單細(xì)胞測(cè)序是指針對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,,可精確地描述每一個(gè)細(xì)胞的狀態(tài),在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有不可忽視的應(yīng)用價(jià)值,。然而,,單細(xì)胞測(cè)序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息,,對(duì)于揭示發(fā)育過程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性,??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以點(diǎn)陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測(cè)序,可以精確指示點(diǎn)陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況,??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的加入,無疑讓單細(xì)胞測(cè)序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性,??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序可識(shí)別重要的轉(zhuǎn)錄因子,進(jìn)行譜系和發(fā)育追蹤,。廣州烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
烈冰生物生信分析團(tuán)隊(duì)緊追國(guó)際前沿,、整合添加多項(xiàng)國(guó)際期刊認(rèn)可的空轉(zhuǎn)分析工具,構(gòu)建一套完整的數(shù)據(jù)分析流程,;精心研發(fā)空轉(zhuǎn)結(jié)果瀏覽器,,可同步展示空間轉(zhuǎn)錄組與單細(xì)胞測(cè)序分析結(jié)果,詳細(xì)深入地解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),。完成從Rawdata(原始數(shù)據(jù))到Spot-Gene的具有定位信息的表達(dá)矩陣的過程后,,就進(jìn)入了空轉(zhuǎn)的第二步,去進(jìn)行Spot的Cluster的過程,,熟悉單細(xì)胞測(cè)序的研究者知道,,Cluster在單細(xì)胞測(cè)序中往往表示為細(xì)胞的類型,也就是說能聚在一起采用算法分為一個(gè)群體細(xì)胞是一個(gè)Celltype(當(dāng)然分情況也會(huì)有不同),。而在空轉(zhuǎn)中,,也正是由于前面提到了細(xì)胞的非單一性,導(dǎo)致了這里的分群并不是單純的同一細(xì)胞類型,,而應(yīng)該認(rèn)為是具有相同細(xì)胞組成的點(diǎn)陣區(qū)域,或者說是近似的組織結(jié)構(gòu)區(qū)域,。廣州烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)烈冰全線實(shí)驗(yàn)平臺(tái)滿足超深度,、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復(fù)雜疾病研究的測(cè)序。
空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是在組織原位檢測(cè)全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)的?種技術(shù),,可以展?組織切?中不同區(qū)域的基因表達(dá)情況,,同時(shí)能夠得到?的基因在組織內(nèi)部的空間位置信息。與傳統(tǒng)的全基因轉(zhuǎn)錄組或單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序相?,,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序漿病理影像(H&E染?)與測(cè)序數(shù)據(jù)映射在?起,,進(jìn)?可以分析組織切內(nèi)部空間結(jié)構(gòu)的細(xì)胞異質(zhì)性。常規(guī)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)丟失了細(xì)胞在原組織中至關(guān)重要的空間位置信息,,而單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的同時(shí)保留并記錄了細(xì)胞的空間位置信息,。空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能夠揭示細(xì)胞間的相互作用以及細(xì)胞所處的微環(huán)境,,將成為發(fā)育生物學(xué),、神經(jīng)生物學(xué)、免疫生物學(xué)等領(lǐng)域的研究利器,。
烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),,針對(duì)龐大的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù),能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快、精,、準(zhǔn):一鍵導(dǎo)入genelist構(gòu)建個(gè)性化基因列表,;輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Featureplot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型,;一鍵獲得t-SNE圖,、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖、Heatmap,、Violin圖,,還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀,。平臺(tái)上線300+task自主分析工具,、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團(tuán)隊(duì)和自主分析用戶實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動(dòng)化分析,,節(jié)省您的工作時(shí)間并提升整體工作效率,。ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測(cè)序的龐大世界。
