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寧波上海烈冰生物單細胞多組學(xué)測序服務(wù)公司

來源: 發(fā)布時間:2022-08-27

BD的技術(shù)不再采用利用微流控孔道射出細胞和射出的磁珠碰撞的過程,,進行單細胞捕獲的技術(shù),轉(zhuǎn)而采用CytoSeq特有的蜂窩板技術(shù),。該技術(shù)用20萬+的微孔(該數(shù)量級遠大于Input細胞數(shù)量),,保證單孔中的單細胞捕獲。同時避免了10X中存在的概率碰撞影響捕獲效率的問題,,采用微孔捕獲相對會有更好的捕獲效率(來自兩家企業(yè)商業(yè)宣傳資料比對),,保證Input細胞的高效使用。對于Input細胞的量更少的情況,,可以基于百萬級別的細胞總量開始進行前期處理以及后期捕獲操作,。而在細胞捕獲完成后,進行細胞裂解后,,同樣的也進行細胞中RNApolyA序列的抓取工作,。在單細胞水平上的多組學(xué)分析能夠為研究組提供前所未有的臨床和科研大數(shù)據(jù)。寧波上海烈冰生物單細胞多組學(xué)測序服務(wù)公司

基因測序是基因檢測的方法之一,,其又叫基因譜測序,,是國際上公認的一種基因檢測標(biāo)準(zhǔn)。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定,,被稱為下一代測序技術(shù)(nextgenerationsequencing),足見其劃時代的改變,,同時高通量測序使得對一個物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,,所以又被稱為深度測序(deepsequencing)?;驕y序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實驗室研究逐漸演變到臨床應(yīng)用,,可以說,基因測序技術(shù)將是下一個改變世界的技術(shù),。烈冰生物單細胞多組學(xué)商業(yè)化服務(wù)首先 出現(xiàn)的單細胞多組學(xué)方法就是將轉(zhuǎn)錄組與其他組學(xué)技術(shù)結(jié)合,。

細胞是構(gòu)成生命的基礎(chǔ)單元,迅速發(fā)展的單細胞測序技術(shù)為在單細胞層面研究細胞功能及其背后的基因調(diào)控機制提供了重要的技術(shù)手段,,單細胞測序可用于檢測多種不同的組學(xué)種類,,包括轉(zhuǎn)錄組、染色質(zhì)開放組,、DNA甲基化組,、組蛋白修飾組等等,對不同組學(xué)技術(shù)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)進行整合分析有助于更地刻畫細胞內(nèi)的基因調(diào)控狀態(tài),、揭示調(diào)控機制,。然而,與傳統(tǒng)的bulk數(shù)據(jù)相比,,單細胞數(shù)據(jù)具有規(guī)模大,、噪聲高,、異構(gòu)性強等特點,如何通過開發(fā)新的計算方法實現(xiàn)對這些寶貴數(shù)據(jù)的有效利用已成為當(dāng)今生物信息學(xué)領(lǐng)域關(guān)注的重點與熱點,。

單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉(zhuǎn)錄組測序分析,,可精確地描述每一個細胞的狀態(tài),在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有不可忽視的應(yīng)用價值,。然而,,單細胞測序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息,對于揭示發(fā)育過程,、病理微環(huán)境都存在很大的局限性,。空間轉(zhuǎn)錄組測序以點陣形式記錄病理切片細胞的空間信息并進行測序,,可以精確指示點陣內(nèi)的全部基因表達情況,。空間轉(zhuǎn)錄組測序的加入,,無疑讓單細胞測序如虎添翼,,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。隨著單細胞多組學(xué)的不斷進步, 研究者將有機會在單細胞分辨率下進一步理解個體發(fā)育以及疾病發(fā)展機制,。

單細胞測序結(jié)果動輒上百G數(shù)據(jù)量,,龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺和分析能力有著很高的要求,首先針對下機數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié):單細胞測序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列,,不可避免的會出現(xiàn)低質(zhì)量的測序結(jié)果,,存在各種情況的序列污染。因此序列過濾及質(zhì)量評估就會變得極為重要,。序列質(zhì)量主要通過測序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來表征,,即堿基測序結(jié)果的錯誤率在1%/0.1%以下的比例。理想的測序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30,。保證數(shù)據(jù)獲得后第一步的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性,,為后續(xù)細胞類型鑒定準(zhǔn)確和功能分析打下堅實基礎(chǔ)。在單細胞轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域,,將轉(zhuǎn)錄組與蛋白質(zhì)結(jié)合的代表性例子只有單細 胞RNA測序方法,。高通量測序單細胞多組學(xué)技術(shù)支持

單細胞多組學(xué)對不同組學(xué)技術(shù)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)進行整合分析有助于更刻畫細胞內(nèi)的基因調(diào)控狀態(tài)、揭示調(diào)控機制,。寧波上海烈冰生物單細胞多組學(xué)測序服務(wù)公司

烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業(yè),,為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù),先后經(jīng)歷基因芯片時代,、基因測序、轉(zhuǎn)錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭,。2018年以來,,單細胞測序進入發(fā)展的快車道,,烈冰作為國內(nèi)首批引進單細胞實驗雙平臺的公司,依托自主研發(fā)的NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)分析平臺,,為用戶提供一站式全流程的單細胞測序服務(wù)和解決方案,。4年的單細胞技術(shù)的積累,烈冰已具備大鼠,、小鼠,、斑馬魚、猴,、裸鼴鼠,、水稻、擬南芥等10+物種,,皮膚,、腦、胰腺,、脂肪,、心臟、花序等50+組織類型,,100+細胞類型,,1000+靶標(biāo)基因,10000+樣本處理經(jīng)驗,。寧波上海烈冰生物單細胞多組學(xué)測序服務(wù)公司

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