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上海常規(guī)靶向代謝組學(xué)領(lǐng)域

來源: 發(fā)布時間:2022-05-13

代謝組學(xué)技術(shù)介紹:代謝組學(xué)技術(shù)(Metabolomics) 是基因時代發(fā)展起來的系統(tǒng)生物學(xué)新技術(shù),,以生物體內(nèi)所有代謝產(chǎn)物為研究對象,,其主要目標(biāo)是定性定量研究代謝物與機體生理病理變化之間的關(guān)系。代謝物的變化與細(xì)胞所處內(nèi)外環(huán)境密切相關(guān),。與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,,代謝組學(xué)提供了一種更加直接的生理狀態(tài)檢測方式。就研究方法而言,,代謝組學(xué)主要包括靶向(Targeted)代謝組學(xué)和非靶向(Untargeted)代謝組學(xué)兩部分,。非靶向代謝組學(xué)是針對一定生理狀態(tài)下的全代謝組學(xué),一目了然地發(fā)現(xiàn)差異性代謝物,,其優(yōu)勢在于全方面性,。而靶向代謝組學(xué)則是針對具體代謝物,以標(biāo)準(zhǔn)品為參照,,進(jìn)行相對的定量分析,,具有更好的靈敏度和準(zhǔn)確度,。隨著分辨率和掃描速度的提升,高分辨質(zhì)譜儀已經(jīng)應(yīng)用到不同疾病的代謝組學(xué)中,??煞治鲅獫{、血清,、尿液,、唾液、以及細(xì)胞和組織提取液等多種樣本,。與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,, 代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性。上海常規(guī)靶向代謝組學(xué)領(lǐng)域

代謝組學(xué)的研究分為靶向和非靶向,。通俗說就是你有沒有目標(biāo)分子,。傳統(tǒng)代謝組學(xué)研究利用的是GC-MS,因為代謝物大多數(shù)都不是高沸點的,,而且GC-MS有龐大的數(shù)據(jù)庫檢索,。然后發(fā)展的LC-MS差不多,就是克服了一些高沸點物質(zhì)難以檢測的弊端,。NMR用于代謝組學(xué)不是很多,,一方面是NMR這個東西入行起點有點高,另一方面是樣品太復(fù)雜而且靈敏度不高,。但是NMR樣品處理簡單,,無損。不需要各種衍生化,。而且NMR對于物質(zhì)結(jié)構(gòu)的指認(rèn)要比MS更精確(比如異構(gòu)體)因此對定性非常有用,,成為非靶向代謝組學(xué)的重要方法。上海常規(guī)靶向代謝組學(xué)領(lǐng)域代謝組學(xué)是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分,。

代謝組學(xué)可以檢測的樣品種類有哪些?代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(分子量<1000),。其樣品主要是血漿或血清,尿液,,唾液,,以及細(xì)胞和組織的提取液。我們也和一些公司或單位(如茶葉公司,、制酒公司、酸奶公司,、醫(yī)院等)合作,做過植物,,微生物提取物,,腦脊液,,昆蟲血淋巴,,羊水,,卵泡液,膝蓋滑液,,眼淚,,胎盤,,糞便及腸道內(nèi)容物提取液等,。一般代謝組學(xué)能檢測出多少物質(zhì),?不同的質(zhì)譜平臺靈敏度及偏向性都不一樣,,而且不同平臺之間具有互補性,。一般來說GC/MS檢測血清樣品能準(zhǔn)確定性的物質(zhì)約200個左右,,檢測尿液樣品定性的物質(zhì)約200個左右,,其他樣品(如肝臟,,糞便,腸道內(nèi)容物)也在幾百這個數(shù)量級,。

如何獲得高質(zhì)量GC/MS代謝組學(xué)數(shù)據(jù),?實驗設(shè)計先不談,,在儀器分析階段,若想獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù),,有以下幾個方面需要注意,。1)前處理方法的一致性。不同實驗人員操作方式不盡相同,。因此,一個項目應(yīng)當(dāng)只由一個人負(fù)責(zé)前處理。推薦使用自動衍生設(shè)備,,以減少人為的誤差。2)檢測之前需確保儀器處于比較好工作狀態(tài),。儀器的控制軟件都有系統(tǒng)自檢功能,,可以快速便捷地核查質(zhì)譜儀器的狀態(tài),。但更重要的是氣相色譜狀態(tài),推薦使用一組混標(biāo)作為儀器質(zhì)控,。在每一個項目開始之前,,先進(jìn)行質(zhì)控樣檢測,確認(rèn)氣相色譜的分離度和質(zhì)譜的整體響應(yīng),。3)后期數(shù)據(jù)矯正,特別是對于大樣本項目,。我們可以在檢測序列中加入隨行質(zhì)控樣本(每個樣品取少量后混合),,在后期數(shù)據(jù)處理時,使用質(zhì)控樣本結(jié)合如LOESS之類的算法對整體數(shù)據(jù)進(jìn)行矯正,。代謝組學(xué)是效仿基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究思想。

代謝組學(xué)概念:代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(MW<1000),。 在食品安全領(lǐng)域,,利用代謝組學(xué)工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動植物體內(nèi)的相關(guān)生物標(biāo)志物也是一個熱點領(lǐng)域。其樣品主要是動植物的細(xì)胞和組織的提取液,。主要技術(shù)手段是核磁共振(NMR),,質(zhì)譜(MS),色譜(HPLC,,GC),,其中以NMR為主。通過檢測一系列樣品的NMR 譜圖,,再結(jié)合模式識別方法,,可以判斷出生物體的病理生理狀態(tài),,并有可能找出與之相關(guān)的生物標(biāo)志物(biomarker),。代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于藥物毒理學(xué)。哈爾濱個性化定制靶向代謝組學(xué)鑒定

代謝組學(xué)著重研究的是生物整體,、組織代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時間變化的規(guī)律,。上海常規(guī)靶向代謝組學(xué)領(lǐng)域

代謝組學(xué)概念:代謝組學(xué)(metabonomics/metabolomics)是效仿基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究思想,,對生物體內(nèi)所有代謝物進(jìn)行定量分析,,并尋找代謝物與生理病理變化的相對關(guān)系的研究方式,,是系統(tǒng)生物學(xué)的組成部分,。其研究對象大都是相對分子質(zhì)量1000以內(nèi)的小分子物質(zhì),。先進(jìn)分析檢測技術(shù)結(jié)合模式識別和專家系統(tǒng)等計算分析方法是代謝組學(xué)研究的基本方法,。代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)之后新近發(fā)展起來的一門學(xué)科,,是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分,。上海常規(guī)靶向代謝組學(xué)領(lǐng)域