BDRhapsody單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),,突破傳統(tǒng)高通量測序的局限性,,針對(duì)多種組織類型的樣本,,采用BD細(xì)胞懸液制備protocol組織解離后,,單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-10000個(gè)細(xì)胞,,基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫測序,,獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),,并鑒定細(xì)胞的類型,,可以在不同樣本間從細(xì)胞類型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,,反映細(xì)胞間的異質(zhì)性,提供足夠靈活的定制測定法以滿足多種實(shí)驗(yàn)需要,,并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時(shí)間和降低測序成本,。烈冰生物全國五大實(shí)驗(yàn)中心,,多地部署B(yǎng)D Rahpsody平臺(tái),助您的樣本更快速抵達(dá)“戰(zhàn)場”,。無錫單細(xì)胞多組學(xué)測序
作為單細(xì)胞測序的又一個(gè)重要里程碑,,BDRhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái)整合了儀器、試劑盒和基礎(chǔ)信息學(xué)軟件,,能精確對(duì)接illumina測序儀,,因此可實(shí)現(xiàn)大量大細(xì)胞的快速高效標(biāo)記、測序和分析,,獲得單細(xì)胞水平的基因表達(dá)譜和差異情況,,并通過對(duì)復(fù)雜細(xì)胞群體進(jìn)行深入細(xì)致分析,繪制大規(guī)模單細(xì)胞表達(dá)圖譜,。以量化細(xì)胞內(nèi)的群體異質(zhì)性,,并逐個(gè)鑒定細(xì)胞類型、細(xì)胞狀態(tài)和動(dòng)態(tài)細(xì)胞躍遷,。除了有望鑒定新的細(xì)胞亞型和稀有細(xì)胞群體,,單細(xì)胞技術(shù)還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動(dòng)態(tài)和基因調(diào)控關(guān)系。廣州single cell 單細(xì)胞測序單細(xì)胞多組學(xué)測序可識(shí)別重要的轉(zhuǎn)錄因子,,進(jìn)行譜系和發(fā)育追蹤,。
烈冰科技作為國內(nèi)率先同時(shí)擁有10XGenomics和BDRhapsody雙分選平臺(tái)的測序服務(wù)商及云計(jì)算服務(wù)供應(yīng)商,經(jīng)過多年實(shí)戰(zhàn),,擁有豐富的單細(xì)胞懸液制備和分選經(jīng)驗(yàn),,實(shí)測BDRhapsody對(duì)能夠高效捕獲粒細(xì)胞。針對(duì)不同的分選平臺(tái),、建庫方法,,實(shí)戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預(yù)處理工作流程;烈冰科技NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)平臺(tái)能有效支撐生命科學(xué)研究,、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求,。高通量測序?qū)嶒?yàn)平臺(tái),包括NovaSeq6000,、10XChromiumX,、BDFACSMelody、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等,,配合一支來自海內(nèi)外名校,、多學(xué)科交叉型的高素質(zhì)綜合團(tuán)隊(duì),為您的科學(xué)研究保駕護(hù)航,。
單細(xì)胞測序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),,可實(shí)現(xiàn)零代碼操作、簡單方便:單細(xì)胞瀏覽器的操作簡單,,不需要命令行操作,。簡單拖拽,、設(shè)置參數(shù)即可運(yùn)行,即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運(yùn)用自如,;可視化展示海量結(jié)果文件:可視化展示Cluster的基因數(shù),,UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息,;以及不同Cluster對(duì)應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量,、基因表達(dá)量、RNA表達(dá)量,、樣本細(xì)胞分布,、線粒體RNA表達(dá)量等;3D立體展示,,文章動(dòng)圖先人一步:單細(xì)胞瀏覽器針對(duì)t-SNE圖,、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進(jìn)行三維立體展示,更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類情況,。ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測序的龐大世界。
烈冰與國內(nèi)高校,、研究所,、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作,服務(wù)于600+臨床與研究機(jī)構(gòu),,1000+客戶和5000+重要科研項(xiàng)目,,助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國際學(xué)術(shù)期刊(不完全統(tǒng)計(jì)),在單細(xì)胞領(lǐng)域,,烈冰助力用戶發(fā)表單細(xì)胞文獻(xiàn)30+篇,,總IF>300+,IF>10+以上文章占比65%以上,,包含Immunity,、NatureCellBiology、NaturePlants,、AdvancedScience等生物領(lǐng)域國際主流學(xué)術(shù)期刊,,已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機(jī)制,,免疫研究,、腦神經(jīng)、白血病,、胚胎發(fā)育,、糖尿病、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等,。全線搭建BD Rahpsody單細(xì)胞測序平臺(tái),。深圳BD VDJ單細(xì)胞多組學(xué)測序
BD單細(xì)胞測序平臺(tái)同時(shí)兼容單細(xì)胞蛋白組測序(Ab-seq)和免疫組庫測序等工作,。無錫單細(xì)胞多組學(xué)測序
根據(jù)烈冰多年單細(xì)胞測序服務(wù)經(jīng)驗(yàn),為什么不建議您一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲:單細(xì)胞測序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類進(jìn)行,,而細(xì)胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后,,獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜,通過降維(pca),,無監(jiān)督聚類以及可視化(t-SNE)得到的,。進(jìn)行細(xì)胞聚類時(shí)需要考慮到每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式,因此即使是相同的數(shù)據(jù),,在剔除幾個(gè)細(xì)胞的情況下,,前后獲得的聚類圖也會(huì)出現(xiàn)明顯不同。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過多時(shí),,無論是假陰性和假陽性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù),,都會(huì)對(duì)正常細(xì)胞聚類產(chǎn)生影響,造成聚類結(jié)果失真,。這也是很多文章,,特別是很多高分文章,為什么單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了,。烈冰建議單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在3000-5000個(gè)時(shí),,數(shù)據(jù)量在100G左右時(shí),可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求,。無錫單細(xì)胞多組學(xué)測序
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