會通過高速熒光顯微鏡記錄熒光圖像,,再通入試劑除去熒光基團和疊氮基團,開啟下一循環(huán),。通過分析讀取同一位點的熒光,,實時獲取模版鏈的堿基序列。由于過程中使用的化學反應并不可控,隨著循環(huán)數(shù)的增大會出現(xiàn)不同步的情況,,因此Illumina的讀長只能限制在200bp左右,。烈冰空間轉錄組測序助您深入探究細胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡特征。成都空間轉錄組多組學測序
空間轉錄組測序以分子方式定義病理,,完成了病理數(shù)字化結合病理影像化的革新,。無錫上海烈冰生物空間轉錄組測序服務
空間轉錄組學(Spatial Transcriptomics)是指在組織切片上完成,保留樣本空間信息的組學研究,??臻g轉錄組可展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達情況,揭示精細病理區(qū)域中激發(fā)的信號通路,,完成分子特征驅動病理特征的機制解析,。空間轉錄組學完成了病理數(shù)字化結合病理影像化的技術革新,,對于診斷標志物,、耐藥位點以及靶向藥物的研發(fā),免疫治等新興領域都具有重要作用,。當組織冷凍切片附在帶有spatialbarcode的空間轉錄組芯片上時,,通過透化處理,細胞內(nèi)的mRNA釋放出來,,從而被芯片上帶有oligo-dT的探針捕獲,。被捕獲的mRNA開始逆轉錄,得到的cDNA中包含了spatialbarcode序列,。通過上機測序,,可以將每個mRNA轉錄的序列映射回組織切片中的映射回組織切片中的原始位置。無錫上海烈冰生物空間轉錄組測序服務
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家有著雄厚實力背景,、信譽可靠,、勵精圖治、展望未來,、有夢想有目標,,有組織有體系的公司,堅持于帶領員工在未來的道路上大放光明,,攜手共畫藍圖,,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康行業(yè)中積累了大批忠誠的客戶粉絲源,也收獲了良好的用戶口碑,,為公司的發(fā)展奠定的良好的行業(yè)基礎,,也希望未來公司能成為*****,努力為行業(yè)領域的發(fā)展奉獻出自己的一份力量,,我們相信精益求精的工作態(tài)度和不斷的完善創(chuàng)新理念以及自強不息,,斗志昂揚的的企業(yè)精神將**上海烈冰生物醫(yī)藥科技供應和您一起攜手步入輝煌,,共創(chuàng)佳績,一直以來,,公司貫徹執(zhí)行科學管理,、創(chuàng)新發(fā)展、誠實守信的方針,,員工精誠努力,,協(xié)同奮取,以品質(zhì),、服務來贏得市場,,我們一直在路上!