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南京10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-06-18

單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)(Single Cell Sequencing)從一種新興的研究角度,,借助已有的高通量測(cè)序手段,,幫助研究者在樣本中細(xì)胞的異質(zhì)性,、免疫微環(huán)境、發(fā)育學(xué),、免疫學(xué)以及其他領(lǐng)域中進(jìn)行單細(xì)胞層面的數(shù)據(jù)解析,解決了Bulk Population Sequencing所無(wú)法解決的問(wèn)題,。這樣一個(gè)新的研究領(lǐng)域必然也需要足夠可靠的實(shí)驗(yàn)手段來(lái)支撐,。BD Rhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng)為此提供了完善的硬件設(shè)備,保證了從單細(xì)胞懸液質(zhì)量評(píng)估到單細(xì)胞分選標(biāo)記過(guò)程中每一個(gè)實(shí)驗(yàn)步驟的準(zhǔn)確質(zhì)控,。NovelBio單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)借助BD Rhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng),,在實(shí)驗(yàn)實(shí)施層面對(duì)單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果的可靠性提供了強(qiáng)有力的保證。繼單細(xì)胞懸液制備之后,,又在另一道關(guān)鍵關(guān)卡提供了可靠的支持,,幫助研究者在單細(xì)胞測(cè)序領(lǐng)域收獲更多的成果,。烈冰測(cè)序服務(wù)已助力300余篇國(guó)際期刊研究文章發(fā)表。南京10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序

現(xiàn)有的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)陣營(yíng)在幾個(gè)主要領(lǐng)域存在差別,。一個(gè)是分隔單個(gè)細(xì)胞以在其中進(jìn)行微反應(yīng)的物理平臺(tái),。在這個(gè)空間,單個(gè)細(xì)胞的內(nèi)容物釋放,,轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引,,以便下游識(shí)別。現(xiàn)有技術(shù)的另一個(gè)主要區(qū)別是如何添加索引,,就像生成測(cè)序文庫(kù)所涉及的流程步驟一樣,。10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)采用動(dòng)態(tài)微流控技(Drop-Seq具有類似的技術(shù)原理)。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,,其中一列縱向孔道輸入細(xì)胞,,凝膠微珠與細(xì)胞碰撞后會(huì)吸附在凝膠微珠上,并通過(guò)微流控技術(shù),,將之輸入到第二縱向孔道,,即油相孔道中。這時(shí)候,,就形成了一個(gè)個(gè)油滴并輸出并收集在EP管中,。每一個(gè)油滴中會(huì)落入一個(gè)細(xì)胞以及一個(gè)凝膠微珠,那么在每一個(gè)凝膠微珠中上長(zhǎng)滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,,再加上一端PolyT的抓手,,構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠。而這個(gè)凝膠微珠抓手就會(huì)使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫(kù),。上海高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)機(jī)構(gòu)十二年測(cè)序經(jīng)驗(yàn),,累計(jì)服務(wù)與5000余項(xiàng)重要科研項(xiàng)目。

單細(xì)胞獲得困難,,不同組織要求不盡相同難以搞定,? 烈冰2000+項(xiàng)目消化經(jīng)驗(yàn),100+組織類型解離protocol,,精心設(shè)計(jì)不同組織實(shí)驗(yàn)的解離,、細(xì)胞懸浮實(shí)驗(yàn)體系,確保單細(xì)胞的獲得,。 凍存樣本無(wú)法實(shí)驗(yàn),,珍貴樣本無(wú)法使用? 烈冰采用國(guó)際認(rèn)可的凍存組織復(fù)蘇技術(shù)以及死細(xì)胞過(guò)濾技術(shù),,確保凍存組織使用,。 珍貴樣本,細(xì)胞數(shù)量太少,,消化背景雜無(wú)法做單細(xì)胞,? 采用國(guó)際認(rèn)可的10X Genomics,,BD Rhapsody雙平臺(tái)模式,根據(jù)樣本實(shí)際情況和用戶需求提供客觀有效的實(shí)驗(yàn)方案,細(xì)胞量少,,背景雜也能做單細(xì)胞,。 單細(xì)胞RNA分類精度不足,部分細(xì)胞無(wú)法細(xì)分,? 烈冰同時(shí)采用單細(xì)胞蛋白質(zhì)組與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù),,真正做到從上游到下游的全流程檢測(cè),確保超高的細(xì)胞分類精度,。

