二代測(cè)序技術(shù)在測(cè)序方法上取得了重大突破,,基于“邊合成邊測(cè)序”(sequencingbysynthesis)和大規(guī)模平行測(cè)序技術(shù)(massiveparallelanalysis,MPS),,使測(cè)序通量和讀取速度得到極大提升,例如IlluminaSolexa測(cè)序儀,。Illumina的測(cè)序原理可以簡(jiǎn)化為四步:樣品文庫(kù)構(gòu)建,、簇生成、測(cè)序和數(shù)據(jù)分析,。由于讀長(zhǎng)限制,,樣品DNA或由RNA逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段,并在3和5端接上3種序列:1)Index,,用于區(qū)分樣品來(lái)源;2)Adapter,,用于結(jié)合測(cè)序通道上的位點(diǎn),;3)Primerbindingsite,用于結(jié)合PCR引物啟動(dòng)擴(kuò)增反應(yīng)。
單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái),,烈冰提供高性價(jià)比服務(wù)方案,。上海高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析
單細(xì)胞測(cè)序是指針對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,可精確地描述每一個(gè)細(xì)胞的狀態(tài),,在異質(zhì)性發(fā)育過(guò)程中具有特殊的應(yīng)用價(jià)值,。然而,單細(xì)胞測(cè)序無(wú)法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息,,對(duì)于揭示發(fā)育過(guò)程,、病理微環(huán)境都存在很大的局限性??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以點(diǎn)陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測(cè)序,,可以精確指示點(diǎn)陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的加入,,無(wú)疑讓單細(xì)胞測(cè)序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性,。上海高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測(cè)序服務(wù),。
多樣本數(shù)據(jù)合并:FractionofReadsKept:合并樣本時(shí),各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計(jì)算出來(lái)的數(shù)據(jù)利用率,。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,,需要進(jìn)行Downsample處理,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測(cè)序深度標(biāo)化到同一水平,,從而避免因測(cè)序深度差異導(dǎo)致的基因檢測(cè)數(shù)量,、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),,深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷,、結(jié)果可視化,、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,,加速科研進(jìn)程,!
單細(xì)胞RNA-seq、RNA-seq和逆轉(zhuǎn)錄qPCR(RT-qPCR)都采用一個(gè)共同過(guò)程,,即分離RNA并將其轉(zhuǎn)化為cDNA進(jìn)行分析,。不過(guò),每種分析在開(kāi)展方式和獲得的數(shù)據(jù)上有所不同,。RNA-seq和RT-qPCR都是先從大量細(xì)胞中分離RNA,,然后將其轉(zhuǎn)化為cDNA,。RNA-seq是使用cDNA來(lái)構(gòu)建新一代測(cè)序文庫(kù),從而測(cè)定整個(gè)轉(zhuǎn)錄組的基因表達(dá),。RT-qPCR則是從cDNA中擴(kuò)增特定靶點(diǎn),,并通過(guò)熒光測(cè)定表達(dá)水平。RT-qPCR限于已知靶點(diǎn),,而RNA-seq可實(shí)現(xiàn)無(wú)偏倚的全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)分析,。然而,這兩者只能提供細(xì)胞群體內(nèi)基因表達(dá)的平均情況,。單細(xì)胞RNA-seq則在分離RNA之前將單細(xì)胞分離到微孔或單個(gè)微反應(yīng)容器中,。然后用細(xì)胞特異性的條形碼標(biāo)記RNA,確保來(lái)自每個(gè)細(xì)胞的cDNA可以追溯到起源細(xì)胞,。與RNA-seq相似,,帶有條形碼的cDNA也被用于構(gòu)建新一代測(cè)序文庫(kù),從而能夠?qū)γ總€(gè)細(xì)胞的整個(gè)轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行基因表達(dá)測(cè)定,。烈冰開(kāi)展了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組,、單細(xì)胞多組學(xué)以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案。
