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陜西二代測序流程

來源: 發(fā)布時間:2024-12-25

對于二代測序的概念是什么,?

第二代測序(Next-generationsequencing,NGS)又稱為高通量測序(High-throughputsequencing),是基于PCR和基因芯片發(fā)展而來的DNA測序技術,。我們都知道一代測序為合成終止測序,而二代測序開創(chuàng)性的引入了可逆終止末端,,從而實現(xiàn)邊合成邊測序(SequencingbySynthesis),。二代測序在DNA復制過程中通過捕捉新添加的堿基所攜帶的特殊標記(一般為熒光分子標記)來確定DNA的序列,現(xiàn)有的技術平臺主要包括Roche的454FLX,、lllumina的Miseq/Hiseg等,。2005年,,羅氏推出了二代測序儀羅氏454,生命科學開始進入高通量測序時代,。2006年,,隨著Ilumina系列測序平臺的推出,極大降低了二代測序的價格,,推動了高通量測序在生命科學各個研究領域的普及,。 二代測序讀長方面比一代測序短很多。陜西二代測序流程

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二代測序——基因組測序該測幾個G,?

1,、人類全基因組測序

常規(guī)全基因組測序:一般建議測序深度為30X-50X,人類基因組大小約為3G,,因此數(shù)據(jù)量通常在90G-150G左右,。這樣的測序深度可以較為***地檢測到基因組中的各種變異,包括單核苷酸多態(tài)性(SNP),、插入缺失(Indel),、結構變異(SV)等,適用于大多數(shù)疾病研究,、群體遺傳學研究以及個體遺傳特征分析等,。

高深度全基因組測序:對于一些特殊的研究目的,如檢測低頻變異,、體細胞突變等,,可能需要更高的測序深度,達到100X甚至更高,。此時數(shù)據(jù)量會相應增加到300G及以上,,這種高深度測序能夠更靈敏地發(fā)現(xiàn)罕見的遺傳變異,但成本也會大幅提高,。 河南嘉安健達二代測序公司高通量測序是二代測序嗎,?

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什么樣本可以做二代測序?①

1,、血液樣本

全血:這是最常見的樣本類型之一,。血液中含有白細胞,其細胞核內(nèi)有完整的基因組DNA,。通過提取白細胞中的DNA,,可以進行全基因組測序、全外顯子組測序等,。例如,,在遺傳病的基因診斷中,抽取患者的全血,,提取DNA后,,對與疾病相關的基因或整個外顯子組進行測序,,以尋找致病突變。

血漿/血清:其中含有游離的DNA(cfDNA)和RNA(cfRNA),。在**患者中,腫瘤細胞會釋放其DNA片段進入血液循環(huán),,這些cfDNA被稱為循環(huán)**DNA(ctDNA),。通過對血漿中的ctDNA進行測序,可以實現(xiàn)**的早期篩查,、***過程中的動態(tài)監(jiān)測等,。例如,對于肺*患者,,檢測血漿中的ctDNA來追蹤**的基因突變情況,,為靶向***提供依據(jù)。

二代測序不同應用場景下的速度有多快,?

病原微生物檢測:一般來說,,二代測序用于檢測病原微生物時,能夠在幾個小時到一天左右出結果,。比如在快速檢測血液中的病原微生物時,,通常可以在幾個小時內(nèi)獲得檢測結果,,相比傳統(tǒng)的血液培養(yǎng)方法,,時間大幅縮短,傳統(tǒng)血液培養(yǎng)一般需要幾天到一周的時間 ,。

全基因組測序:如果是對人類全基因組進行測序,,以目前的技術水平,使用二代測序技術完成一個人的全基因組測序,,一般需要 1-2 天左右的時間,。而在十幾年前,人類全基因組測序計劃***完成時,,耗費了大量的時間和精力,,相比之下二代測序技術的速度提升***。

轉錄組測序:轉錄組測序的時間相對較短,,一般幾個小時內(nèi)可以完成對大量 RNA 分子的測序和初步數(shù)據(jù)分析,,進而快速了解基因在特定條件下的表達情況8. 二代測序是先打斷DNA,使其片段化,。

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二代測序—全外顯子測序的優(yōu)勢

針對性強:它主要聚焦于基因組中編碼蛋白質的區(qū)域,,這部分區(qū)域雖然只占整個基因組的 1 - 2% 左右,但包含了大部分與疾病相關的突變,。例如,,在研究孟德爾遺傳病時,,很多致病突變都位于外顯子區(qū)域,通過全外顯子測序可以更高效地找到這些突變,。

成本效益高:相比于全基因組測序,,全外顯子測序的成本相對較低。因為它不需要對整個基因組(包括大量的非編碼區(qū)域)進行測序,,在一定程度上減少了數(shù)據(jù)量和測序成本,,同時又能獲取大部分有重要功能意義的遺傳信息。 二代測序的優(yōu)勢是高準確性,。湖北哪里有二代測序檢測

二代測序常用于產(chǎn)前的檢測或診斷,。陜西二代測序流程

二代測序——轉錄組測序的應用領域

1、基礎生物學研究:可以用于研究生物的發(fā)育過程,。例如,,在胚胎發(fā)育過程中,通過轉錄組測序可以了解不同階段胚胎細胞中基因的表達變化,,揭示胚胎發(fā)育的分子機制,。還可以用于物種進化研究,比較不同物種間轉錄組的差異,,推斷基因表達的進化模式,。

2、醫(yī)學研究和臨床診斷:在疾病研究方面,,用于尋找疾病相關的生物標志物,。例如,在**研究中,,通過對比**組織和正常組織的轉錄組,,可以發(fā)現(xiàn)一些在**中特異性高表達或低表達的基因,這些基因有望成為**診斷,、預后判斷的標志物,。同時,也可以用于藥物研發(fā),,通過轉錄組測序了解藥物作用后細胞基因表達的變化,,評估藥物療效和毒性。

3,、農(nóng)業(yè)和植物學研究:在作物育種中,,可以研究不同品種作物在抗逆性(如抗旱、抗寒,、抗?。┑确矫娴幕虮磉_差異,為培育優(yōu)良品種提供理論依據(jù),。在植物生長發(fā)育研究中,,分析植物在不同生長環(huán)境和生長階段的轉錄組變化,,了解植物***等因素對植物生長的調(diào)控機制。 陜西二代測序流程

標簽: 二代測序