高通量測(cè)序技術(shù)(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測(cè)序技術(shù)(“Next-generation” sequencing),,以能一次并行對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定和一般讀長(zhǎng)較短等為標(biāo)志。高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序一次顛覆性的改變,,一次對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定,,因此在有些文獻(xiàn)中稱其為下一代測(cè)序技術(shù)(next generation sequencing)足見(jiàn)其劃時(shí)代的改變,同時(shí)高通量測(cè)序使得對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的 分析成為可能,,所以又被稱為深度測(cè)序(deep sequencing),。而烈冰科技具有專業(yè)生物背景和十二年科研服務(wù)經(jīng)驗(yàn),已助力Nature,,immunity等在內(nèi)的300+篇CNS文章發(fā)表,。強(qiáng)勢(shì)發(fā)文,!烈冰單細(xì)胞測(cè)序助力揭示愈傷組織能再生的機(jī)制,。

Fluidigm C1平臺(tái)作為應(yīng)用于單細(xì)胞測(cè)序(Single Cell RNA Sequencing)領(lǐng)域的商業(yè)化分選技術(shù),基于富魯達(dá)(Fluidigm?)的微流控技術(shù),,大約在幾個(gè)小時(shí)中可以捕獲96個(gè)左右的細(xì)胞,,進(jìn)行各類的Single-Cell測(cè)序建庫(kù)。當(dāng)然,,通量還是比較小,。但不可否認(rèn)的是,現(xiàn)在很多非RNA類Single Cell測(cè)序,,仍然在采用這樣的技術(shù),,如Single Cell DNA-Seq,Single Cell ATAC-Seq等,,都是采用此技術(shù)進(jìn)行單細(xì)胞分選后再分別用不同試劑盒建庫(kù),。所以可以說(shuō),至少在10X和BD,,或者其他企業(yè)推出有效的Single DNA測(cè)序技術(shù)之前,,C1仍然會(huì)是市場(chǎng)上的重要組成部分。測(cè)序的革新讓科學(xué)研究從個(gè)體基因差異逐漸轉(zhuǎn)為個(gè)體細(xì)胞的基因差異,。北京10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析

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單細(xì)胞測(cè)序是指針對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,,可精確地描述每一個(gè)細(xì)胞的狀態(tài),在異質(zhì)性發(fā)育過(guò)程中具有特殊的應(yīng)用價(jià)值,。然而,,單細(xì)胞測(cè)序無(wú)法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息,對(duì)于揭示發(fā)育過(guò)程,、病理微環(huán)境都存在很大的局限性,。空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以點(diǎn)陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測(cè)序,,可以精確指示點(diǎn)陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況,。空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的加入,,無(wú)疑讓單細(xì)胞測(cè)序如虎添翼,,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。南京10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司屬于醫(yī)藥健康的高新企業(yè),,技術(shù)力量雄厚,。烈冰生物是一家有限責(zé)任公司(自然)企業(yè),一直“以人為本,,服務(wù)于社會(huì)”的經(jīng)營(yíng)理念;“誠(chéng)守信譽(yù),,持續(xù)發(fā)展”的質(zhì)量方針。公司擁有專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì),,具有單細(xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序等多項(xiàng)業(yè)務(wù),。烈冰生物自成立以來(lái),一直堅(jiān)持走正規(guī)化,、專業(yè)化路線,,得到了廣大客戶及社會(huì)各界的普遍認(rèn)可與大力支持。