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技術(shù)優(yōu)勢(shì):
1. 業(yè)內(nèi)**的mtDNA&cpDNA富集抽提服務(wù):自主研發(fā)的細(xì)胞器基因組富集提取技術(shù),,高效實(shí)現(xiàn)高質(zhì)量細(xì)胞器基因組富集。
2. 一對(duì)一的生物信息分析,,人工基因注釋矯正:告別在線注釋平臺(tái)的偏差,,滿足NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)上傳要求,高質(zhì)量結(jié)果交付,,助力高水平研究,。
3. **技術(shù)團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人均9年以上從業(yè)經(jīng)驗(yàn),,項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)豐富,提供可以個(gè)性化方案定制,。
4. 已完成葉綠體&線粒體基因組項(xiàng)目數(shù)百例,,96%以上樣本實(shí)現(xiàn)完成圖水平交付。
5. 配套數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建服務(wù),,提升科研水準(zhǔn),,助力高水平研究發(fā)表。 小基因組測(cè)序樣本怎么制備呢,?山東小基因組完成圖小基因組測(cè)序多少錢(qián)
標(biāo)準(zhǔn)分析:1.測(cè)序數(shù)據(jù)概況
(1) 原始測(cè)序數(shù)據(jù)說(shuō)明
(2) 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)控及統(tǒng)計(jì)
(3) 三代測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
2.基因組組裝
3. 基因組組分分析
(1) 編碼基因分析
(2) ORFs掃描及跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
(3) 非編碼RNA分析
4. 基因功能注釋
基因組圈圖
高級(jí)分析:
比較基因組分析
1.SNP檢測(cè)與注釋
2.Indel檢測(cè)與注釋
3.SV檢測(cè)
4.基因組共線性分析
5.線粒體與葉綠體基因組片段交流分析
6.共有和特有基因分析
7.系統(tǒng)進(jìn)化分析,、選擇壓力分析
定制化生信分析
1.密碼子偏好性分析
2.長(zhǎng)重復(fù)序列Long repeat分析
3.簡(jiǎn)單重復(fù)序列SSR分析
4.基因表達(dá)量及表達(dá)差異分析(可由客戶提供RNAseq) 四川線粒體小基因組測(cè)序要多少錢(qián)小基因組測(cè)序的好處有很多。
基因組組裝:首先,,利用ABySS v2.0.2初步組裝Illumina測(cè)序數(shù)據(jù),,然后利用blasR比對(duì)Pacbio三代數(shù)據(jù),根據(jù)比對(duì)結(jié)果對(duì)單分子測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行一次矯正與糾錯(cuò),,目的在于減少單分子長(zhǎng)序列中單堿基,、插入缺失的錯(cuò)誤;***利用糾正過(guò)的單分子測(cè)序數(shù)據(jù)與二代數(shù)據(jù)進(jìn)行混合組裝,,使用的軟件是SPAdes-3.10.1,;挑選覆蓋深度足夠高且組裝長(zhǎng)度較長(zhǎng)的序列作為候選序列,比對(duì)NT庫(kù)確認(rèn),;***再次利用Illumina數(shù)據(jù)進(jìn)行校驗(yàn),,得到**終的組裝結(jié)果?;蚪M組分分析:通過(guò)多種方法對(duì)編碼基因,、非編碼RNA等進(jìn)行預(yù)測(cè),獲取測(cè)序樣本基因組的組成情況,。
虎耳草科植物cpDNA的重復(fù)序列和熱點(diǎn)區(qū)域:O. rupifraga-BJCP cpDNA***鑒定出58個(gè)gSSRs,。其中,44個(gè)位于LSC區(qū)域,,而8個(gè)和6個(gè)分別位于IR和SSC區(qū)域,。 在這些SSR中,43個(gè)mo**1個(gè)di-,,4個(gè)tetra-,。在O. rupifraga和M. rossii的葉綠體基因組中,分別檢測(cè)到15和17個(gè)正向重復(fù)序列序列(>30bp),,3個(gè)葉綠體基因組中都檢測(cè)到17個(gè)回文重復(fù)序列,。在cpDNA中同事檢測(cè)到60bp、61bp,、62bp和79bp長(zhǎng)重復(fù)序列,。熱點(diǎn)區(qū)域?qū)殡S后的Oresitrophe和Mukdenia的系統(tǒng)地理學(xué)和分化歷史研究提供重要的遺傳信息,。 小基因組測(cè)序的好處您了解嗎?
非編碼RNA分析:非編碼RNA(ncRNA)執(zhí)行多種生物學(xué)功能的RNA分子,,其本身并不攜帶翻譯為蛋白質(zhì)的信息,,直接在RNA水平對(duì)生命活動(dòng)發(fā)揮作用。相比于“垃圾RNA”的舊觀念,,人們開(kāi)始認(rèn)識(shí)到生物體內(nèi)富含的這類RNA的無(wú)窮潛力,。研究非編碼RNA不僅為了解生物體的基因表達(dá)調(diào)控系統(tǒng)和生長(zhǎng)提供了重要信息。對(duì)于葉綠體而言,,非編碼RNA的主要類型包括rrn5,rrn4.5,,rrn16,,rrn23;植物線粒體的非編碼RNA類型包括rrn5,,rrn18,,rrn26;***和動(dòng)物線粒體的非編碼RNA類型包括rrnS,,rrnL,。云生物自主研發(fā)的Enrichment富集技術(shù),可降低核DNA污染,,將總DNA中靶細(xì)胞器基因組比例提升,。青海線粒體小基因組測(cè)序多少錢(qián)
云生物提供小基因組測(cè)序的質(zhì)檢報(bào)告嗎?山東小基因組完成圖小基因組測(cè)序多少錢(qián)
葉綠體基因組 | “**”遺傳資源開(kāi)發(fā)新模式:葉綠體基因組結(jié)構(gòu)和特征:三個(gè)樣品的完整葉綠體基因組基本信息,,包含由LSC(87,496-87,604bp)和SSC(18,222-18,342bp)區(qū)域分開(kāi)的兩個(gè)IR拷貝(25,507-25,519bp),。編碼相同的131個(gè)基因組,其中113個(gè)是獨(dú)特的,,18個(gè)在IR區(qū)域中重復(fù),。113個(gè)獨(dú)特的基因包含79個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因,30個(gè)tRNA基因和4個(gè)rRNA基因,。14個(gè)含有一個(gè)內(nèi)含子(6個(gè)tRNA基因和8個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因),,3個(gè)含有兩個(gè)內(nèi)含子(rps12,clpP,ycf3)。 rps12基因的5'-末端外顯子位于LSC區(qū)域,,基因的內(nèi)含子和3'-末端外顯子位于IR區(qū)域,。山東小基因組完成圖小基因組測(cè)序多少錢(qián)