LC-MS非靶向代謝組學(xué)研究方法,2021年11月,,寧波大學(xué)海洋科學(xué)學(xué)院王春琳團隊在Frontiers in Marine Science期刊發(fā)表了題為“Metabolic Changes in Scylla paramamosain During Adaptation to an Acute Decrease in Salinity”的研究成果,,通過LC-MS非靶向代謝組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了氨基酸和能量代謝是參與青蟹適應(yīng)鹽度變化的主要因素,,而脂質(zhì)代謝物起輔助作用,。中文標題:青蟹在適應(yīng)鹽度急劇下降過程中的代謝變化研究對象:青蟹發(fā)表期刊:FrontiersinMarineScience影響因子:4.912發(fā)表時間:2021年11月2日合作單位:寧波大學(xué)應(yīng)用海洋生物技術(shù)教育部重點實驗室運用生物技術(shù):LC-MS非靶向代謝組(由鹿明生物提供技術(shù)支持)代謝組學(xué)專業(yè)第三方檢測,出具報告快,數(shù)據(jù)準。上海代謝組學(xué) 數(shù)據(jù)處理
通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和代謝組學(xué)(GC-MS非靶向代謝組學(xué))對BPF暴露和對照組的細胞進行分析,,篩選到差異的基因和代謝物,。分別通過富集分析,找到差異基因或代謝物參與的條目或通路,。***通過差異轉(zhuǎn)錄本,、代謝物和促炎細胞因子的綜合分析,揭露了它們之間的關(guān)系,。本文通過多組學(xué)分析和體外模型的方式,,發(fā)現(xiàn)了BPF暴露后腸上皮細胞轉(zhuǎn)錄組和代謝組譜的改變,揭露了BPF可能在腸道炎癥發(fā)病機制的作用,。中文標題:轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)合代謝組學(xué)揭示了雙酚F(BPF)暴露對腸道炎癥的影響研究對象:人結(jié)腸粘膜上皮細胞系(NCM460)發(fā)表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影響因子:7.963發(fā)表時間:2021年11月合作單位:上海交通大學(xué)附屬新華醫(yī)院運用生物技術(shù):GC-MS非靶向代謝組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持),、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、qRT-PCR上海代謝組學(xué) 方法與應(yīng)用讀懂代謝組學(xué) 代謝組學(xué)的研究范疇,。
LC-MS和GC-MS兩大平臺是現(xiàn)今代謝組學(xué)研究**常用的兩大技術(shù)平臺,,各自有其特點和優(yōu)勢,在物質(zhì)檢測的范圍和種類上,,都有一定的偏向性,。往往一種方法、一個技術(shù)平臺很難獲取樣品當中***的代謝物信息,,為了解決這個問題,,LC-MS+GC-MS這種組合式雙平臺解決方案,可以**提升代謝組學(xué)檢測的覆蓋度,,獲取更加***的代謝物及其豐度信息,,鹿明生物運用此研究策略,已協(xié)助更多客戶更好的達成了科研目標,。鹿明生物,、歐易生物雙平臺代謝組學(xué)可***研究代謝物的信息,為您的科學(xué)研究助力,。
代謝組學(xué)數(shù)據(jù)提供了COVID-19患者各階段循環(huán)代謝物特征的綜合觀點,,并確定了葡萄糖代謝和尿素循環(huán)的代謝重編程是COVID-19的潛在病理機制,。在****病程的不同階段,靶向宿主代謝可能是一種可行的方法,。非靶向代謝組學(xué)分析中,,發(fā)現(xiàn)隊列中的樣品共鑒定出2466個代謝物峰,負離子模式631個,、正離子模式下的1835個,;通過篩選,,鑒定出240種代謝物,。輕癥組的代謝物與正常組部分重合,而重癥組和恢復(fù)組很容易區(qū)分(圖1B),。240個代謝物中有193個與COVID-19***相關(guān)(圖1C),。火山圖顯示了不同組代謝物與正常組相比上調(diào)下調(diào)的情況(圖1D),;與正常組對比,,***上調(diào)的代謝物:輕癥組有48個,嚴重組有59個,,恢復(fù)組有64個,;***下調(diào)的代謝物:輕癥組有33個,重癥組有29個,,恢復(fù)組有34個,。使用靶向代謝組學(xué)分析;首先根據(jù)發(fā)現(xiàn)隊列中59名受試者的血清代謝物(4個樣本因體積小而被排除),;定量到了199種代謝物,。根據(jù)不同組的濃度,將199個代謝物分為16個簇,;然后根據(jù)恢復(fù)組的代謝物是否恢復(fù)到正常水平將這些簇分為三組,。代謝組學(xué) 生物標志物挖掘**-歐易生物。
LC-MS非靶向代謝技術(shù)發(fā)現(xiàn)了糞便移植(FMT)對血液代謝的影響,。標題:藻酸鹽寡糖化小鼠的微生物群成功減輕了小腸粘膜炎期刊:MicrobiomeIF=14.650研究思路:*樣本類型:小鼠小腸,、腸道內(nèi)容物、血漿*檢測平臺:LC-MS非靶向代謝組,、轉(zhuǎn)錄組,、16S微生物多樣性檢測等本研究發(fā)現(xiàn)藻酸鹽寡糖(AOS)可以減輕***藥物白消安誘導(dǎo)的小腸細胞膜的損傷,特別是細胞連接和微絨毛,;并有利于腸道菌群變化進而改善小腸功能,,提高腸道的免疫功能。LC-MS非靶向代謝技術(shù)發(fā)現(xiàn)了糞便移植(FMT)對血液代謝的影響,,并分析了血液代謝物與腸道菌群之間的相關(guān)性,,發(fā)現(xiàn)不同劑量的糞便移植對血液代謝組均產(chǎn)生了***影響,,其中大部分是在小腸功能中起著重要作用的脂質(zhì)代謝物,表明FMT可以在血液中恢復(fù)被白消安擾亂的代謝物,。相關(guān)性分析表明,,“有益菌”乳酸桿菌有助于血液代謝產(chǎn)物的恢復(fù),“有害菌群”則不能協(xié)助血液代謝物的回收,,揭示了FMT可改善小腸功能和腸道菌群,,恢復(fù)血液代謝的原因。代謝組學(xué)多年質(zhì)譜組學(xué)系統(tǒng)研究經(jīng)驗,。上海糖代謝組學(xué)
對生物體內(nèi)所有代謝物進行定量分析-代謝組學(xué),。上海代謝組學(xué) 數(shù)據(jù)處理
GC-MS非靶向代謝組學(xué)yan'j2021年11月,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院馮麗萍教授課題組在Science of the Total Environment期刊發(fā)表了題為“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果,,通過GC-MS非靶向代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法,,發(fā)現(xiàn)了BPF暴露的腸道毒性的特征,探究了可能的發(fā)病機理,。
中文標題:轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)合代謝組學(xué)揭示了雙酚F(BPF)暴露對腸道炎癥的影響研究對象:人結(jié)腸粘膜上皮細胞系(NCM460)發(fā)表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影響因子:7.963發(fā)表時間:2021年11月合作單位:上海交通大學(xué)附屬新華醫(yī)院運用生物技術(shù):GC-MS非靶向代謝組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持),、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、qRT-PCR 上海代謝組學(xué) 數(shù)據(jù)處理
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