作為單細(xì)胞測(cè)序的一個(gè)重要里程碑,,10xgenomic公司于2016年2月推出10xChromiumSingleCellGeneExpressionSolution,,此平臺(tái)整合了儀器、試劑盒和信息學(xué)軟件,,能精確對(duì)接illumina測(cè)序儀,,因此可實(shí)現(xiàn)大量大細(xì)胞的快速高效標(biāo)記、測(cè)序和分析,,獲得單細(xì)胞水平的基因表達(dá)譜和差異情況,,并通過(guò)對(duì)復(fù)雜細(xì)胞群體進(jìn)行深入細(xì)致分析,繪制大規(guī)模單細(xì)胞表達(dá)圖譜,。以量化細(xì)胞內(nèi)的群體異質(zhì)性,,并逐個(gè)鑒定細(xì)胞類型、細(xì)胞狀態(tài)和動(dòng)態(tài)細(xì)胞躍遷,。除了有望鑒定新的細(xì)胞亞型和稀有細(xì)胞群體,,單細(xì)胞技術(shù)還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動(dòng)態(tài)和基因調(diào)控關(guān)系。強(qiáng)勢(shì)發(fā)文,!烈冰單細(xì)胞測(cè)序助力揭示愈傷組織能再生的機(jī)制,。長(zhǎng)沙高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)支持
烈冰測(cè)序服務(wù)已助力300余篇國(guó)際期刊研究文章發(fā)表。上海高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析
烈冰生物成立于2010年,,與時(shí)俱進(jìn),,堅(jiān)持為科研學(xué)者提供國(guó)際前沿的高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)和深度的生物信息數(shù)據(jù)分析服務(wù),已逐步發(fā)展為單細(xì)胞多組學(xué)檢測(cè)服務(wù)****,。專注于“單細(xì)胞測(cè)序系列技術(shù)服務(wù)”的專精領(lǐng)域,,在上海,、北京,、廣州,、西安和江西等地?fù)碛袛?shù)千平辦公場(chǎng)所,并布局多中心產(chǎn)品研發(fā)生產(chǎn)基地和營(yíng)銷,、運(yùn)營(yíng)中心,。2016年起連續(xù)被評(píng)為上海市****,60+項(xiàng)自主知識(shí)產(chǎn)權(quán),,轉(zhuǎn)化率近80%,。產(chǎn)品覆蓋從單細(xì)胞測(cè)序,核測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué),,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序等多組學(xué)聯(lián)合的實(shí)驗(yàn)+數(shù)據(jù)分析全流程服務(wù)平臺(tái)。為600+國(guó)內(nèi)高校和醫(yī)院,、5000+深度合作學(xué)者用戶,、10000+生命科學(xué)探索的重要科研項(xiàng)目在醫(yī)藥開(kāi)發(fā)、科學(xué)研究,、醫(yī)學(xué)及臨床研究,,疾病分子標(biāo)志物篩選、生命和神經(jīng)發(fā)育研究等提供多層次,、多組學(xué)檢測(cè)服務(wù)和解決方案,,助力300+CNS國(guó)際學(xué)術(shù)期刊文章發(fā)表,30+篇單細(xì)胞技術(shù)聯(lián)合(助力)發(fā)文,,IF10+文章占比>65%,。上海高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司主營(yíng)品牌有NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造,發(fā)展規(guī)模團(tuán)隊(duì)不斷壯大,,該公司服務(wù)型的公司,。是一家有限責(zé)任公司(自然)企業(yè),隨著市場(chǎng)的發(fā)展和生產(chǎn)的需求,,與多家企業(yè)合作研究,,在原有產(chǎn)品的基礎(chǔ)上經(jīng)過(guò)不斷改進(jìn),追求新型,,在強(qiáng)化內(nèi)部管理,,完善結(jié)構(gòu)調(diào)整的同時(shí),良好的質(zhì)量,、合理的價(jià)格,、完善的服務(wù),在業(yè)界受到寬泛好評(píng),。公司始終堅(jiān)持客戶需求優(yōu)先的原則,,致力于提供高質(zhì)量的單細(xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,。烈冰生物自成立以來(lái),一直堅(jiān)持走正規(guī)化,、專業(yè)化路線,,得到了廣大客戶及社會(huì)各界的普遍認(rèn)可與大力支持。