空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與單細(xì)胞測(cè)序的結(jié)果不同,,這里存在一個(gè)概念叫做NumberofSpotsundertissue,,即,空間轉(zhuǎn)錄組片子上組織覆蓋的有效的spot位點(diǎn),。這個(gè)有效Spot的篩選標(biāo)準(zhǔn)是有UMI以及有序列表達(dá),。那么這個(gè)時(shí)候,貼片的質(zhì)量就成為了制約空間轉(zhuǎn)錄組有效區(qū)域的要點(diǎn)了,。如果組織沒有很好地覆蓋到空轉(zhuǎn)片上,,那么容易出現(xiàn)雖然有HE染色有組織片子,但是沒有基因表達(dá),,即無有效Spot位點(diǎn),。同樣的,另一個(gè)就是組織切片的大小,,也就是說組織切片在整個(gè)玻片的覆蓋面積越小,,分析的有效區(qū)域就越少。這兩者基本上決定了整個(gè)空間轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的基礎(chǔ)質(zhì)量,。自主研發(fā)PanoCell單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)測(cè)序平臺(tái),。南京scRNA空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化
烈冰斥巨資引進(jìn)Novaseq6000,開啟更大通量測(cè)序新紀(jì)元,。廣州烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
一體化的結(jié)構(gòu)體系難以形成,,我國(guó)醫(yī)藥健康正處于初級(jí)發(fā)展階段,與體系健全的發(fā)達(dá)地區(qū)相比,,冷鏈物流行業(yè)呈現(xiàn)規(guī)模小且分布雜亂的現(xiàn)象,。醫(yī)藥行業(yè)上下游未整體規(guī)劃,,成為我國(guó)冷鏈物流發(fā)展的障礙,從而使得醫(yī)藥冷鏈物流流通效率低下,。以單細(xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序?yàn)槔?,主打運(yùn)動(dòng)健康A(chǔ)PP停留在工具層面,缺少完整的消費(fèi)場(chǎng)景閉環(huán),,較強(qiáng)的工具屬性停留在實(shí)現(xiàn)用戶基礎(chǔ)的功能需求,,并未涉及足夠高的用戶使用價(jià)值實(shí)現(xiàn),同時(shí)缺乏數(shù)字化運(yùn)營(yíng)的效能也是運(yùn)動(dòng)健康A(chǔ)PP發(fā)展的明顯桎梏,,經(jīng)營(yíng)模式有待進(jìn)一步探索,。醫(yī)藥健康方面人才培養(yǎng)體制貧乏,經(jīng)調(diào)查,,中國(guó)的大學(xué)中把物流管理與醫(yī)藥知識(shí)結(jié)合的專業(yè)少之又少,,單方面精通的人才對(duì)于醫(yī)藥冷鏈物流無法完全勝任,通過調(diào)研冷鏈物流企業(yè),,了解到培養(yǎng)物流人員有關(guān)冷鏈物流的相關(guān)知識(shí)來勝任冷鏈物流工作的計(jì)劃進(jìn)展緩慢,,使得人才成為完善醫(yī)藥健康的重要制約因素。醫(yī)藥健康上下游未整體規(guī)劃,,醫(yī)用物流公司十分分散,,許多下游需求店鋪及用戶因物流體系不完善而放棄該種醫(yī)藥的引入和使用。由于醫(yī)用藥保存條件要求十分高,,存儲(chǔ)倉(cāng)庫(kù)與冷藏運(yùn)輸車等的建設(shè)與運(yùn)行成本便居高不下,,使得醫(yī)藥冷鏈物流從建設(shè)到運(yùn)營(yíng)中的成本都遠(yuǎn)超于傳統(tǒng)物流成本。廣州烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司一直專注于生物科技,、醫(yī)藥科技、信息科技,、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,,市場(chǎng)營(yíng)銷策劃,市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查,、社會(huì)調(diào)研,、民意調(diào)查、民意測(cè)驗(yàn)),,從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),,計(jì)算機(jī)、軟件及耗材(除專控),,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】,是一家醫(yī)藥健康的企業(yè),,擁有自己**的技術(shù)體系,。公司目前擁有較多的高技術(shù)人才,以不斷增強(qiáng)企業(yè)重點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)力,,加快企業(yè)技術(shù)創(chuàng)新,,實(shí)現(xiàn)穩(wěn)健生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)。公司業(yè)務(wù)范圍主要包括:?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序等,。公司奉行顧客至上,、質(zhì)量為本的經(jīng)營(yíng)宗旨,深受客戶好評(píng),。公司深耕單細(xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,,正積蓄著更大的能量,向更廣闊的空間,、更寬泛的領(lǐng)域拓展,。