針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序的細(xì)胞上樣數(shù),,為什么不建議捕獲到的細(xì)胞數(shù)量越高越好,?一味地追求高數(shù)量的細(xì)胞捕獲可能會(huì)存在一些問題。例如在上機(jī)細(xì)胞懸液濃度固定時(shí),,如果目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)增加到8000甚至10000,上樣細(xì)胞懸液體積勢(shì)必增加,,在細(xì)胞懸液質(zhì)量不是很理想(細(xì)胞活性<90%,、碎片率>5%、結(jié)團(tuán)率均>5%)的情況下,,引入的背景信號(hào)會(huì)增加,,分析結(jié)果不理想的直接體現(xiàn)包括:cell、non-cell無法有效區(qū)分和Fraction reads in cells偏低,。當(dāng)cell和non-cell無法有效區(qū)分時(shí),,會(huì)使得數(shù)據(jù)出現(xiàn)假陽性和假陰性結(jié)果!當(dāng)目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)很大時(shí),,多細(xì)胞率會(huì)增加,,數(shù)據(jù)分析時(shí),此部分“cell”表現(xiàn)為基因檢測(cè)數(shù)和UMI檢測(cè)數(shù)是正常cell的N倍(N是一個(gè)GEM包裹的細(xì)胞數(shù)),,導(dǎo)致所有細(xì)胞的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)(單個(gè)細(xì)胞基因檢測(cè)中位數(shù),、單個(gè)細(xì)胞UMI檢測(cè)中位數(shù))虛高。此部分“cell”雖然可以通過設(shè)置數(shù)據(jù)分析閾值進(jìn)行過濾,,但是容易會(huì)有此類數(shù)據(jù)的殘留和正常高基因檢測(cè)細(xì)胞的人為去除,!測(cè)序可準(zhǔn)確地分析基因表達(dá)差異、基因結(jié)構(gòu)變異,、篩選分子標(biāo)記(SNPs或SSR)等生命科學(xué)重要問題,。濟(jì)南單細(xì)胞測(cè)序
烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),,深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,;從操作便捷,、結(jié)果可視化、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,,加速科研進(jìn)程!此外,,烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器(Single Cell Browser),,不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,還是可以實(shí)現(xiàn)三維立體化展示的軟件,。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,,專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您,詳情請(qǐng)咨詢烈冰生物,。吉林10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析可視化單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)提供了單個(gè)細(xì)胞水平下的科學(xué)研究視角,。
單細(xì)胞多組學(xué)帶來的突破 單細(xì)胞測(cè)序方法不但改進(jìn)了實(shí)驗(yàn)過程,還幫助科學(xué)家在健康和疾病研究的關(guān)鍵領(lǐng)域取得新進(jìn)展,。那些過去從轉(zhuǎn)錄平均值或單項(xiàng)參數(shù)讀取中無法獲得的新發(fā)現(xiàn)正在改變我們對(duì)傳染病,、神經(jīng)退行性疾病等疾病的認(rèn)識(shí)。從鑒定新的細(xì)胞類型和狀態(tài),,到揭開疾病用藥應(yīng)答和耐藥的潛在機(jī)制,,單細(xì)胞測(cè)序正在推動(dòng)突破性的研究,有望改變生物學(xué)和醫(yī)療,。無論是無法解釋的疾病,,還是人體或自然界中尚未探索的系統(tǒng),曾經(jīng)模糊的東西正變得越來越清晰,。隨著我們邁向科學(xué)的未來,,我們手頭的工具就像伽利略的望遠(yuǎn)鏡一樣能夠提高焦距和放大倍數(shù),而定義科學(xué)未來的知識(shí)新深度是十年前的人們所無法想象的,。
多樣本數(shù)據(jù)合并:Fraction of Reads Kept:合并樣本時(shí),,各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計(jì)算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,,需要進(jìn)行Downsample處理,,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測(cè)序深度標(biāo)化到同一水平,從而避免因測(cè)序深度差異導(dǎo)致的基因檢測(cè)數(shù)量,、基因表達(dá)水平的差異,。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,;從操作便捷,、結(jié)果可視化、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,,加速科研進(jìn)程!單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析,,認(rèn)準(zhǔn)烈冰NovelBrain生物信息數(shù)據(jù)分析平臺(tái),。
科研的魅力之處,在于無窮盡的探尋生命的本底,,通過單細(xì)胞測(cè)序,,我們對(duì)組織的分子基礎(chǔ)的研究也從初級(jí)到深層,并在單細(xì)胞層面逐漸達(dá)成一致,,那么不禁要問一句,,組織的空間位置到底重不重要?空間異質(zhì)性是功能的關(guān)鍵特征,,細(xì)胞的位置信息更能反應(yīng)細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控機(jī)制和細(xì)胞譜系發(fā)生過程,。因此時(shí)間和空間即像組織的AB面,而不可否認(rèn)的是,,此時(shí)空間坐標(biāo)的記錄,,像一個(gè)還未長大的娃娃,雖未觸及分子基礎(chǔ)研究的深層,,但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個(gè)高峰,。十二年測(cè)序經(jīng)驗(yàn),烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)領(lǐng)域的佼佼者,。濟(jì)南單細(xì)胞測(cè)序
烈冰引進(jìn)國際主流單細(xì)胞和空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序平臺(tái),保障細(xì)胞精度的前提下提供組織內(nèi)部精細(xì)區(qū)域的空間信息,。濟(jì)南單細(xì)胞測(cè)序
烈冰科技作為國內(nèi)率先同時(shí)擁有10X Genomics和BD Rhapsody雙分選平臺(tái)的測(cè)序服務(wù)商及云計(jì)算服務(wù)供應(yīng)商,,經(jīng)過多年實(shí)戰(zhàn),擁有豐富的單細(xì)胞懸液制備和分選經(jīng)驗(yàn),,實(shí)測(cè)BD Rhapsody對(duì)能夠高效捕獲粒細(xì)胞,。針對(duì)不同的分選平臺(tái)、建庫方法,,實(shí)戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預(yù)處理工作流程,;烈冰科技NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)平臺(tái)能有效支撐生命科學(xué)研究、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求,。高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)平臺(tái),,包括NovaSeq 6000、10X Chromium X、BD FACSMelody,、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等,,配合一支來自海內(nèi)外名校、多學(xué)科交叉型的高素質(zhì)綜合團(tuán)隊(duì),,為您的科學(xué)研究保駕護(hù)航,。濟(jì)南單細(xì)胞測(cè)序
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,是一家服務(wù)型公司,。公司業(yè)務(wù)分為單細(xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序等,,目前不斷進(jìn)行創(chuàng)新和服務(wù)改進(jìn),為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務(wù),。公司注重以質(zhì)量為中心,,以服務(wù)為理念,秉持誠信為本的理念,,打造醫(yī)藥健康良好品牌,。烈冰生物秉承“客戶為尊、服務(wù)為榮,、創(chuàng)意為先,、技術(shù)為實(shí)”的經(jīng)營理念,全力打造公司的重點(diǎn)競(jìng)爭力,。