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合肥烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機構(gòu)

來源: 發(fā)布時間:2022-09-19

空間轉(zhuǎn)錄組測序在病理學(xué)中,,通過添加基因表達維度,,得出形態(tài)學(xué)結(jié)論,通過觀察基因表達區(qū)域,,了解可能發(fā)生假陰性/假陽性的位置; 在免疫學(xué),,研究免疫細胞浸潤、不同區(qū)域的免疫細胞中的基因表達特征,;免疫群體擴散,、不同類型免疫細胞的空間位置解析,; 在神經(jīng)科學(xué),研究大腦皮層層狀組織解析,,揭示大腦皮層的結(jié)構(gòu)-功能關(guān)系,,正常vs.疾病大腦結(jié)構(gòu)特征分析與疾病相關(guān)的基因表達于特定的大腦皮層; 在發(fā)育生物學(xué),,通過解析每個發(fā)育階段不同解剖區(qū)域特有的基因表達特征,,解析組織中與形態(tài)形成相關(guān)基因;豐富基因表達的空間注釋信息,,創(chuàng)建組織發(fā)育的空間細胞圖譜,。烈冰生物全轉(zhuǎn)錄組測序通過雙文庫構(gòu)建,實現(xiàn)多種RNA的一網(wǎng)打盡,。合肥烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機構(gòu)

10xGenomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫構(gòu)建的每張載玻片上有四個捕獲區(qū)域,,每個捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm,包含5000個被條形碼標(biāo)記的點(barcodedspots),,每個點的直徑為55μm,,點和點之間中心的距離為100μm,,并且每個點都有一個barcode序列,。組織切片的細胞中會釋放出mRNA,遷移到每個spot的mRNA會被標(biāo)記上相應(yīng)的barcode序列,,然后進行文庫構(gòu)建并進行測序,。根據(jù)數(shù)據(jù)的條形碼信息對數(shù)據(jù)進行分析,以確定哪些數(shù)據(jù)來自哪個位置,,從而實現(xiàn)空間基因表達的可視化,。烈冰空間轉(zhuǎn)錄組平臺烈冰智造空間轉(zhuǎn)錄組細胞捕獲,媲美國際主流的單細胞平臺,。

已發(fā)表的關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq,。這些方法或是在細胞數(shù)量上限制較大,或是存在有效測序深度不足等問題,。10xGenomics公司提供的Visium空間基因表達解決方案是目前一個高通量空間轉(zhuǎn)錄組的商業(yè)化解決方案,。該解決方案可以輕松地將空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)應(yīng)用到組織切片和染色的標(biāo)準方法中,從而研究空間分辨率下整個轉(zhuǎn)錄組mRNA的表達情況,,同時在同一組織切片中獲得組織學(xué)相關(guān)信息,。

細胞在組織樣本中的相對空間位置關(guān)系對于了解疾病病理學(xué)非常重要。但是scRNA-Seq在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結(jié)構(gòu),,無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息,。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個問題,通過記錄組織切片細胞的空間信息,,捕獲組織切片中的組織學(xué)信息,;通過免疫熒光進行蛋白組檢測,,將基因表達譜映射回組織樣本中的原始位置,同時獲得細胞/基因的空間表達特異性,。該技術(shù)可以為神經(jīng)科學(xué),,發(fā)育生物學(xué),免疫生理學(xué)等領(lǐng)域的研究提供組織和基因表達情況的新視角,。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務(wù),。

空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)(Spatial Transcriptomics)是指在組織切片上完成,保留樣本空間信息的組學(xué)研究,??臻g轉(zhuǎn)錄組可展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達情況,揭示精細病理區(qū)域中激發(fā)的信號通路,,完成分子特征驅(qū)動病理特征的機制解析,。空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)完成了病理數(shù)字化結(jié)合病理影像化的技術(shù)革新,,對于診斷標(biāo)志物,、耐藥位點以及靶向藥物的研發(fā),免疫治等新興領(lǐng)域都具有重要作用,。當(dāng)組織冷凍切片附在帶有spatialbarcode的空間轉(zhuǎn)錄組芯片上時,,通過透化處理,細胞內(nèi)的mRNA釋放出來,,從而被芯片上帶有oligo-dT的探針捕獲,。被捕獲的mRNA開始逆轉(zhuǎn)錄,得到的cDNA中包含了spatialbarcode序列,。通過上機測序,,可以將每個mRNA轉(zhuǎn)錄的序列映射回組織切片中的映射回組織切片中的原始位置。烈冰測序服務(wù)已助力300余篇國際主流期刊研究文章發(fā)表,。上海上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)公司

空間轉(zhuǎn)錄組測序因其強大的探究疾病--細胞--基因的關(guān)系,,一度成為高通量測序技術(shù)的“天花板”。合肥烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機構(gòu)

自2015年以來,,健康科技成為醫(yī)藥健康有限責(zé)任公司(自然)增長的領(lǐng)域,。事實上,根據(jù)硅谷銀行的分析,,有風(fēng)投支持的健康科技行業(yè)募資次數(shù)在這段時間增長了25%,,硅谷銀行與其中大約40%的歐美公司進行了合作。在《2019年本》鼓勵類條目中增加了“單細胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學(xué)測序的開發(fā)和生產(chǎn)”,。在中藥產(chǎn)業(yè)領(lǐng)域,,增加了“中藥飲片炮制技術(shù)傳承與創(chuàng)新,,中藥經(jīng)典名方的開發(fā)與生產(chǎn),中藥創(chuàng)新的研發(fā)與生產(chǎn)”等內(nèi)容,??傮w而言,健康科技行業(yè)前景光明,。在過去五年里,,這一行業(yè)的穩(wěn)健增長已經(jīng)給未上市有限責(zé)任公司(自然)公司帶來逾270億美元的收入,14家公司的估值超過10億美元,。另外,,2019年退出總價值已經(jīng)超過2018年,達到創(chuàng)紀錄的80億美元,,這在很大程度上是因為強勁IPO的推動,。新增內(nèi)容體現(xiàn)了我國醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)技術(shù)升級的方向,有助于引導(dǎo)企業(yè)緊跟國際前沿技術(shù),,加快開發(fā)具有國際競爭力的新產(chǎn)品,,提高產(chǎn)業(yè)化水平。既是單細胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學(xué)測序當(dāng)前發(fā)展的重要方向,,也是我國重視中醫(yī)藥傳承與創(chuàng)新發(fā)展的重要體現(xiàn),。合肥烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機構(gòu)

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