據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),截至2022年6月,,烈冰生物助力發(fā)表單細(xì)胞文章近40篇,,從平臺(tái)應(yīng)用比例來看,應(yīng)用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺(tái)發(fā)文比例各占50%左右,,研究類型涵蓋疾病發(fā)展,,靶點(diǎn)探索,免疫研究,,神經(jīng)發(fā)育,,干細(xì)胞分化,植物發(fā)育,,退行病變,,糖尿病,COVID-19等等研究,;從發(fā)表期刊水平來看,,烈冰生物聯(lián)合發(fā)表的單細(xì)胞文章,CNS一區(qū)期刊占比在30%以上,,其中包括immunity三篇,,Nature子刊3篇(Nature cell biology,Nature Plants,Nature communication),風(fēng)濕類領(lǐng)域ARD期刊1篇,,CUT 1篇,,Advanced Science多篇,IF大于10分以上文章占比高達(dá)68.5%,,烈冰專屬單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)團(tuán)隊(duì),,將與您攜手譜寫下一篇“高分”新文章,。烈冰生物作為BD 中國(guó)聯(lián)合成立單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)室,為推動(dòng)單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)發(fā)展貢獻(xiàn)中國(guó)力量,。杭州BD Rhapsody單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)
烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞分析系統(tǒng),,可平行分析成千上萬個(gè)單細(xì)胞內(nèi)數(shù)千個(gè)基因的表達(dá)水平,單細(xì)胞RNA-seq正在改變我們對(duì)細(xì)胞的理解,。而烈冰作為多平臺(tái)的技術(shù)服務(wù)提供商,,基于BD 在生物學(xué)領(lǐng)域40年的專業(yè)技術(shù),滿足您的實(shí)驗(yàn)需求,,在單細(xì)胞水平理解細(xì)胞形態(tài)和功能,。BD單細(xì)胞測(cè)序分析系統(tǒng)克服了傳統(tǒng)檢測(cè)的局限性,如微陣列和大量細(xì)胞RNA-seq,,這些技術(shù)檢測(cè)通過實(shí)現(xiàn)對(duì)各個(gè)細(xì)胞之間的微妙差異的觀察,,依賴于對(duì)多個(gè)細(xì)胞的平行檢測(cè)。用戶可以鑒定和表征新型和罕見細(xì)胞類型,,其進(jìn)一步幫助理解從免疫學(xué)到疾病發(fā)展的多個(gè)領(lǐng)域內(nèi)的生物學(xué)過程,。青島single cell 單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)單細(xì)胞測(cè)序是高通量測(cè)序下的又一重大技術(shù)突破。
單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)再樣本細(xì)胞上機(jī)分選簽,,需要對(duì)細(xì)胞數(shù)量,、細(xì)胞活性進(jìn)準(zhǔn)判斷,這對(duì)Single Cell分選標(biāo)記,、建庫(kù),、下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細(xì)胞計(jì)數(shù)偏高,,將會(huì)影響建庫(kù)的成功率,;計(jì)數(shù)偏低,則會(huì)提高雙細(xì)胞的比例,;而細(xì)胞活率過低,就會(huì)使測(cè)序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣,,因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要,。而在鋪板過程中,由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,,不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果,。因此烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞分選平臺(tái)配套了專門定制的電動(dòng)移液器,其具有Prime Treat,、Cell Load,、Bead Load、Wash,、Lysis,、Retrieval多種操作模式,,來對(duì)應(yīng)各種不同的操作。通過已經(jīng)設(shè)定的程序來控制液體的流速,,大幅度降低人為操作習(xí)慣帶來的差異,,保證實(shí)驗(yàn)操作的一致性。
為什么需要單細(xì)胞分辨率,? 生物學(xué)就像宇宙一樣,。它非常復(fù)雜,有許多獨(dú)特的單體,,也就是細(xì)胞,。這些細(xì)胞相互作用并扮演不同的角色,在更大的體系中構(gòu)建并驅(qū)動(dòng)多個(gè)過程,。就像伽利略探索宇宙的努力一樣,,發(fā)現(xiàn)和定義這些細(xì)胞也需要高分辨率的工具,才能解開促成生物學(xué)復(fù)雜性的基因表達(dá)異質(zhì)性,。單細(xì)胞測(cè)序能夠在以一個(gè)細(xì)胞為功能單位中開展生物學(xué)研究,,闡明具體細(xì)節(jié),構(gòu)建出一幅更大,、更精細(xì)的圖譜,,說明導(dǎo)致產(chǎn)生某種外在表型的不同類型的分子和細(xì)胞之間是如何相互作用的:患者為什么會(huì)復(fù)發(fā)?是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問題,。烈冰實(shí)驗(yàn)室包含從樣本處理到測(cè)序下機(jī)的全套實(shí)驗(yàn)平臺(tái),。
