聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):反應(yīng)的控制:PCR反應(yīng)的緩沖液 提供合適的酸堿度與某些離子;鎂離子濃度 總量應(yīng)比dNTPs的濃度高,常用1.5mmol/L,;底物濃度 dNTP以等摩爾濃度配制,20~200umol/L,;TaqDNA聚合酶 2.5U(100ul);引物濃度一般為0.1 ~ 0.5umol/L,;反應(yīng)溫度和循環(huán)次數(shù),;變性溫度和時間 95℃,,30s;退火溫度和時間 低于引物Tm值5 ℃左右,,一般在45~55℃,;延伸溫度和時間 72℃,1min/kb(10kb內(nèi)),;Tm值=4(G+C) +2(A+T),;循環(huán)次數(shù) :一般為25 ~ 30次。循環(huán)數(shù)決定PCR擴(kuò)增的產(chǎn)量,。模板初始濃度低,,可增加循環(huán)數(shù)以便達(dá)到有效的 擴(kuò)增量。但循環(huán)數(shù)并不是可以無限增加的,。一般循環(huán)數(shù)為30個左右,,循環(huán)數(shù)超過30個以后,DNA聚合酶活性逐漸達(dá)到飽和,,產(chǎn)物的量不再隨循環(huán)數(shù)的增加而增加,出現(xiàn)了所謂的“平臺期”,。熱啟動聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)可以通過將反應(yīng)組分加熱到變性溫度在加入聚合酶之前,。常州細(xì)胞熒光定量PCR供應(yīng)商
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):模板的制備,PCR的模板可以是DNA,,也可以是RNA,。模板的取材主要依據(jù)PCR的擴(kuò)增對象,可以是病原體標(biāo)本如病毒,、細(xì)菌,、菌類等。也可以是病理生理標(biāo)本如細(xì)胞,、血液,、羊水細(xì)胞等。法醫(yī)學(xué)標(biāo)本有血斑,、精斑,、毛發(fā)等。標(biāo)本處理的基本要求是除去雜質(zhì),,并部分純化標(biāo)本中的核酸,。多數(shù)樣品需要經(jīng)過SDS和蛋白酶K處理。難以破碎的細(xì)菌,,可用溶菌酶加EDTA處理,。所得到的粗制DNA,經(jīng)酚,、氯仿抽提純化,,再用乙醇沉淀后用作PCR反應(yīng)模板,。無錫組織熒光PCR技術(shù)服務(wù)聚合酶鏈反應(yīng)是一種非常強(qiáng)大和實用的研究工具。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):1976年,,中國科學(xué)家,,發(fā)現(xiàn)了穩(wěn)定的Taq DNA聚合酶,為PCR技術(shù)發(fā)展也做出了基礎(chǔ)性貢獻(xiàn),。PCR是利用DNA在體外攝氏95°高溫時變性會變成單鏈,,低溫(經(jīng)常是60°C左右)時引物與單鏈按堿基互補(bǔ)配對的原則結(jié)合,標(biāo)本核酸模板在提取過程中,,由于吸樣污染導(dǎo)致標(biāo)本間污染,;有些微生物標(biāo)本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴(kuò)散再調(diào)溫度至DNA聚合酶很適反應(yīng)溫度(72°C左右),DNA聚合酶沿著磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互補(bǔ)鏈,?;诰酆厦钢圃斓腜CR儀實際就是一個溫控設(shè)備,能在變性溫度,,復(fù)性溫度,,延伸溫度之間很好地進(jìn)行控制。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的特點:特異性強(qiáng),,PCR反應(yīng)的特異性決定因素為:引物與模板DNA特異正確的結(jié)合,;堿基配對原則;Taq DNA聚合酶合成反應(yīng)的忠實性,;靶基因的特異性與保守性,。其中引物與模板的正確結(jié)合是關(guān)鍵。引物與模板的結(jié)合及引物鏈的延伸是遵循堿基配對原則的,。聚合酶合成反應(yīng)的忠實性及TaqDNA聚合酶耐高溫性,,使反應(yīng)中模板與引物的結(jié)合(復(fù)性)可以在較高的溫度下進(jìn)行,結(jié)合的特異性增加,,被擴(kuò)增的靶基因片段也就能保持很高的正確度,。再通過選擇特異性和保守性高的靶基因區(qū),其特異性程度就更高,。重疊延伸聚合酶鏈反應(yīng)可以將缺失,、插入或點突變引入DNA序列。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)準(zhǔn)備:PCR引物設(shè)計:PCR反應(yīng)中有兩條引物,,即5′端引物和3′引物,。設(shè)計引物時以一條DNA單鏈為基準(zhǔn)(常以信息鏈為基準(zhǔn)),5′端引物與位于待擴(kuò)增片段5′端上的一小段DNA序列相同,;3′端引物與位于待擴(kuò)增片段3′端的一小段DNA序列互補(bǔ),。引物設(shè)計的基本原則:引物長度:15-30bp,常用為20bp左右,。引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,,G+C太少擴(kuò)增效果不佳,,G+C 過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC很好隨機(jī)分布,,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列參照,。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)中要確保反應(yīng)緩沖液融化完全并徹底混勻。武漢細(xì)胞熒光PCR方案
電子PCR被提出作為分子生物學(xué)的教育工具,。常州細(xì)胞熒光定量PCR供應(yīng)商
聚合酶鏈反應(yīng)的常見問題分析與解決方法:PCR產(chǎn)物量過少:退火溫度不合適,。以2度為梯度設(shè)計梯度PCR反應(yīng)優(yōu)化退火溫度。DNA模板量太少,。增加DNA模板量,。PCR循環(huán)數(shù)不足。增加反應(yīng)循環(huán)數(shù),。引物量不足,。增加體系中引物含量。延伸時間太短,。以1 kb/min的原則設(shè)置延伸時間,。變性時間過長。變性時間過長會導(dǎo)致DNA聚合酶失活,。DNA模板中存在抑制劑,。確保DNA模板干凈。擴(kuò)增產(chǎn)物在凝膠中涂布或成片狀條帶彌散:酶量過高,。減少酶量;酶的質(zhì)量差,,調(diào)換另一來源的酶,。dNTP濃度過高。減少dNTP的濃度,。常州細(xì)胞熒光定量PCR供應(yīng)商