二代測序的優(yōu)勢和劣勢分別有哪些？

優(yōu)勢：能夠同時得到大量的序列數(shù)據(jù),，相比于一代測序技術(shù)，通量提高了成千上萬倍;單條序列成本非常低廉,。

劣勢：序列讀長較短，Illumina平臺為250-300bp,，454平臺也只有500bp左右;由于建庫中利用了PCR富集序列,，因此有一些含量較少的序列可能無法被大量擴(kuò)增，造成一些信息的丟失,，且PCR過程中有一定概率會引入錯配堿基,。想要得到準(zhǔn)確和長度較長的拼接結(jié)果，需要測序的覆蓋率較高導(dǎo)致結(jié)果錯誤較多和成本增加,。 二代測序的成本比一代測序高嗎,？河南哪里有二代測序價格

宏基因組二代測序，你了解多少,？

宏基因組二代測序（mNGS）是一項(xiàng)覆蓋病原譜廣且高通量的檢測技術(shù),，已在臨床領(lǐng)域得到了廣泛的應(yīng)用。對于血液病患者,，病原mNGS通過對樣本快速高通量測序,，可以獲得更準(zhǔn)確、相對無偏倚的病原信息,，對病原診斷起到積極的作用,，尤其對傳統(tǒng)微生物學(xué)檢測未覆蓋到或檢測周期較長、陽性率較低的病原可提高檢出率,。對于臨床相關(guān)樣本應(yīng)首先完善傳統(tǒng)微生物學(xué)檢測,，病理、無菌標(biāo)本培養(yǎng)仍然是診斷的金標(biāo)準(zhǔn),，病原mNGS是對傳統(tǒng)微生物學(xué)檢測的有力補(bǔ)充和延展而非替代,。病原mNGS的報告解讀應(yīng)充分評估檢出微生物的致病性、流行病學(xué),、生物信息學(xué)信息,，同時在結(jié)合患者臨床特征的基礎(chǔ)上進(jìn)行綜合判斷。 什么是二代測序檢測二代測序讀長方面比一代測序短很多,。

二代測序的操作流程有哪些,？

1.DNA提取與質(zhì)檢

· 純凈、足量,、質(zhì)量好的樣本DNA是檢測成功的基礎(chǔ)（可以來源于血漿,、新鮮組織等）

2.DNA處理→文庫構(gòu)建

· 得到統(tǒng)一長度區(qū)間+有接頭的DNA片段

· 步驟：DNA打斷→末端修復(fù)→片段篩選→加A尾→接頭連接→PCR

3.靶向捕獲

· 特定區(qū)域基因的定向檢測

4.上機(jī)測序

· 根據(jù)通量情況選擇測序儀

· 上樣后機(jī)器完成

5.數(shù)據(jù)分析

· 初級分析：光強(qiáng)數(shù)據(jù)（不同熒光標(biāo)記堿基）→序列信息（AGCT）

· 二級分析 多儀器自帶

· 三級分析 vcf文件 可diy

什么樣本可以做二代測序？②

組織樣本

新鮮組織：如手術(shù)切除的**組織,、活檢組織等,。新鮮組織樣本中的細(xì)胞完整性較好，能夠提供高質(zhì)量的DNA和RNA,。在**研究中,，對新鮮**組織進(jìn)行全基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序等,，可以深入了解**的基因突變,、基因表達(dá)變化等情況,。例如，在研究結(jié)直腸*的發(fā)病機(jī)制時,，對手術(shù)切除的結(jié)直腸*組織及其*旁組織進(jìn)行測序,，比較兩者之間的差異，以發(fā)現(xiàn)**相關(guān)的基因變異和表達(dá)調(diào)控異常,。

福爾馬林固定石蠟包埋（FFPE）組織：這是臨床上常用的保存組織樣本的方式,。FFPE組織中的DNA和RNA會有一定程度的損傷和降解，但經(jīng)過適當(dāng)?shù)奶崛『托迯?fù)處理后,，仍然可以用于二代測序,。在回顧性研究中，大量的FFPE組織存檔樣本可以被利用起來,。例如,，對多年前保存的乳腺*FFPE組織進(jìn)行測序，研究乳腺*的疾病進(jìn)展和***反應(yīng)相關(guān)的基因變化,。 宏基因組測序是二代測序嗎,？

二代測序——甲基化的作用和檢測方法有哪些？

作用

基因表達(dá)調(diào)控：DNA 甲基化通常與基因沉默有關(guān),。例如,，在**發(fā)生過程中，某些抑*基因的啟動子區(qū)域（調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄起始的 DNA 序列）可能會發(fā)生高甲基化,，導(dǎo)致這些基因無法正常表達(dá),，從而失去對腫瘤細(xì)胞生長的抑制作用。

發(fā)育調(diào)控：在胚胎發(fā)育過程中,，DNA 甲基化模式的動態(tài)變化對于細(xì)胞分化和組織***形成至關(guān)重要,。不同的細(xì)胞類型具有特定的 DNA 甲基化圖譜，這些圖譜引導(dǎo)細(xì)胞向特定的方向分化,。

檢測方法

亞硫酸鹽測序法：這是一種能夠精確檢測 DNA 甲基化狀態(tài)的方法,。其原理是利用亞硫酸鹽處理 DNA，未甲基化的胞嘧啶會被轉(zhuǎn)化為尿嘧啶,，而甲基化的胞嘧啶則保持不變,。經(jīng)過 PCR 擴(kuò)增和測序后，可以區(qū)分甲基化和未甲基化的位點(diǎn),。 什么是二代測序技術(shù),？靜安區(qū)嘉安健達(dá)二代測序提供

二代測序是2005年以后開始的嗎？河南哪里有二代測序價格

什么樣本可以做二代測序,？④

4,、口腔樣本

口腔拭子：通過刮取口腔黏膜細(xì)胞來獲取樣本。口腔拭子采集方便,、無創(chuàng),，可用于DNA提取和基因檢測。例如,，在法醫(yī)鑒定中,，口腔拭子是常用的樣本來源，用于個體身份識別和親子關(guān)系鑒定等,；在一些大規(guī)模的人群基因篩查項(xiàng)目中，也可以使用口腔拭子來收集樣本,。

5,、糞便樣本

糞便中含有腸道微生物、腸道上皮細(xì)胞等成分,。對糞便樣本進(jìn)行宏基因組測序,，可以研究腸道微生物群落的組成、功能和多樣性,。例如,，在腸道疾病（如炎癥性腸病,、結(jié)直腸*等）的研究中,，分析糞便中微生物群落結(jié)構(gòu)的變化，以及微生物基因的表達(dá)情況,，有助于了解疾病的發(fā)病機(jī)制和尋找潛在的生物標(biāo)志物,。 河南哪里有二代測序價格