從單細(xì)胞測(cè)序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類型的功能解析,越來越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角,。通過單細(xì)胞多組學(xué)——即對(duì)不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個(gè)單細(xì)胞來源中檢測(cè)多種細(xì)胞特征,。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)、細(xì)胞表面蛋白表達(dá),、免疫組庫(kù)序列(包括T細(xì)胞和B細(xì)胞受體)以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開放染色質(zhì)區(qū)域,。隨著單個(gè)實(shí)驗(yàn)可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),研究人員的獲益更多,,包括保留珍貴樣本,、提高生產(chǎn)力、減少因批次效應(yīng)引起的錯(cuò)誤,,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時(shí)間),。烈冰測(cè)序服務(wù)已助力300余篇國(guó)際期刊研究文章發(fā)表。長(zhǎng)春BD單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測(cè)序的龐大世界,。杭州BD Rhapsody單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)
針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié):主要是對(duì)細(xì)胞數(shù)量,、基因表達(dá)量、測(cè)序質(zhì)量進(jìn)行整體描述,。過濾標(biāo)準(zhǔn):由于細(xì)胞破碎后游離RNA會(huì)釋放到環(huán)境或孔中,,并且測(cè)序中也會(huì)存在一些死細(xì)胞,,導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值。因此,,我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來過濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞,。以10× Genomics為例,細(xì)胞數(shù)量判斷主要通過分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點(diǎn),,當(dāng)存在多個(gè)斜率拐點(diǎn)的時(shí)候,,結(jié)合預(yù)期UMI=500時(shí)的細(xì)胞數(shù)量進(jìn)行過濾。當(dāng)斜率拐點(diǎn)低于UMI=500的時(shí)候,,選擇UMI=500作為細(xì)胞的判斷的標(biāo)準(zhǔn),;否則,選擇和預(yù)期細(xì)胞數(shù)量接近的拐點(diǎn)作為細(xì)胞判斷的位置,。這樣我們能夠有效獲得真實(shí)的并且在基因數(shù)量上可以分析的數(shù)據(jù),。杭州BD Rhapsody單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技、醫(yī)藥科技,、信息科技,、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,市場(chǎng)營(yíng)銷策劃,,市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查,、社會(huì)調(diào)研、民意調(diào)查,、民意測(cè)驗(yàn)),,從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),計(jì)算機(jī),、軟件及耗材(除??兀浖_發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】的公司,,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實(shí)、誠(chéng)實(shí)可信的企業(yè),。烈冰生物深耕行業(yè)多年,始終以客戶的需求為向?qū)?,為客戶提?**的單細(xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,。烈冰生物繼續(xù)堅(jiān)定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路,,既要實(shí)現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長(zhǎng),又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域,,實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破,。烈冰生物始終關(guān)注自身,在風(fēng)云變化的時(shí)代,,對(duì)自身的建設(shè)毫不懈怠,,高度的專注與執(zhí)著使烈冰生物在行業(yè)的從容而自信。